Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5E0R9

Protein Details
Accession C5E0R9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
622-647GGGNRNKDKNRGKKSDKSKRISPVYFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
621-641GGGGNRNKDKNRGKKSDKSKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR019039  T4-Rnl1-like_N  
IPR012387  Trl1_fun  
IPR015966  tRNA_lig_kin_fungi  
IPR015965  tRNA_lig_PDEase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051730  F:GTP-dependent polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0003972  F:RNA ligase (ATP) activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
KEGG zro:ZYRO0G15070g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09511  RNA_lig_T4_1  
PF08302  tRNA_lig_CPD  
PF08303  tRNA_lig_kinase  
Amino Acid Sequences MNIENSKEMNLQRPSVKEVKNLVASLERSSELSGRGKSSKRVCQLFNSDRRVVSWKFQEWDYGKKNITLPCNARGLFITDDKENPQIVTRGYDKFFNIDEMSLTKWDSIAKGTVGPYTITLKSNGCIIFISGLEDGTLVVCSKHSTGPRDDVDRNHAEFGRNYLLNLLRERNVDVKQFARRLYDLNVTLVAEYCDDSFEEHILEYTGDSAGLYLHGVNLNKPEFVTWPMKEVNGFAQEYGFKPTMYFDLPDITSLKSFLDKCSHDGTYKGMEVEGFVIRTHLTETGQDFFFKFKFEEPYLMYRQWREVTKQYISSKSRLLKYKRHKFITNNYLDFVIPILDNDPKLSEQYMKGFGIIKLRNMFLKSYGMSGLEILNQEKIQELELKNATNDSDIVDEKTKFLIFPISVIGCGKTTTALTLTNLFPNWGHIQNDDITGKDKSMLIKKSLELLAKPDIKCVFVDRNNHQRREREQLFTWVEQLRENYLPYYTNIKTIGLSFASYDDLEKVKKLTIDRVLARGDNHQSIKSSVYGEQKVLGIMNGFVKRYQPINENRDPDNLFDYVIHLNSLDTNSSLINAKETAKKLHEKYPVLVPNIPTDEQIEKALERSLEYKPTTKKVVGGGGNRNKDKNRGKKSDKSKRISPVYFSANIEKKENIIEIVKKTFEGLNSERKSSLSKLIEEDRFQPKFHITLCHVTQGKNGAPETKQLWASYLNRYNSELEKLEDLPQILATGDKIKFKPIKLCWDEKIVSMVVQLSAVLDPHNHIVSELSCGNAIPHITVGILQDGVKPFYSNELCQKIFSNNPPPGSQCIDLDSQDIEAGICINF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.51
3 0.52
4 0.5
5 0.52
6 0.54
7 0.54
8 0.51
9 0.46
10 0.43
11 0.41
12 0.36
13 0.33
14 0.26
15 0.22
16 0.24
17 0.24
18 0.22
19 0.26
20 0.26
21 0.29
22 0.35
23 0.38
24 0.45
25 0.52
26 0.57
27 0.6
28 0.64
29 0.63
30 0.65
31 0.71
32 0.73
33 0.74
34 0.72
35 0.67
36 0.6
37 0.6
38 0.57
39 0.5
40 0.47
41 0.46
42 0.45
43 0.44
44 0.44
45 0.5
46 0.47
47 0.54
48 0.51
49 0.5
50 0.45
51 0.46
52 0.51
53 0.48
54 0.5
55 0.49
56 0.49
57 0.47
58 0.52
59 0.48
60 0.44
61 0.39
62 0.38
63 0.32
64 0.32
65 0.3
66 0.25
67 0.27
68 0.28
69 0.3
70 0.27
71 0.24
72 0.24
73 0.23
74 0.22
75 0.25
76 0.26
77 0.28
78 0.29
79 0.31
80 0.29
81 0.29
82 0.29
83 0.28
84 0.25
85 0.2
86 0.2
87 0.18
88 0.2
89 0.18
90 0.17
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.14
98 0.17
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.17
103 0.17
104 0.19
105 0.2
106 0.19
107 0.2
108 0.2
109 0.19
110 0.24
111 0.22
112 0.18
113 0.16
114 0.16
115 0.15
116 0.14
117 0.16
118 0.11
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.09
130 0.14
131 0.19
132 0.24
133 0.28
134 0.35
135 0.39
136 0.44
137 0.46
138 0.45
139 0.47
140 0.48
141 0.45
142 0.42
143 0.4
144 0.36
145 0.33
146 0.34
147 0.33
148 0.27
149 0.25
150 0.26
151 0.28
152 0.28
153 0.31
154 0.29
155 0.25
156 0.27
157 0.29
158 0.3
159 0.29
160 0.29
161 0.29
162 0.31
163 0.36
164 0.38
165 0.38
166 0.37
167 0.35
168 0.34
169 0.35
170 0.36
171 0.3
172 0.28
173 0.27
174 0.23
175 0.22
176 0.2
177 0.16
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.05
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.19
212 0.24
213 0.19
214 0.23
215 0.24
216 0.24
217 0.24
218 0.23
219 0.22
220 0.2
221 0.2
222 0.16
223 0.16
224 0.17
225 0.17
226 0.21
227 0.18
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.16
232 0.16
233 0.16
234 0.11
235 0.14
236 0.14
237 0.16
238 0.16
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.14
245 0.16
246 0.21
247 0.21
248 0.24
249 0.29
250 0.3
251 0.26
252 0.26
253 0.26
254 0.23
255 0.23
256 0.19
257 0.15
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.12
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.1
271 0.12
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.13
280 0.12
281 0.17
282 0.18
283 0.21
284 0.22
285 0.27
286 0.3
287 0.32
288 0.31
289 0.27
290 0.29
291 0.3
292 0.29
293 0.28
294 0.3
295 0.33
296 0.34
297 0.4
298 0.4
299 0.45
300 0.45
301 0.43
302 0.44
303 0.44
304 0.47
305 0.49
306 0.51
307 0.52
308 0.61
309 0.69
310 0.72
311 0.72
312 0.72
313 0.69
314 0.73
315 0.74
316 0.7
317 0.61
318 0.52
319 0.48
320 0.41
321 0.35
322 0.25
323 0.15
324 0.07
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.14
337 0.17
338 0.16
339 0.16
340 0.17
341 0.18
342 0.23
343 0.22
344 0.23
345 0.21
346 0.22
347 0.23
348 0.22
349 0.21
350 0.15
351 0.17
352 0.14
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.12
369 0.12
370 0.16
371 0.17
372 0.17
373 0.17
374 0.17
375 0.16
376 0.11
377 0.11
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.09
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.1
388 0.1
389 0.11
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.09
412 0.12
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.12
417 0.14
418 0.14
419 0.17
420 0.14
421 0.12
422 0.12
423 0.11
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.12
428 0.18
429 0.2
430 0.2
431 0.22
432 0.22
433 0.25
434 0.27
435 0.25
436 0.19
437 0.2
438 0.23
439 0.27
440 0.27
441 0.27
442 0.24
443 0.24
444 0.24
445 0.24
446 0.24
447 0.23
448 0.3
449 0.32
450 0.43
451 0.49
452 0.54
453 0.55
454 0.54
455 0.54
456 0.57
457 0.56
458 0.5
459 0.44
460 0.47
461 0.47
462 0.41
463 0.41
464 0.32
465 0.29
466 0.25
467 0.24
468 0.19
469 0.16
470 0.17
471 0.13
472 0.12
473 0.13
474 0.13
475 0.18
476 0.16
477 0.17
478 0.17
479 0.17
480 0.17
481 0.16
482 0.17
483 0.11
484 0.11
485 0.08
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.09
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.13
497 0.14
498 0.18
499 0.23
500 0.28
501 0.29
502 0.32
503 0.32
504 0.3
505 0.3
506 0.29
507 0.26
508 0.25
509 0.25
510 0.23
511 0.22
512 0.22
513 0.23
514 0.19
515 0.18
516 0.18
517 0.23
518 0.23
519 0.22
520 0.22
521 0.21
522 0.2
523 0.18
524 0.14
525 0.08
526 0.07
527 0.12
528 0.12
529 0.12
530 0.12
531 0.13
532 0.15
533 0.17
534 0.19
535 0.22
536 0.3
537 0.37
538 0.43
539 0.46
540 0.46
541 0.49
542 0.47
543 0.41
544 0.34
545 0.26
546 0.21
547 0.17
548 0.17
549 0.13
550 0.13
551 0.11
552 0.08
553 0.08
554 0.09
555 0.1
556 0.08
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.09
562 0.08
563 0.09
564 0.1
565 0.13
566 0.18
567 0.2
568 0.23
569 0.27
570 0.35
571 0.37
572 0.43
573 0.49
574 0.46
575 0.46
576 0.51
577 0.52
578 0.48
579 0.47
580 0.4
581 0.36
582 0.38
583 0.35
584 0.27
585 0.24
586 0.22
587 0.2
588 0.2
589 0.17
590 0.13
591 0.14
592 0.15
593 0.13
594 0.13
595 0.15
596 0.16
597 0.21
598 0.23
599 0.28
600 0.31
601 0.35
602 0.39
603 0.37
604 0.37
605 0.35
606 0.4
607 0.39
608 0.41
609 0.47
610 0.51
611 0.57
612 0.57
613 0.58
614 0.53
615 0.57
616 0.6
617 0.61
618 0.63
619 0.66
620 0.72
621 0.76
622 0.86
623 0.87
624 0.87
625 0.84
626 0.82
627 0.81
628 0.82
629 0.75
630 0.69
631 0.64
632 0.59
633 0.55
634 0.5
635 0.48
636 0.44
637 0.43
638 0.41
639 0.35
640 0.31
641 0.29
642 0.28
643 0.21
644 0.2
645 0.23
646 0.24
647 0.27
648 0.27
649 0.25
650 0.25
651 0.25
652 0.22
653 0.24
654 0.25
655 0.32
656 0.34
657 0.36
658 0.35
659 0.34
660 0.37
661 0.32
662 0.37
663 0.3
664 0.3
665 0.33
666 0.4
667 0.43
668 0.42
669 0.45
670 0.45
671 0.43
672 0.41
673 0.39
674 0.34
675 0.33
676 0.33
677 0.34
678 0.28
679 0.35
680 0.36
681 0.42
682 0.41
683 0.38
684 0.39
685 0.38
686 0.37
687 0.33
688 0.33
689 0.29
690 0.28
691 0.32
692 0.31
693 0.3
694 0.3
695 0.25
696 0.26
697 0.28
698 0.3
699 0.36
700 0.41
701 0.39
702 0.39
703 0.41
704 0.43
705 0.39
706 0.41
707 0.33
708 0.27
709 0.27
710 0.27
711 0.29
712 0.28
713 0.26
714 0.21
715 0.2
716 0.18
717 0.15
718 0.13
719 0.1
720 0.15
721 0.16
722 0.22
723 0.22
724 0.31
725 0.36
726 0.39
727 0.47
728 0.47
729 0.56
730 0.57
731 0.63
732 0.58
733 0.61
734 0.58
735 0.5
736 0.48
737 0.37
738 0.3
739 0.25
740 0.22
741 0.14
742 0.13
743 0.12
744 0.09
745 0.08
746 0.08
747 0.08
748 0.08
749 0.09
750 0.13
751 0.14
752 0.13
753 0.12
754 0.14
755 0.14
756 0.19
757 0.17
758 0.15
759 0.14
760 0.14
761 0.14
762 0.15
763 0.15
764 0.1
765 0.1
766 0.1
767 0.09
768 0.11
769 0.11
770 0.11
771 0.11
772 0.1
773 0.14
774 0.16
775 0.18
776 0.17
777 0.17
778 0.16
779 0.24
780 0.27
781 0.27
782 0.34
783 0.4
784 0.4
785 0.41
786 0.43
787 0.4
788 0.44
789 0.48
790 0.49
791 0.47
792 0.5
793 0.51
794 0.52
795 0.51
796 0.49
797 0.43
798 0.34
799 0.32
800 0.32
801 0.3
802 0.29
803 0.24
804 0.19
805 0.17
806 0.16
807 0.12
808 0.09