Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DYM5

Protein Details
Accession C5DYM5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-113VDIIRQQQQKQQKQQKQDALDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR007810  Pep3_Vps18  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0098588  C:bounding membrane of organelle  
GO:0005768  C:endosome  
GO:0099023  C:vesicle tethering complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG zro:ZYRO0F14234g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00637  Clathrin  
PF05131  Pep3_Vps18  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
CDD cd16462  RING-H2_Pep3p-like  
Amino Acid Sequences MNVEIEHVQLELIKEIQNNICSLRVQSNQLCFALKSGLLFLIDLDVPSDVSRCQVPLISSGNSVEKLITMWMSPNGKLLLLKTNFARYYLCNVDIIRQQQQKQQKQQKQDALDGIHTLKKLGKKGSDVKFVEWFENDRFLCGDASGQVLDVEINDKHGKQRSDAEVHVVCQSNKPIDGIFWNSTTEKIIIVSGNKIMLWDNVKSLRHLREPSEIEQFEHLPRDNGNRFTSFQETETFSWVTKPGVVFGKLGGNQNILNNAKVLLTVELPESTHDIKDIILTEFHIVLLRGATILIINQLNNAVVFEESIWTQKSEKMIGLTADYSQNPPTFWCFSSSNIYEIILHDEAKAVWRLMCEQREYDRALQLKGLTGWERENIYYKKGLHLLKDQSEPLKAAESLGEADCVSVGSVALQFMQPPGDIEPLQIYLTSKLNKLDSKNQMQRILLSSWVVWNYMRQLNEIEEEINGERHLDDVKHLNDQKHLLGTQLHVFLKSHLDCLDKKTVYQIISKQNRDQDLLYFGKLVKDYEFVLSHWIRQANWFEALNVLLTMQDPESAYTYASVLLVNAPEETIHVWMKMTNLNPVELIPSLLTYFTSYQRQARKNKRNYALVYLNWCVDEHEYEDPILYNTALYMLITDNDEDNEHHGLRVIEFLDSHRDKYDSNFVLRLSIKFHKVRVSIYLYTQLKLYKDAVDLALSRQMIDAAKQVVETSELDSNVKLKKSLWREIAKAMLYRDNGNQDIKHTVRCIISESHELLEIKDLLPLLDEFTTIANLKDELIRSLEKHGQSMSRISTQIQQSLRMKKDIAVEIETFKERYRTLEPGISCSSCEKLLQTRKFLVFPCGHCFHTDCLIKAILNSNDYNFKSLIVNFQRRLAKDRNSVKPQELELIITRKCCLCSDININTIDDYINIDENEAAKWEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.19
3 0.23
4 0.24
5 0.24
6 0.24
7 0.25
8 0.24
9 0.26
10 0.29
11 0.29
12 0.34
13 0.38
14 0.42
15 0.44
16 0.44
17 0.43
18 0.36
19 0.34
20 0.29
21 0.24
22 0.19
23 0.16
24 0.16
25 0.15
26 0.14
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.08
37 0.09
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.14
42 0.15
43 0.19
44 0.24
45 0.23
46 0.24
47 0.25
48 0.27
49 0.25
50 0.24
51 0.19
52 0.15
53 0.14
54 0.14
55 0.12
56 0.1
57 0.11
58 0.17
59 0.2
60 0.2
61 0.23
62 0.22
63 0.23
64 0.23
65 0.23
66 0.27
67 0.26
68 0.29
69 0.28
70 0.35
71 0.34
72 0.35
73 0.35
74 0.28
75 0.34
76 0.35
77 0.33
78 0.28
79 0.28
80 0.32
81 0.35
82 0.37
83 0.39
84 0.41
85 0.43
86 0.48
87 0.58
88 0.63
89 0.68
90 0.75
91 0.74
92 0.77
93 0.84
94 0.84
95 0.79
96 0.75
97 0.69
98 0.61
99 0.55
100 0.47
101 0.4
102 0.35
103 0.3
104 0.25
105 0.24
106 0.26
107 0.3
108 0.34
109 0.36
110 0.41
111 0.51
112 0.57
113 0.63
114 0.6
115 0.57
116 0.58
117 0.55
118 0.5
119 0.42
120 0.38
121 0.3
122 0.35
123 0.32
124 0.26
125 0.25
126 0.23
127 0.22
128 0.18
129 0.17
130 0.1
131 0.12
132 0.1
133 0.1
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.09
139 0.07
140 0.12
141 0.13
142 0.14
143 0.2
144 0.27
145 0.28
146 0.29
147 0.37
148 0.4
149 0.43
150 0.43
151 0.45
152 0.39
153 0.39
154 0.4
155 0.36
156 0.29
157 0.27
158 0.3
159 0.25
160 0.24
161 0.24
162 0.19
163 0.18
164 0.21
165 0.23
166 0.22
167 0.2
168 0.22
169 0.22
170 0.22
171 0.23
172 0.2
173 0.14
174 0.12
175 0.13
176 0.12
177 0.13
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.14
185 0.16
186 0.15
187 0.18
188 0.22
189 0.23
190 0.26
191 0.31
192 0.34
193 0.37
194 0.4
195 0.39
196 0.43
197 0.46
198 0.47
199 0.5
200 0.45
201 0.39
202 0.38
203 0.37
204 0.3
205 0.29
206 0.26
207 0.18
208 0.2
209 0.27
210 0.29
211 0.31
212 0.33
213 0.32
214 0.33
215 0.35
216 0.39
217 0.32
218 0.28
219 0.27
220 0.28
221 0.26
222 0.28
223 0.25
224 0.2
225 0.2
226 0.2
227 0.17
228 0.15
229 0.14
230 0.14
231 0.18
232 0.19
233 0.17
234 0.17
235 0.23
236 0.23
237 0.26
238 0.23
239 0.21
240 0.21
241 0.21
242 0.26
243 0.22
244 0.19
245 0.16
246 0.16
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.1
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.1
299 0.12
300 0.14
301 0.14
302 0.15
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.14
308 0.13
309 0.14
310 0.13
311 0.13
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.14
316 0.16
317 0.17
318 0.17
319 0.2
320 0.19
321 0.21
322 0.27
323 0.27
324 0.24
325 0.22
326 0.22
327 0.18
328 0.17
329 0.19
330 0.13
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.13
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.13
341 0.18
342 0.2
343 0.2
344 0.22
345 0.24
346 0.27
347 0.3
348 0.28
349 0.27
350 0.26
351 0.25
352 0.24
353 0.21
354 0.19
355 0.16
356 0.16
357 0.13
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.2
364 0.19
365 0.2
366 0.23
367 0.22
368 0.23
369 0.28
370 0.29
371 0.25
372 0.31
373 0.34
374 0.34
375 0.35
376 0.34
377 0.29
378 0.29
379 0.26
380 0.2
381 0.17
382 0.13
383 0.11
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.11
417 0.12
418 0.13
419 0.14
420 0.17
421 0.19
422 0.22
423 0.29
424 0.33
425 0.41
426 0.46
427 0.49
428 0.49
429 0.46
430 0.44
431 0.38
432 0.32
433 0.23
434 0.17
435 0.13
436 0.11
437 0.12
438 0.11
439 0.08
440 0.07
441 0.1
442 0.13
443 0.13
444 0.12
445 0.13
446 0.13
447 0.14
448 0.14
449 0.11
450 0.08
451 0.09
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.06
456 0.05
457 0.06
458 0.07
459 0.05
460 0.07
461 0.11
462 0.12
463 0.18
464 0.21
465 0.21
466 0.23
467 0.24
468 0.24
469 0.2
470 0.19
471 0.15
472 0.13
473 0.13
474 0.13
475 0.15
476 0.15
477 0.13
478 0.14
479 0.13
480 0.18
481 0.17
482 0.15
483 0.13
484 0.16
485 0.16
486 0.2
487 0.27
488 0.22
489 0.22
490 0.24
491 0.26
492 0.25
493 0.28
494 0.29
495 0.32
496 0.4
497 0.42
498 0.43
499 0.43
500 0.44
501 0.42
502 0.36
503 0.28
504 0.26
505 0.24
506 0.21
507 0.17
508 0.16
509 0.16
510 0.16
511 0.15
512 0.1
513 0.1
514 0.11
515 0.12
516 0.12
517 0.11
518 0.17
519 0.16
520 0.16
521 0.18
522 0.18
523 0.16
524 0.19
525 0.22
526 0.18
527 0.2
528 0.19
529 0.16
530 0.15
531 0.15
532 0.12
533 0.09
534 0.07
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.08
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.04
557 0.05
558 0.05
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.08
564 0.1
565 0.13
566 0.13
567 0.16
568 0.16
569 0.16
570 0.17
571 0.16
572 0.16
573 0.13
574 0.13
575 0.07
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.07
581 0.09
582 0.11
583 0.15
584 0.17
585 0.22
586 0.31
587 0.39
588 0.47
589 0.57
590 0.65
591 0.71
592 0.78
593 0.79
594 0.79
595 0.74
596 0.72
597 0.66
598 0.57
599 0.52
600 0.44
601 0.37
602 0.29
603 0.27
604 0.2
605 0.15
606 0.14
607 0.12
608 0.12
609 0.12
610 0.12
611 0.12
612 0.12
613 0.11
614 0.1
615 0.08
616 0.06
617 0.05
618 0.06
619 0.05
620 0.05
621 0.05
622 0.05
623 0.06
624 0.06
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.08
629 0.08
630 0.1
631 0.12
632 0.12
633 0.11
634 0.13
635 0.13
636 0.12
637 0.14
638 0.12
639 0.09
640 0.1
641 0.11
642 0.18
643 0.19
644 0.2
645 0.19
646 0.2
647 0.2
648 0.24
649 0.32
650 0.26
651 0.27
652 0.28
653 0.27
654 0.31
655 0.32
656 0.29
657 0.25
658 0.26
659 0.31
660 0.31
661 0.34
662 0.35
663 0.36
664 0.36
665 0.37
666 0.39
667 0.33
668 0.33
669 0.4
670 0.34
671 0.33
672 0.33
673 0.29
674 0.23
675 0.24
676 0.24
677 0.18
678 0.17
679 0.19
680 0.18
681 0.17
682 0.17
683 0.15
684 0.18
685 0.15
686 0.14
687 0.13
688 0.14
689 0.12
690 0.13
691 0.14
692 0.12
693 0.12
694 0.12
695 0.12
696 0.11
697 0.12
698 0.12
699 0.12
700 0.13
701 0.13
702 0.14
703 0.14
704 0.17
705 0.19
706 0.2
707 0.18
708 0.17
709 0.25
710 0.32
711 0.4
712 0.45
713 0.47
714 0.49
715 0.52
716 0.55
717 0.49
718 0.45
719 0.39
720 0.36
721 0.32
722 0.31
723 0.31
724 0.31
725 0.31
726 0.31
727 0.29
728 0.26
729 0.32
730 0.31
731 0.31
732 0.27
733 0.28
734 0.26
735 0.27
736 0.28
737 0.23
738 0.26
739 0.27
740 0.28
741 0.24
742 0.27
743 0.26
744 0.23
745 0.23
746 0.2
747 0.16
748 0.15
749 0.15
750 0.11
751 0.12
752 0.12
753 0.1
754 0.09
755 0.09
756 0.08
757 0.09
758 0.11
759 0.1
760 0.1
761 0.09
762 0.09
763 0.1
764 0.13
765 0.13
766 0.13
767 0.16
768 0.18
769 0.18
770 0.24
771 0.29
772 0.27
773 0.28
774 0.29
775 0.29
776 0.29
777 0.33
778 0.31
779 0.28
780 0.28
781 0.28
782 0.32
783 0.33
784 0.37
785 0.34
786 0.38
787 0.41
788 0.49
789 0.51
790 0.47
791 0.45
792 0.42
793 0.48
794 0.45
795 0.42
796 0.36
797 0.35
798 0.34
799 0.36
800 0.35
801 0.28
802 0.24
803 0.24
804 0.21
805 0.24
806 0.27
807 0.29
808 0.31
809 0.37
810 0.36
811 0.38
812 0.43
813 0.38
814 0.34
815 0.31
816 0.29
817 0.24
818 0.24
819 0.21
820 0.26
821 0.36
822 0.42
823 0.46
824 0.51
825 0.53
826 0.56
827 0.54
828 0.52
829 0.49
830 0.46
831 0.48
832 0.44
833 0.42
834 0.4
835 0.41
836 0.36
837 0.38
838 0.38
839 0.31
840 0.31
841 0.32
842 0.3
843 0.29
844 0.34
845 0.28
846 0.28
847 0.28
848 0.27
849 0.34
850 0.34
851 0.35
852 0.28
853 0.26
854 0.25
855 0.25
856 0.32
857 0.34
858 0.42
859 0.41
860 0.48
861 0.53
862 0.53
863 0.59
864 0.57
865 0.56
866 0.58
867 0.66
868 0.69
869 0.71
870 0.74
871 0.73
872 0.69
873 0.62
874 0.59
875 0.5
876 0.43
877 0.4
878 0.41
879 0.38
880 0.34
881 0.34
882 0.3
883 0.31
884 0.29
885 0.28
886 0.25
887 0.31
888 0.39
889 0.42
890 0.44
891 0.44
892 0.43
893 0.39
894 0.35
895 0.28
896 0.19
897 0.16
898 0.14
899 0.15
900 0.14
901 0.15
902 0.16
903 0.16
904 0.16