FuNGI

C5DYV5

Protein Details

Accession

C5DYV5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
261-289	YGSRRERERERDRYQKRNRSRSPPVKREA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
265-285	RERERERDRYQKRNRSRSPPV

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006569 CID_dom IPR008942 ENTH_VHS IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR045154 PCF11-like IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000993 F:RNA polymerase II complex binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation GO:0006369 P:termination of RNA polymerase II transcription
KEGG	zro:ZYRO0F16060g -
Pfam	View protein in Pfam PF04818 CID
PROSITE	View protein in PROSITE PS51391 CID PS50102 RRM
CDD	cd16984 CID_Nrd1_like

Amino Acid Sequences

MDDHQNFVATLESFRELKSGISGSRIKKLTTYALEHVEDEETLISLVIDYSKTCAPTHKLGSLYIIDSIGRAYLDEARANDDYVKPTAKKGTCAHAIYTLGESIQDLLTGAIGKSNEDHKEKIRTLIDIWDRAGLFQKGYLNAIRAKCFSMAITHDDASRHSSISNGQALPSDPRERCVHILRDLKPLNVQPQVTIPNELGSNDLQEQQHALFQVLVSIQQQLAPPSTVGSTATSITSSTHSATPPQPAAAAPVTHVTTEYGSRRERERERDRYQKRNRSRSPPVKREATSGIISGTNNHHLYPDEQNVPSNPHFRPKPVSYDPTTPSEHVKVYSRTLFVGGVPMNMKEWDIASVLRPYAEVQSVILNNARKHAFVKVYSRQEAENVLLSFNKDGSSPLRTRWGVGFGPRDCCDYQHGYSIIPMHRLTDADKKWCVQAQWGGTGGQPLQSGIVFEEPDIVVGEGVSSKAISQKMPTDSGRNGPRSGKGNSRSSLSVSPPVTKYSMAPVPSPGHVYGQIPPAYPPQPVAAYNGTPIAAAPQMAPAAATPSYPPAPAPQQQAPAPPVPQQQSFDPAAQLNSLMSMLNQQQTQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.16
4	0.15
5	0.18
6	0.19
7	0.17
8	0.23
9	0.31
10	0.33
11	0.41
12	0.42
13	0.39
14	0.38
15	0.41
16	0.43
17	0.42
18	0.44
19	0.4
20	0.44
21	0.44
22	0.42
23	0.4
24	0.32
25	0.26
26	0.2
27	0.16
28	0.1
29	0.09
30	0.08
31	0.06
32	0.05
33	0.06
34	0.06
35	0.06
36	0.07
37	0.1
38	0.12
39	0.14
40	0.15
41	0.21
42	0.25
43	0.33
44	0.38
45	0.39
46	0.39
47	0.38
48	0.41
49	0.37
50	0.32
51	0.26
52	0.21
53	0.16
54	0.14
55	0.14
56	0.11
57	0.08
58	0.07
59	0.08
60	0.12
61	0.14
62	0.17
63	0.18
64	0.22
65	0.23
66	0.23
67	0.24
68	0.22
69	0.23
70	0.23
71	0.28
72	0.24
73	0.28
74	0.36
75	0.35
76	0.4
77	0.4
78	0.45
79	0.47
80	0.48
81	0.46
82	0.41
83	0.41
84	0.35
85	0.32
86	0.25
87	0.17
88	0.15
89	0.13
90	0.1
91	0.09
92	0.07
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.07
97	0.07
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.1
102	0.16
103	0.21
104	0.24
105	0.27
106	0.3
107	0.39
108	0.4
109	0.45
110	0.41
111	0.37
112	0.35
113	0.41
114	0.41
115	0.34
116	0.34
117	0.3
118	0.28
119	0.27
120	0.3
121	0.22
122	0.17
123	0.17
124	0.2
125	0.17
126	0.2
127	0.2
128	0.19
129	0.24
130	0.26
131	0.26
132	0.25
133	0.25
134	0.24
135	0.23
136	0.2
137	0.18
138	0.18
139	0.2
140	0.22
141	0.2
142	0.21
143	0.21
144	0.22
145	0.23
146	0.21
147	0.17
148	0.14
149	0.14
150	0.15
151	0.2
152	0.23
153	0.19
154	0.18
155	0.19
156	0.2
157	0.23
158	0.25
159	0.27
160	0.22
161	0.26
162	0.28
163	0.3
164	0.34
165	0.37
166	0.37
167	0.38
168	0.46
169	0.45
170	0.52
171	0.5
172	0.46
173	0.43
174	0.41
175	0.38
176	0.35
177	0.32
178	0.23
179	0.26
180	0.29
181	0.26
182	0.25
183	0.2
184	0.17
185	0.17
186	0.17
187	0.15
188	0.1
189	0.11
190	0.11
191	0.14
192	0.13
193	0.13
194	0.14
195	0.12
196	0.14
197	0.12
198	0.11
199	0.08
200	0.07
201	0.08
202	0.07
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.09
209	0.09
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.09
225	0.09
226	0.1
227	0.11
228	0.11
229	0.14
230	0.16
231	0.19
232	0.18
233	0.17
234	0.16
235	0.14
236	0.16
237	0.14
238	0.13
239	0.1
240	0.11
241	0.11
242	0.11
243	0.11
244	0.09
245	0.08
246	0.11
247	0.13
248	0.15
249	0.16
250	0.19
251	0.22
252	0.29
253	0.34
254	0.41
255	0.49
256	0.54
257	0.6
258	0.69
259	0.73
260	0.77
261	0.81
262	0.81
263	0.82
264	0.83
265	0.82
266	0.81
267	0.84
268	0.84
269	0.84
270	0.82
271	0.78
272	0.74
273	0.67
274	0.61
275	0.54
276	0.46
277	0.36
278	0.28
279	0.23
280	0.18
281	0.17
282	0.15
283	0.13
284	0.14
285	0.14
286	0.14
287	0.13
288	0.13
289	0.15
290	0.18
291	0.2
292	0.18
293	0.18
294	0.19
295	0.19
296	0.23
297	0.23
298	0.23
299	0.2
300	0.24
301	0.25
302	0.26
303	0.32
304	0.3
305	0.36
306	0.37
307	0.41
308	0.38
309	0.43
310	0.43
311	0.41
312	0.4
313	0.33
314	0.31
315	0.28
316	0.25
317	0.21
318	0.22
319	0.2
320	0.22
321	0.23
322	0.21
323	0.19
324	0.2
325	0.18
326	0.14
327	0.16
328	0.12
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.1
334	0.11
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.1
342	0.09
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.1
347	0.1
348	0.09
349	0.08
350	0.11
351	0.11
352	0.12
353	0.14
354	0.16
355	0.15
356	0.19
357	0.19
358	0.17
359	0.18
360	0.22
361	0.22
362	0.23
363	0.3
364	0.34
365	0.4
366	0.42
367	0.42
368	0.37
369	0.35
370	0.33
371	0.27
372	0.23
373	0.17
374	0.15
375	0.14
376	0.15
377	0.14
378	0.13
379	0.11
380	0.07
381	0.08
382	0.1
383	0.16
384	0.17
385	0.18
386	0.26
387	0.26
388	0.27
389	0.27
390	0.29
391	0.25
392	0.29
393	0.34
394	0.28
395	0.33
396	0.33
397	0.35
398	0.3
399	0.3
400	0.3
401	0.28
402	0.27
403	0.27
404	0.27
405	0.24
406	0.25
407	0.29
408	0.25
409	0.23
410	0.22
411	0.18
412	0.18
413	0.18
414	0.2
415	0.25
416	0.27
417	0.29
418	0.31
419	0.31
420	0.33
421	0.35
422	0.32
423	0.28
424	0.3
425	0.27
426	0.28
427	0.28
428	0.26
429	0.23
430	0.24
431	0.19
432	0.15
433	0.13
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.1
440	0.08
441	0.08
442	0.1
443	0.09
444	0.1
445	0.1
446	0.09
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.04
454	0.05
455	0.09
456	0.11
457	0.12
458	0.14
459	0.2
460	0.24
461	0.29
462	0.3
463	0.32
464	0.33
465	0.4
466	0.46
467	0.43
468	0.43
469	0.41
470	0.44
471	0.44
472	0.46
473	0.47
474	0.46
475	0.5
476	0.49
477	0.49
478	0.45
479	0.44
480	0.44
481	0.39
482	0.39
483	0.34
484	0.37
485	0.34
486	0.36
487	0.33
488	0.29
489	0.27
490	0.26
491	0.29
492	0.26
493	0.25
494	0.28
495	0.29
496	0.3
497	0.32
498	0.26
499	0.24
500	0.24
501	0.25
502	0.24
503	0.27
504	0.28
505	0.25
506	0.26
507	0.29
508	0.29
509	0.28
510	0.25
511	0.22
512	0.23
513	0.23
514	0.26
515	0.25
516	0.24
517	0.24
518	0.24
519	0.2
520	0.17
521	0.16
522	0.14
523	0.11
524	0.1
525	0.09
526	0.1
527	0.1
528	0.1
529	0.1
530	0.08
531	0.11
532	0.11
533	0.11
534	0.1
535	0.15
536	0.17
537	0.17
538	0.17
539	0.2
540	0.27
541	0.32
542	0.38
543	0.38
544	0.43
545	0.45
546	0.5
547	0.49
548	0.47
549	0.43
550	0.42
551	0.45
552	0.44
553	0.46
554	0.43
555	0.41
556	0.43
557	0.43
558	0.39
559	0.34
560	0.31
561	0.28
562	0.25
563	0.23
564	0.17
565	0.14
566	0.13
567	0.1
568	0.09
569	0.12
570	0.16

C5DYV5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer