Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DUG0

Protein Details
Accession C5DUG0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
382-403SVAAEHRKRRHSSKNKRSSMTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
387-397HRKRRHSSKNK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.333, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG zro:ZYRO0C16434g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MTMASDSYALQLDEMIQLFQEYKSGSVTLDNITKLCQTLGLESFIDDIDAETSRLSTASKIIVIDIDFSKSIGRVKDVKLVLASNFDNFNYFNEPVVQANNDSNSNEGSNILLNSLTQYPDLHQFHHNLKFLYLLDTFSSINIDANNNGGPNNDGGGGEFSGELDLFKYFTELAQFLRQYFADQGAPLKVVTNLNNRFGIYIMTQLDRVLLAKITFEKSRDSQQRLYEYVYYEGNKEWINESPESFTSGVSMVMEISDKTNPTWFPKDYVPKELVLDEGDSNDKINDVSPNEFMNSLSMNASRGKFQVMNDFTTQLVPLRKFDISNDNSELIIEILRWIQWSRTVLYPIYKTLNAPEDEATKGDAGKEGTVTANGPQGRHGSVAAEHRKRRHSSKNKRSSMTEATMLKEEGLQQFNLQELMTDQDTDLNQGSEKASTGLLGVDKMQVDDQAIDDSDTTCQLVFSEDRVSLENVAQCTLYDDMAKWDSFIEAFKTYSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.11
7 0.13
8 0.1
9 0.11
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.16
15 0.17
16 0.21
17 0.21
18 0.19
19 0.21
20 0.21
21 0.2
22 0.18
23 0.17
24 0.14
25 0.18
26 0.19
27 0.2
28 0.19
29 0.19
30 0.19
31 0.17
32 0.16
33 0.11
34 0.09
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.1
45 0.12
46 0.13
47 0.13
48 0.14
49 0.15
50 0.15
51 0.17
52 0.15
53 0.16
54 0.14
55 0.14
56 0.15
57 0.14
58 0.18
59 0.16
60 0.2
61 0.23
62 0.26
63 0.34
64 0.34
65 0.34
66 0.32
67 0.33
68 0.29
69 0.28
70 0.26
71 0.19
72 0.2
73 0.18
74 0.18
75 0.16
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.17
80 0.18
81 0.19
82 0.19
83 0.2
84 0.19
85 0.15
86 0.17
87 0.18
88 0.18
89 0.17
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.14
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.08
100 0.07
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.21
108 0.22
109 0.22
110 0.24
111 0.28
112 0.34
113 0.4
114 0.41
115 0.33
116 0.32
117 0.31
118 0.29
119 0.28
120 0.22
121 0.16
122 0.14
123 0.15
124 0.15
125 0.12
126 0.13
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.08
159 0.08
160 0.1
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.17
165 0.16
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.11
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.12
178 0.15
179 0.23
180 0.25
181 0.27
182 0.28
183 0.28
184 0.26
185 0.24
186 0.21
187 0.12
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.15
205 0.16
206 0.25
207 0.32
208 0.35
209 0.37
210 0.41
211 0.44
212 0.42
213 0.42
214 0.35
215 0.29
216 0.26
217 0.23
218 0.19
219 0.16
220 0.14
221 0.14
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.12
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.15
230 0.15
231 0.17
232 0.16
233 0.13
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.09
248 0.1
249 0.14
250 0.19
251 0.18
252 0.2
253 0.26
254 0.35
255 0.35
256 0.38
257 0.35
258 0.31
259 0.31
260 0.29
261 0.24
262 0.15
263 0.14
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.11
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.11
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.24
295 0.23
296 0.26
297 0.25
298 0.26
299 0.23
300 0.22
301 0.21
302 0.15
303 0.17
304 0.15
305 0.15
306 0.17
307 0.18
308 0.18
309 0.2
310 0.27
311 0.25
312 0.28
313 0.3
314 0.28
315 0.27
316 0.26
317 0.24
318 0.14
319 0.12
320 0.08
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.11
328 0.13
329 0.15
330 0.17
331 0.19
332 0.2
333 0.24
334 0.25
335 0.24
336 0.25
337 0.24
338 0.21
339 0.22
340 0.27
341 0.23
342 0.24
343 0.22
344 0.21
345 0.21
346 0.21
347 0.19
348 0.13
349 0.13
350 0.11
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.11
358 0.11
359 0.1
360 0.14
361 0.15
362 0.15
363 0.16
364 0.18
365 0.18
366 0.18
367 0.17
368 0.14
369 0.16
370 0.25
371 0.33
372 0.39
373 0.43
374 0.49
375 0.56
376 0.61
377 0.66
378 0.68
379 0.7
380 0.73
381 0.79
382 0.84
383 0.84
384 0.83
385 0.79
386 0.75
387 0.72
388 0.64
389 0.59
390 0.5
391 0.44
392 0.42
393 0.38
394 0.3
395 0.23
396 0.22
397 0.21
398 0.21
399 0.19
400 0.18
401 0.18
402 0.19
403 0.18
404 0.14
405 0.1
406 0.08
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.14
412 0.14
413 0.16
414 0.16
415 0.13
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.1
423 0.09
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.12
430 0.12
431 0.13
432 0.13
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.11
440 0.11
441 0.12
442 0.11
443 0.12
444 0.11
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.11
449 0.12
450 0.13
451 0.16
452 0.16
453 0.18
454 0.2
455 0.22
456 0.19
457 0.22
458 0.24
459 0.21
460 0.21
461 0.2
462 0.17
463 0.19
464 0.18
465 0.15
466 0.13
467 0.13
468 0.17
469 0.21
470 0.21
471 0.18
472 0.17
473 0.18
474 0.17
475 0.18
476 0.17
477 0.16