Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DSJ4

Protein Details
Accession C5DSJ4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-359LERTSRFSKKSTYRRRQPVFNHGGDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.333, cyto 9, cyto_mito 6.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046938  DNA_clamp_sf  
IPR016587  Rad17  
IPR003021  Rad1_Rec1_Rad17  
Gene Ontology GO:0030896  C:checkpoint clamp complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0000077  P:DNA damage checkpoint signaling  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
GO:0007131  P:reciprocal meiotic recombination  
KEGG zro:ZYRO0C00616g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02144  Rad1  
Amino Acid Sequences MRINDGKATHFSASTFHLDHITTALNCLTPFDNKQDVLIFIDEDGLSFARECNHTIRIQLFLSRDLFASYSYHNELGDQSTLCVNMNYLLNSFNVAHRNVDDALESTLSYNGPGTPLQLIFEDSLISESVEYHTYHVSSLDTIGLKLDRDQVLFECIVKGDVLYSAIKDLKEIGCRGCCIFAKIDEDGENTFALLSKSQLGFSRIKLPSSRSILEKLEVYDGDSTSLVYDKPVLGFFDFNSFDKIRQSTKVASKVLLRMDVHGLLSVNILSRTDDVILTDTRSNSNNNDNNYGNHRKQLSGEYPGIVIEVCMLEKENIDEADQEEFQLLMEINELERTSRFSKKSTYRRRQPVFNHGGDFSESSTDNLLGLTNARVEPISPQKNGDVSPRSNNNEIPLFF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.22
4 0.22
5 0.22
6 0.22
7 0.21
8 0.21
9 0.16
10 0.17
11 0.17
12 0.15
13 0.15
14 0.17
15 0.17
16 0.18
17 0.21
18 0.25
19 0.29
20 0.28
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.28
25 0.26
26 0.2
27 0.14
28 0.16
29 0.14
30 0.12
31 0.12
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.13
38 0.15
39 0.18
40 0.22
41 0.23
42 0.26
43 0.27
44 0.26
45 0.26
46 0.28
47 0.26
48 0.26
49 0.27
50 0.24
51 0.23
52 0.2
53 0.19
54 0.16
55 0.16
56 0.14
57 0.16
58 0.18
59 0.19
60 0.17
61 0.18
62 0.18
63 0.19
64 0.2
65 0.15
66 0.13
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.12
71 0.1
72 0.1
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.11
78 0.13
79 0.14
80 0.15
81 0.17
82 0.17
83 0.18
84 0.17
85 0.2
86 0.18
87 0.18
88 0.15
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.09
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.1
106 0.12
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.07
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.14
135 0.13
136 0.13
137 0.14
138 0.14
139 0.16
140 0.16
141 0.15
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.12
157 0.12
158 0.15
159 0.16
160 0.17
161 0.16
162 0.17
163 0.17
164 0.18
165 0.16
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.1
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.13
188 0.14
189 0.16
190 0.25
191 0.23
192 0.24
193 0.25
194 0.27
195 0.29
196 0.32
197 0.33
198 0.25
199 0.28
200 0.27
201 0.27
202 0.24
203 0.19
204 0.16
205 0.14
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.08
214 0.06
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.12
225 0.14
226 0.13
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.2
231 0.22
232 0.19
233 0.2
234 0.23
235 0.25
236 0.31
237 0.38
238 0.36
239 0.35
240 0.36
241 0.37
242 0.35
243 0.34
244 0.27
245 0.22
246 0.23
247 0.22
248 0.19
249 0.16
250 0.15
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.1
264 0.11
265 0.12
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.16
270 0.18
271 0.18
272 0.28
273 0.3
274 0.31
275 0.35
276 0.34
277 0.36
278 0.42
279 0.47
280 0.39
281 0.4
282 0.38
283 0.35
284 0.36
285 0.4
286 0.36
287 0.34
288 0.34
289 0.29
290 0.28
291 0.27
292 0.24
293 0.17
294 0.12
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.12
307 0.12
308 0.15
309 0.15
310 0.13
311 0.11
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.14
325 0.18
326 0.26
327 0.28
328 0.3
329 0.39
330 0.49
331 0.59
332 0.66
333 0.72
334 0.75
335 0.84
336 0.88
337 0.88
338 0.85
339 0.85
340 0.83
341 0.76
342 0.69
343 0.59
344 0.54
345 0.46
346 0.39
347 0.29
348 0.22
349 0.18
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.13
354 0.12
355 0.11
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.11
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.18
365 0.28
366 0.33
367 0.32
368 0.34
369 0.37
370 0.41
371 0.42
372 0.44
373 0.41
374 0.4
375 0.48
376 0.54
377 0.56
378 0.57
379 0.57
380 0.54