FuNGI

C5DSX0

Protein Details

Accession

C5DSX0

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
410-431	IEQWRINKEKRRQQALNNNMAP	Hydrophilic
480-520	QGNPKNKPGLDKTKQKRPRKTTKKEEPAKKKRPTKKRQDEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
484-516	KNKPGLDKTKQKRPRKTTKKEEPAKKKRPTKKR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
KEGG	zro:ZYRO0C03630g -
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MNGMGIPVNRAAQRPMNPQVLKQQQQQQLQQQQQQRQRMLLQQRAIQQQKHQQALQNYESQFYQLLLTLNKKPKRIYNFTEDTDSTLKKYEQYRPSFEFHIYENNYKICAPANTRLQQQQKTPELTSDGLILNKNNSILKEFLEYVARGHIPASIMEVLRDSNIQFYEGNLILQVYDHTNTVDVAPKTNPQQPIDKNKDPRKLRPTSFKRPRVYRTLLKPNDLTHYYDMMSYADHTRFSDSIYQQLESEVLSLTKRNLALDVPLDPYEHRDKLEDELFATPKWDENTKTLKHIHRELSAKEGTKGAVGHIEEHEEFPQHSSNYEQLMLIMSERTTTSTNDTYAASLASAQTNNTSKMSAHSNSPSVSGNVDSRGSSNTGNQMAISAAAAAAAAGLTVGNENNQFSRLKFIEQWRINKEKRRQQALNNNMAPTAYNTRISMAAPMTPQQQMLQQQQQHNPQQVQQQMAMQQQMQASMVDAQGNPKNKPGLDKTKQKRPRKTTKKEEPAKKKRPTKKRQDEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.47
3	0.53
4	0.52
5	0.54
6	0.59
7	0.62
8	0.62
9	0.62
10	0.64
11	0.62
12	0.69
13	0.73
14	0.73
15	0.73
16	0.74
17	0.74
18	0.73
19	0.74
20	0.75
21	0.76
22	0.69
23	0.63
24	0.6
25	0.62
26	0.63
27	0.61
28	0.57
29	0.54
30	0.58
31	0.64
32	0.65
33	0.6
34	0.58
35	0.6
36	0.63
37	0.64
38	0.59
39	0.56
40	0.57
41	0.61
42	0.57
43	0.54
44	0.47
45	0.42
46	0.39
47	0.34
48	0.28
49	0.21
50	0.17
51	0.12
52	0.14
53	0.16
54	0.21
55	0.28
56	0.37
57	0.41
58	0.45
59	0.47
60	0.53
61	0.59
62	0.63
63	0.61
64	0.62
65	0.64
66	0.62
67	0.64
68	0.56
69	0.51
70	0.46
71	0.41
72	0.32
73	0.29
74	0.27
75	0.26
76	0.33
77	0.38
78	0.43
79	0.48
80	0.54
81	0.55
82	0.58
83	0.55
84	0.51
85	0.43
86	0.35
87	0.38
88	0.35
89	0.34
90	0.34
91	0.32
92	0.31
93	0.29
94	0.28
95	0.22
96	0.22
97	0.23
98	0.27
99	0.35
100	0.38
101	0.42
102	0.5
103	0.55
104	0.55
105	0.56
106	0.57
107	0.55
108	0.55
109	0.52
110	0.46
111	0.41
112	0.38
113	0.32
114	0.26
115	0.2
116	0.18
117	0.18
118	0.17
119	0.15
120	0.15
121	0.16
122	0.15
123	0.14
124	0.15
125	0.15
126	0.16
127	0.17
128	0.17
129	0.16
130	0.18
131	0.17
132	0.15
133	0.18
134	0.16
135	0.13
136	0.13
137	0.13
138	0.11
139	0.11
140	0.13
141	0.12
142	0.12
143	0.12
144	0.12
145	0.11
146	0.11
147	0.11
148	0.08
149	0.09
150	0.09
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.14
155	0.13
156	0.13
157	0.1
158	0.1
159	0.08
160	0.08
161	0.09
162	0.06
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.08
167	0.08
168	0.09
169	0.14
170	0.13
171	0.14
172	0.15
173	0.18
174	0.21
175	0.26
176	0.29
177	0.25
178	0.33
179	0.38
180	0.47
181	0.53
182	0.57
183	0.62
184	0.66
185	0.73
186	0.7
187	0.73
188	0.72
189	0.71
190	0.69
191	0.71
192	0.71
193	0.74
194	0.79
195	0.79
196	0.78
197	0.77
198	0.76
199	0.74
200	0.72
201	0.68
202	0.66
203	0.68
204	0.63
205	0.59
206	0.55
207	0.48
208	0.46
209	0.4
210	0.34
211	0.25
212	0.24
213	0.21
214	0.19
215	0.18
216	0.13
217	0.11
218	0.09
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.12
224	0.11
225	0.13
226	0.18
227	0.15
228	0.2
229	0.21
230	0.21
231	0.19
232	0.19
233	0.18
234	0.11
235	0.11
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.06
240	0.06
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.09
245	0.08
246	0.09
247	0.09
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.13
254	0.16
255	0.16
256	0.15
257	0.15
258	0.16
259	0.19
260	0.21
261	0.17
262	0.14
263	0.16
264	0.16
265	0.15
266	0.15
267	0.11
268	0.11
269	0.12
270	0.13
271	0.13
272	0.17
273	0.25
274	0.25
275	0.29
276	0.34
277	0.37
278	0.4
279	0.44
280	0.43
281	0.41
282	0.44
283	0.4
284	0.39
285	0.38
286	0.34
287	0.29
288	0.26
289	0.21
290	0.18
291	0.18
292	0.12
293	0.12
294	0.11
295	0.12
296	0.11
297	0.14
298	0.13
299	0.14
300	0.14
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.14
305	0.11
306	0.11
307	0.12
308	0.13
309	0.14
310	0.15
311	0.13
312	0.1
313	0.11
314	0.1
315	0.09
316	0.08
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.08
321	0.08
322	0.09
323	0.14
324	0.15
325	0.16
326	0.16
327	0.16
328	0.15
329	0.14
330	0.13
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.11
338	0.13
339	0.15
340	0.15
341	0.15
342	0.14
343	0.16
344	0.21
345	0.19
346	0.21
347	0.22
348	0.24
349	0.24
350	0.25
351	0.24
352	0.19
353	0.18
354	0.16
355	0.14
356	0.14
357	0.15
358	0.13
359	0.13
360	0.14
361	0.15
362	0.14
363	0.15
364	0.18
365	0.19
366	0.18
367	0.17
368	0.16
369	0.14
370	0.13
371	0.11
372	0.06
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.03
377	0.03
378	0.02
379	0.02
380	0.02
381	0.02
382	0.02
383	0.03
384	0.03
385	0.05
386	0.06
387	0.07
388	0.08
389	0.1
390	0.11
391	0.11
392	0.18
393	0.18
394	0.21
395	0.26
396	0.33
397	0.42
398	0.47
399	0.55
400	0.55
401	0.63
402	0.66
403	0.69
404	0.72
405	0.71
406	0.74
407	0.77
408	0.75
409	0.76
410	0.81
411	0.81
412	0.81
413	0.75
414	0.66
415	0.56
416	0.5
417	0.4
418	0.34
419	0.31
420	0.23
421	0.21
422	0.21
423	0.22
424	0.23
425	0.23
426	0.22
427	0.17
428	0.17
429	0.16
430	0.18
431	0.2
432	0.2
433	0.2
434	0.18
435	0.22
436	0.26
437	0.32
438	0.38
439	0.42
440	0.48
441	0.55
442	0.63
443	0.65
444	0.65
445	0.6
446	0.56
447	0.57
448	0.54
449	0.5
450	0.43
451	0.39
452	0.37
453	0.38
454	0.36
455	0.29
456	0.28
457	0.25
458	0.24
459	0.21
460	0.17
461	0.14
462	0.14
463	0.14
464	0.13
465	0.13
466	0.18
467	0.23
468	0.28
469	0.27
470	0.3
471	0.34
472	0.33
473	0.41
474	0.45
475	0.5
476	0.55
477	0.65
478	0.69
479	0.75
480	0.84
481	0.87
482	0.88
483	0.88
484	0.9
485	0.91
486	0.93
487	0.93
488	0.94
489	0.95
490	0.95
491	0.95
492	0.95
493	0.95
494	0.95
495	0.94
496	0.93
497	0.93
498	0.93
499	0.93
500	0.93

C5DSX0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer