Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C5DVA0

Protein Details
Accession C5DVA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
344-370MTPKDKQKYTSLRKRQQRQLQSQPQPPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR021850  Symplekin/Pta1  
IPR032460  Symplekin/Pta1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG zro:ZYRO0D05038g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11935  SYMPK_PTA1_N  
Amino Acid Sequences MAFPEVEQLQQARRLAMENNPNELLPKVLETSGSLYLSQGTSYALKLELSRFFSQLLLQILSDCDFPTSEKPFVAQQQLRCLWSIIRSIRDGTAYKYSVLSLSAAYPLLFDLVAKTSNKETWELMQQMKSFIVQRWNTPFPETPIANENDMFADDAKSMGVRLATAKFIAEIVIVHTSRSSSSPNDVISISSVPEGHPVISNKQQIESEAKKFLDVLLNYLVEEPIMVAPLFSGILNCLAFVMRHRPQATMRILGALLNFNVDAKFQQEGTSILNYRLSKRFVERSYKNFVQFGLKSQLIKNHGSMAPLHARLSKISKTLHVIGEETRSKGVLNFDESQFDNKMTPKDKQKYTSLRKRQQRQLQSQPQPPTQQQLPQQIQPQRGSASNSPAPNSTPQLVQEALQQQPEQVPNDIQLLSHLQKYTMSKNTPNFFNGSPIAIDNSYCAIYSLMNSNNSGQDVSKLSQEVMVKLCSEAFYNTDTTKLISGLSIVASRYTDLINKSTQSRTGVEQSSDASGSRKRKSEQDSPPSKRLKNEEPHDQDDEDREDAIPLELTQSASLTEDEKMRHVQGIVQRIVAIKDSDENPGVAGMLGHDTDPLMKIKLLQWNQNSWLHLLTRLATRGLTHNPAMCDLIREWLQEQFLQDISNRIGMVLEWLSEEWYAETLVGATSYETYNKWSLSVLNSLVPFLENQHRRLFIRLMSELPRITQAHIDTVRPICLDPARASLGFQTLKFLVMFRPPVKPKVHSLLLQLKSEDPTTSQNVDSIISKFYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.32
4 0.38
5 0.36
6 0.4
7 0.4
8 0.39
9 0.38
10 0.35
11 0.29
12 0.2
13 0.19
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.19
19 0.21
20 0.21
21 0.18
22 0.16
23 0.18
24 0.18
25 0.16
26 0.13
27 0.11
28 0.11
29 0.12
30 0.13
31 0.11
32 0.12
33 0.14
34 0.18
35 0.22
36 0.27
37 0.29
38 0.28
39 0.28
40 0.28
41 0.27
42 0.27
43 0.25
44 0.2
45 0.17
46 0.17
47 0.18
48 0.18
49 0.17
50 0.13
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.18
55 0.22
56 0.23
57 0.22
58 0.24
59 0.28
60 0.33
61 0.41
62 0.4
63 0.39
64 0.47
65 0.5
66 0.5
67 0.46
68 0.41
69 0.33
70 0.32
71 0.36
72 0.31
73 0.31
74 0.32
75 0.33
76 0.33
77 0.36
78 0.33
79 0.3
80 0.33
81 0.3
82 0.29
83 0.27
84 0.26
85 0.22
86 0.22
87 0.18
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.12
101 0.13
102 0.15
103 0.18
104 0.21
105 0.22
106 0.23
107 0.23
108 0.23
109 0.3
110 0.32
111 0.33
112 0.35
113 0.34
114 0.33
115 0.32
116 0.3
117 0.25
118 0.24
119 0.3
120 0.27
121 0.32
122 0.39
123 0.42
124 0.42
125 0.44
126 0.43
127 0.39
128 0.44
129 0.38
130 0.33
131 0.35
132 0.36
133 0.33
134 0.3
135 0.26
136 0.19
137 0.19
138 0.17
139 0.12
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.08
158 0.06
159 0.07
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.15
167 0.16
168 0.13
169 0.17
170 0.2
171 0.2
172 0.22
173 0.21
174 0.19
175 0.18
176 0.17
177 0.13
178 0.11
179 0.11
180 0.09
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.14
185 0.16
186 0.19
187 0.26
188 0.3
189 0.28
190 0.3
191 0.3
192 0.28
193 0.34
194 0.35
195 0.32
196 0.32
197 0.32
198 0.3
199 0.3
200 0.29
201 0.27
202 0.22
203 0.21
204 0.18
205 0.19
206 0.19
207 0.19
208 0.17
209 0.1
210 0.1
211 0.07
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.16
230 0.17
231 0.24
232 0.25
233 0.27
234 0.29
235 0.37
236 0.38
237 0.34
238 0.3
239 0.26
240 0.25
241 0.23
242 0.22
243 0.15
244 0.11
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.12
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.19
262 0.19
263 0.22
264 0.25
265 0.26
266 0.24
267 0.28
268 0.35
269 0.36
270 0.45
271 0.46
272 0.47
273 0.53
274 0.55
275 0.52
276 0.45
277 0.41
278 0.38
279 0.33
280 0.32
281 0.29
282 0.26
283 0.25
284 0.26
285 0.3
286 0.28
287 0.29
288 0.25
289 0.25
290 0.24
291 0.24
292 0.23
293 0.22
294 0.22
295 0.21
296 0.22
297 0.18
298 0.18
299 0.19
300 0.23
301 0.21
302 0.2
303 0.2
304 0.22
305 0.24
306 0.27
307 0.27
308 0.23
309 0.22
310 0.19
311 0.24
312 0.23
313 0.2
314 0.17
315 0.15
316 0.14
317 0.15
318 0.17
319 0.12
320 0.16
321 0.17
322 0.17
323 0.19
324 0.2
325 0.21
326 0.19
327 0.17
328 0.15
329 0.14
330 0.19
331 0.19
332 0.24
333 0.31
334 0.38
335 0.42
336 0.44
337 0.51
338 0.57
339 0.65
340 0.7
341 0.71
342 0.73
343 0.78
344 0.83
345 0.83
346 0.82
347 0.81
348 0.8
349 0.8
350 0.81
351 0.8
352 0.78
353 0.73
354 0.68
355 0.61
356 0.53
357 0.46
358 0.38
359 0.35
360 0.33
361 0.38
362 0.37
363 0.36
364 0.42
365 0.42
366 0.44
367 0.4
368 0.36
369 0.28
370 0.27
371 0.28
372 0.23
373 0.24
374 0.24
375 0.23
376 0.23
377 0.22
378 0.22
379 0.2
380 0.21
381 0.16
382 0.13
383 0.13
384 0.14
385 0.14
386 0.13
387 0.15
388 0.16
389 0.16
390 0.16
391 0.16
392 0.14
393 0.16
394 0.18
395 0.15
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.1
402 0.09
403 0.12
404 0.12
405 0.14
406 0.13
407 0.11
408 0.14
409 0.17
410 0.21
411 0.23
412 0.24
413 0.28
414 0.33
415 0.37
416 0.36
417 0.35
418 0.33
419 0.27
420 0.28
421 0.23
422 0.18
423 0.15
424 0.13
425 0.13
426 0.11
427 0.1
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.1
437 0.11
438 0.12
439 0.13
440 0.14
441 0.14
442 0.14
443 0.14
444 0.1
445 0.1
446 0.12
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.15
452 0.15
453 0.15
454 0.14
455 0.14
456 0.13
457 0.13
458 0.13
459 0.1
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.09
464 0.11
465 0.11
466 0.12
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.09
472 0.07
473 0.07
474 0.06
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.1
484 0.11
485 0.13
486 0.14
487 0.16
488 0.19
489 0.19
490 0.21
491 0.22
492 0.22
493 0.22
494 0.27
495 0.27
496 0.25
497 0.24
498 0.22
499 0.21
500 0.19
501 0.17
502 0.13
503 0.17
504 0.23
505 0.26
506 0.3
507 0.31
508 0.39
509 0.46
510 0.54
511 0.58
512 0.62
513 0.69
514 0.71
515 0.77
516 0.77
517 0.72
518 0.67
519 0.64
520 0.62
521 0.61
522 0.6
523 0.63
524 0.62
525 0.64
526 0.62
527 0.56
528 0.47
529 0.41
530 0.38
531 0.28
532 0.22
533 0.17
534 0.14
535 0.14
536 0.13
537 0.1
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.08
546 0.09
547 0.08
548 0.09
549 0.12
550 0.13
551 0.15
552 0.17
553 0.16
554 0.17
555 0.16
556 0.19
557 0.21
558 0.29
559 0.27
560 0.25
561 0.25
562 0.25
563 0.25
564 0.22
565 0.18
566 0.1
567 0.13
568 0.14
569 0.16
570 0.16
571 0.15
572 0.14
573 0.13
574 0.13
575 0.09
576 0.08
577 0.05
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.08
585 0.09
586 0.09
587 0.09
588 0.11
589 0.15
590 0.24
591 0.27
592 0.33
593 0.36
594 0.4
595 0.44
596 0.46
597 0.43
598 0.35
599 0.34
600 0.27
601 0.25
602 0.22
603 0.19
604 0.19
605 0.19
606 0.18
607 0.16
608 0.17
609 0.2
610 0.23
611 0.25
612 0.24
613 0.26
614 0.27
615 0.28
616 0.28
617 0.24
618 0.22
619 0.18
620 0.21
621 0.19
622 0.19
623 0.19
624 0.2
625 0.21
626 0.19
627 0.2
628 0.17
629 0.16
630 0.16
631 0.16
632 0.16
633 0.16
634 0.17
635 0.15
636 0.13
637 0.13
638 0.12
639 0.14
640 0.11
641 0.1
642 0.09
643 0.09
644 0.1
645 0.1
646 0.11
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.07
651 0.07
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.05
656 0.05
657 0.06
658 0.07
659 0.09
660 0.09
661 0.14
662 0.16
663 0.16
664 0.17
665 0.16
666 0.18
667 0.19
668 0.23
669 0.21
670 0.22
671 0.22
672 0.21
673 0.21
674 0.19
675 0.16
676 0.16
677 0.24
678 0.25
679 0.28
680 0.33
681 0.37
682 0.38
683 0.43
684 0.42
685 0.36
686 0.38
687 0.37
688 0.36
689 0.37
690 0.39
691 0.35
692 0.33
693 0.35
694 0.29
695 0.28
696 0.29
697 0.26
698 0.3
699 0.32
700 0.32
701 0.31
702 0.32
703 0.33
704 0.28
705 0.27
706 0.23
707 0.24
708 0.27
709 0.24
710 0.26
711 0.29
712 0.28
713 0.29
714 0.26
715 0.3
716 0.28
717 0.26
718 0.26
719 0.22
720 0.24
721 0.23
722 0.22
723 0.19
724 0.23
725 0.3
726 0.28
727 0.38
728 0.41
729 0.48
730 0.53
731 0.54
732 0.55
733 0.56
734 0.6
735 0.53
736 0.57
737 0.59
738 0.58
739 0.57
740 0.51
741 0.45
742 0.41
743 0.39
744 0.32
745 0.25
746 0.26
747 0.28
748 0.3
749 0.28
750 0.26
751 0.26
752 0.27
753 0.27
754 0.22