Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DPU8

Protein Details
Accession C5DPU8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-70HFNRRRSSHHHGKPKVKHTKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-70RRRSSHHHGKPKVKHTKP
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10.5, cyto 8, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031456  Caf20  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005845  C:mRNA cap binding complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0017148  P:negative regulation of translation  
KEGG zro:ZYRO0A06248g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17052  CAF20  
Amino Acid Sequences MVRYTIEELLQLKPSEALTPNFDAVEFRAMIEKVKHLQALKEEEFGHFGHFNRRRSSHHHGKPKVKHTKPKVTIDSDGWSTFEANKKGSGDEEEQEKPARESAPQPTIAQETIKVKPNNKNISSTKPADAKDIVADKPIQSFNAFAALESEEEDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.22
4 0.22
5 0.22
6 0.24
7 0.25
8 0.23
9 0.23
10 0.2
11 0.18
12 0.19
13 0.14
14 0.12
15 0.14
16 0.14
17 0.17
18 0.17
19 0.2
20 0.19
21 0.21
22 0.24
23 0.22
24 0.24
25 0.27
26 0.34
27 0.31
28 0.32
29 0.3
30 0.27
31 0.28
32 0.26
33 0.23
34 0.17
35 0.17
36 0.24
37 0.3
38 0.33
39 0.37
40 0.4
41 0.4
42 0.47
43 0.56
44 0.56
45 0.59
46 0.65
47 0.68
48 0.75
49 0.79
50 0.81
51 0.82
52 0.78
53 0.79
54 0.77
55 0.8
56 0.77
57 0.77
58 0.72
59 0.65
60 0.6
61 0.53
62 0.46
63 0.37
64 0.3
65 0.22
66 0.17
67 0.13
68 0.13
69 0.15
70 0.15
71 0.14
72 0.15
73 0.15
74 0.15
75 0.16
76 0.17
77 0.15
78 0.15
79 0.19
80 0.19
81 0.2
82 0.21
83 0.21
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.13
88 0.16
89 0.21
90 0.24
91 0.25
92 0.25
93 0.25
94 0.26
95 0.26
96 0.22
97 0.19
98 0.19
99 0.21
100 0.29
101 0.31
102 0.35
103 0.42
104 0.52
105 0.58
106 0.55
107 0.6
108 0.56
109 0.61
110 0.62
111 0.57
112 0.53
113 0.49
114 0.47
115 0.44
116 0.4
117 0.33
118 0.32
119 0.32
120 0.27
121 0.24
122 0.25
123 0.21
124 0.25
125 0.25
126 0.21
127 0.18
128 0.18
129 0.16
130 0.21
131 0.2
132 0.16
133 0.17
134 0.16
135 0.15
136 0.16