Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DVA0

Protein Details
Accession C5DVA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
344-370MTPKDKQKYTSLRKRQQRQLQSQPQPPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR021850  Symplekin/Pta1  
IPR032460  Symplekin/Pta1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG zro:ZYRO0D05038g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11935  SYMPK_PTA1_N  
Amino Acid Sequences MAFPEVEQLQQARRLAMENNPNELLPKVLETSGSLYLSQGTSYALKLELSRFFSQLLLQILSDCDFPTSEKPFVAQQQLRCLWSIIRSIRDGTAYKYSVLSLSAAYPLLFDLVAKTSNKETWELMQQMKSFIVQRWNTPFPETPIANENDMFADDAKSMGVRLATAKFIAEIVIVHTSRSSSSPNDVISISSVPEGHPVISNKQQIESEAKKFLDVLLNYLVEEPIMVAPLFSGILNCLAFVMRHRPQATMRILGALLNFNVDAKFQQEGTSILNYRLSKRFVERSYKNFVQFGLKSQLIKNHGSMAPLHARLSKISKTLHVIGEETRSKGVLNFDESQFDNKMTPKDKQKYTSLRKRQQRQLQSQPQPPTQQQLPQQIQPQRGSASNSPAPNSTPQLVQEALQQQPEQVPNDIQLLSHLQKYTMSKNTPNFFNGSPIAIDNSYCAIYSLMNSNNSGQDVSKLSQEVMVKLCSEAFYNTDTTKLISGLSIVASRYTDLINKSTQSRTGVEQSSDASGSRKRKSEQDSPPSKRLKNEEPHDQDDEDREDAIPLELTQSASLTEDEKMRHVQGIVQRIVAIKDSDENPGVAGMLGHDTDPLMKIKLLQWNQNSWLHLLTRLATRGLTHNPAMCDLIREWLQEQFLQDISNRIGMVLEWLSEEWYAETLVGATSYETYNKWSLSVLNSLVPFLENQHRRLFIRLMSELPRITQAHIDTVRPICLDPARASLGFQTLKFLVMFRPPVKPKVHSLLLQLKSEDPTTSQNVDSIISKFYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.32
4 0.38
5 0.36
6 0.4
7 0.4
8 0.39
9 0.38
10 0.35
11 0.29
12 0.2
13 0.19
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.19
19 0.21
20 0.21
21 0.18
22 0.16
23 0.18
24 0.18
25 0.16
26 0.13
27 0.11
28 0.11
29 0.12
30 0.13
31 0.11
32 0.12
33 0.14
34 0.18
35 0.22
36 0.27
37 0.29
38 0.28
39 0.28
40 0.28
41 0.27
42 0.27
43 0.25
44 0.2
45 0.17
46 0.17
47 0.18
48 0.18
49 0.17
50 0.13
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.18
55 0.22
56 0.23
57 0.22
58 0.24
59 0.28
60 0.33
61 0.41
62 0.4
63 0.39
64 0.47
65 0.5
66 0.5
67 0.46
68 0.41
69 0.33
70 0.32
71 0.36
72 0.31
73 0.31
74 0.32
75 0.33
76 0.33
77 0.36
78 0.33
79 0.3
80 0.33
81 0.3
82 0.29
83 0.27
84 0.26
85 0.22
86 0.22
87 0.18
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.12
101 0.13
102 0.15
103 0.18
104 0.21
105 0.22
106 0.23
107 0.23
108 0.23
109 0.3
110 0.32
111 0.33
112 0.35
113 0.34
114 0.33
115 0.32
116 0.3
117 0.25
118 0.24
119 0.3
120 0.27
121 0.32
122 0.39
123 0.42
124 0.42
125 0.44
126 0.43
127 0.39
128 0.44
129 0.38
130 0.33
131 0.35
132 0.36
133 0.33
134 0.3
135 0.26
136 0.19
137 0.19
138 0.17
139 0.12
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.08
158 0.06
159 0.07
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.15
167 0.16
168 0.13
169 0.17
170 0.2
171 0.2
172 0.22
173 0.21
174 0.19
175 0.18
176 0.17
177 0.13
178 0.11
179 0.11
180 0.09
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.14
185 0.16
186 0.19
187 0.26
188 0.3
189 0.28
190 0.3
191 0.3
192 0.28
193 0.34
194 0.35
195 0.32
196 0.32
197 0.32
198 0.3
199 0.3
200 0.29
201 0.27
202 0.22
203 0.21
204 0.18
205 0.19
206 0.19
207 0.19
208 0.17
209 0.1
210 0.1
211 0.07
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.16
230 0.17
231 0.24
232 0.25
233 0.27
234 0.29
235 0.37
236 0.38
237 0.34
238 0.3
239 0.26
240 0.25
241 0.23
242 0.22
243 0.15
244 0.11
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.12
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.19
262 0.19
263 0.22
264 0.25
265 0.26
266 0.24
267 0.28
268 0.35
269 0.36
270 0.45
271 0.46
272 0.47
273 0.53
274 0.55
275 0.52
276 0.45
277 0.41
278 0.38
279 0.33
280 0.32
281 0.29
282 0.26
283 0.25
284 0.26
285 0.3
286 0.28
287 0.29
288 0.25
289 0.25
290 0.24
291 0.24
292 0.23
293 0.22
294 0.22
295 0.21
296 0.22
297 0.18
298 0.18
299 0.19
300 0.23
301 0.21
302 0.2
303 0.2
304 0.22
305 0.24
306 0.27
307 0.27
308 0.23
309 0.22
310 0.19
311 0.24
312 0.23
313 0.2
314 0.17
315 0.15
316 0.14
317 0.15
318 0.17
319 0.12
320 0.16
321 0.17
322 0.17
323 0.19
324 0.2
325 0.21
326 0.19
327 0.17
328 0.15
329 0.14
330 0.19
331 0.19
332 0.24
333 0.31
334 0.38
335 0.42
336 0.44
337 0.51
338 0.57
339 0.65
340 0.7
341 0.71
342 0.73
343 0.78
344 0.83
345 0.83
346 0.82
347 0.81
348 0.8
349 0.8
350 0.81
351 0.8
352 0.78
353 0.73
354 0.68
355 0.61
356 0.53
357 0.46
358 0.38
359 0.35
360 0.33
361 0.38
362 0.37
363 0.36
364 0.42
365 0.42
366 0.44
367 0.4
368 0.36
369 0.28
370 0.27
371 0.28
372 0.23
373 0.24
374 0.24
375 0.23
376 0.23
377 0.22
378 0.22
379 0.2
380 0.21
381 0.16
382 0.13
383 0.13
384 0.14
385 0.14
386 0.13
387 0.15
388 0.16
389 0.16
390 0.16
391 0.16
392 0.14
393 0.16
394 0.18
395 0.15
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.1
402 0.09
403 0.12
404 0.12
405 0.14
406 0.13
407 0.11
408 0.14
409 0.17
410 0.21
411 0.23
412 0.24
413 0.28
414 0.33
415 0.37
416 0.36
417 0.35
418 0.33
419 0.27
420 0.28
421 0.23
422 0.18
423 0.15
424 0.13
425 0.13
426 0.11
427 0.1
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.1
437 0.11
438 0.12
439 0.13
440 0.14
441 0.14
442 0.14
443 0.14
444 0.1
445 0.1
446 0.12
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.15
452 0.15
453 0.15
454 0.14
455 0.14
456 0.13
457 0.13
458 0.13
459 0.1
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.09
464 0.11
465 0.11
466 0.12
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.09
472 0.07
473 0.07
474 0.06
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.1
484 0.11
485 0.13
486 0.14
487 0.16
488 0.19
489 0.19
490 0.21
491 0.22
492 0.22
493 0.22
494 0.27
495 0.27
496 0.25
497 0.24
498 0.22
499 0.21
500 0.19
501 0.17
502 0.13
503 0.17
504 0.23
505 0.26
506 0.3
507 0.31
508 0.39
509 0.46
510 0.54
511 0.58
512 0.62
513 0.69
514 0.71
515 0.77
516 0.77
517 0.72
518 0.67
519 0.64
520 0.62
521 0.61
522 0.6
523 0.63
524 0.62
525 0.64
526 0.62
527 0.56
528 0.47
529 0.41
530 0.38
531 0.28
532 0.22
533 0.17
534 0.14
535 0.14
536 0.13
537 0.1
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.08
546 0.09
547 0.08
548 0.09
549 0.12
550 0.13
551 0.15
552 0.17
553 0.16
554 0.17
555 0.16
556 0.19
557 0.21
558 0.29
559 0.27
560 0.25
561 0.25
562 0.25
563 0.25
564 0.22
565 0.18
566 0.1
567 0.13
568 0.14
569 0.16
570 0.16
571 0.15
572 0.14
573 0.13
574 0.13
575 0.09
576 0.08
577 0.05
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.08
585 0.09
586 0.09
587 0.09
588 0.11
589 0.15
590 0.24
591 0.27
592 0.33
593 0.36
594 0.4
595 0.44
596 0.46
597 0.43
598 0.35
599 0.34
600 0.27
601 0.25
602 0.22
603 0.19
604 0.19
605 0.19
606 0.18
607 0.16
608 0.17
609 0.2
610 0.23
611 0.25
612 0.24
613 0.26
614 0.27
615 0.28
616 0.28
617 0.24
618 0.22
619 0.18
620 0.21
621 0.19
622 0.19
623 0.19
624 0.2
625 0.21
626 0.19
627 0.2
628 0.17
629 0.16
630 0.16
631 0.16
632 0.16
633 0.16
634 0.17
635 0.15
636 0.13
637 0.13
638 0.12
639 0.14
640 0.11
641 0.1
642 0.09
643 0.09
644 0.1
645 0.1
646 0.11
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.07
651 0.07
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.05
656 0.05
657 0.06
658 0.07
659 0.09
660 0.09
661 0.14
662 0.16
663 0.16
664 0.17
665 0.16
666 0.18
667 0.19
668 0.23
669 0.21
670 0.22
671 0.22
672 0.21
673 0.21
674 0.19
675 0.16
676 0.16
677 0.24
678 0.25
679 0.28
680 0.33
681 0.37
682 0.38
683 0.43
684 0.42
685 0.36
686 0.38
687 0.37
688 0.36
689 0.37
690 0.39
691 0.35
692 0.33
693 0.35
694 0.29
695 0.28
696 0.29
697 0.26
698 0.3
699 0.32
700 0.32
701 0.31
702 0.32
703 0.33
704 0.28
705 0.27
706 0.23
707 0.24
708 0.27
709 0.24
710 0.26
711 0.29
712 0.28
713 0.29
714 0.26
715 0.3
716 0.28
717 0.26
718 0.26
719 0.22
720 0.24
721 0.23
722 0.22
723 0.19
724 0.23
725 0.3
726 0.28
727 0.38
728 0.41
729 0.48
730 0.53
731 0.54
732 0.55
733 0.56
734 0.6
735 0.53
736 0.57
737 0.59
738 0.58
739 0.57
740 0.51
741 0.45
742 0.41
743 0.39
744 0.32
745 0.25
746 0.26
747 0.28
748 0.3
749 0.28
750 0.26
751 0.26
752 0.27
753 0.27
754 0.22