Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DQE1

Protein Details
Accession C5DQE1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-32KRKQWTQELLKQKKEQDRKRITQYRGLVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002088  Prenyl_trans_a  
Gene Ontology GO:0005968  C:Rab-protein geranylgeranyltransferase complex  
GO:0004663  F:Rab geranylgeranyltransferase activity  
GO:0018344  P:protein geranylgeranylation  
KEGG zro:ZYRO0A10758g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01239  PPTA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51147  PFTA  
Amino Acid Sequences MHGVKRKQWTQELLKQKKEQDRKRITQYRGLVDKLLDSRDSKTYNMEVFKETTQLLRINPEYNAGWNYRRDIIEHLSPELKHEFWEDELAFSMALLKDYPKVYWIWNHRKWTLENHIDKSVKIWLRELAIVSKLLQMDPRNFHGWHYRRILVAEIEGRTGQSRDGEELQYAIDNTNKNISNYSAWHQKATLIPKMFEKDEIKDKKKFIQDEFTYITNAIYTDAEDQSVWFYIEWFVKNHIVIDALGRDELIQKLQELQENILAINEDDLQFSGKQNNWCLKVLIVLEDVQRNLKVQFTPHSHEYLAQLIEADPMRKNRYLHLLHRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.77
3 0.78
4 0.8
5 0.81
6 0.81
7 0.81
8 0.83
9 0.83
10 0.87
11 0.88
12 0.83
13 0.81
14 0.78
15 0.76
16 0.71
17 0.64
18 0.55
19 0.46
20 0.46
21 0.4
22 0.35
23 0.28
24 0.25
25 0.26
26 0.3
27 0.32
28 0.28
29 0.29
30 0.31
31 0.34
32 0.35
33 0.34
34 0.31
35 0.32
36 0.31
37 0.29
38 0.25
39 0.22
40 0.21
41 0.22
42 0.2
43 0.23
44 0.25
45 0.24
46 0.24
47 0.26
48 0.23
49 0.23
50 0.25
51 0.22
52 0.23
53 0.24
54 0.27
55 0.28
56 0.28
57 0.26
58 0.28
59 0.3
60 0.32
61 0.31
62 0.31
63 0.29
64 0.29
65 0.31
66 0.29
67 0.24
68 0.19
69 0.19
70 0.18
71 0.16
72 0.21
73 0.17
74 0.15
75 0.16
76 0.15
77 0.13
78 0.11
79 0.13
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.12
89 0.14
90 0.21
91 0.3
92 0.38
93 0.44
94 0.5
95 0.51
96 0.53
97 0.53
98 0.54
99 0.53
100 0.52
101 0.51
102 0.49
103 0.53
104 0.5
105 0.48
106 0.42
107 0.4
108 0.33
109 0.28
110 0.26
111 0.2
112 0.21
113 0.22
114 0.22
115 0.16
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.14
120 0.12
121 0.11
122 0.14
123 0.14
124 0.18
125 0.2
126 0.23
127 0.24
128 0.24
129 0.25
130 0.32
131 0.33
132 0.35
133 0.37
134 0.35
135 0.32
136 0.32
137 0.32
138 0.22
139 0.21
140 0.17
141 0.13
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.15
166 0.16
167 0.15
168 0.16
169 0.2
170 0.23
171 0.23
172 0.23
173 0.23
174 0.23
175 0.26
176 0.28
177 0.31
178 0.24
179 0.24
180 0.27
181 0.29
182 0.27
183 0.28
184 0.26
185 0.23
186 0.31
187 0.4
188 0.42
189 0.44
190 0.46
191 0.48
192 0.52
193 0.53
194 0.47
195 0.48
196 0.45
197 0.45
198 0.46
199 0.39
200 0.34
201 0.29
202 0.26
203 0.16
204 0.14
205 0.1
206 0.07
207 0.07
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.06
217 0.07
218 0.09
219 0.12
220 0.13
221 0.14
222 0.16
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.16
227 0.14
228 0.13
229 0.14
230 0.12
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.13
241 0.15
242 0.19
243 0.18
244 0.19
245 0.19
246 0.19
247 0.19
248 0.15
249 0.14
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.1
258 0.12
259 0.17
260 0.2
261 0.24
262 0.31
263 0.37
264 0.39
265 0.4
266 0.4
267 0.34
268 0.34
269 0.3
270 0.26
271 0.2
272 0.18
273 0.2
274 0.22
275 0.22
276 0.2
277 0.2
278 0.19
279 0.18
280 0.2
281 0.19
282 0.2
283 0.27
284 0.32
285 0.38
286 0.4
287 0.43
288 0.39
289 0.4
290 0.39
291 0.35
292 0.29
293 0.22
294 0.19
295 0.16
296 0.2
297 0.19
298 0.19
299 0.19
300 0.24
301 0.29
302 0.33
303 0.35
304 0.36
305 0.44
306 0.5