Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DSQ6

Protein Details
Accession C5DSQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-189NYSQYCIRRKHKWKILMEKSGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
609-620KAKVKQMRKKKG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 11.833, cyto_mito 3.333, mito 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
KEGG zro:ZYRO0C02200g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MMDVERSRHSMHPGSSGSGLRHSPRETAVLIATAGNGYPKKSPSMPNFHEKPFTSTNASEPILNSNGLPVSSEYVADNSGVQSLTDGDASLSVIEMYGDEVESRRPENEDGGNLEGDEDADSDELELPTSGMPPTGSAMPNSDYFDRYGFKKQSNLITEQDYDEWWENYSQYCIRRKHKWKILMEKSGLPMDNDSPNRFPSRSEKLKRYVRKGIPAEWRGNAWWYFARGQEKLNKNKGIYDKLLLKMDDLLKSKTKSMPDLDIIERDLNRTFPDNIHFQKETFQIDDPPMIKSLRRVLVAFSLYNPKIGYCQSMNFLAGLLLLFMDEERAFWMLVIITSRYLPGVHNINLEGVNVDQGVLMLCIKEYLPEIWQYIMPQTSSKHFSLNNGTSLLGGNDFLYKLPPITLCTASWFMSCFVGVLPIEGTLRIWDCLFYEESHFLFKISLAIFKLCEPELIKLKPLRNGIGKNPIRGQRGSQMSNGESEMEVFQIVQTFPKQLINPNELFDRVIFKRRFSLNKLDQDEVDRCRKYVSSQRLKYKHYSEIMGTGHRNNNNNSNNNSNDIGIASSSSNSADGEKMAGDIINDALSSEVYGFKKGLGGVHWNNSIKAKVKQMRKKKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.41
3 0.4
4 0.36
5 0.34
6 0.36
7 0.32
8 0.36
9 0.35
10 0.34
11 0.33
12 0.36
13 0.31
14 0.3
15 0.27
16 0.22
17 0.2
18 0.17
19 0.15
20 0.12
21 0.11
22 0.13
23 0.13
24 0.14
25 0.18
26 0.2
27 0.24
28 0.29
29 0.38
30 0.42
31 0.52
32 0.56
33 0.62
34 0.65
35 0.64
36 0.66
37 0.59
38 0.57
39 0.51
40 0.5
41 0.46
42 0.42
43 0.41
44 0.4
45 0.38
46 0.33
47 0.29
48 0.29
49 0.25
50 0.25
51 0.21
52 0.17
53 0.17
54 0.16
55 0.16
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.14
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.12
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.07
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.1
89 0.12
90 0.14
91 0.14
92 0.17
93 0.18
94 0.22
95 0.25
96 0.24
97 0.25
98 0.26
99 0.25
100 0.21
101 0.2
102 0.16
103 0.13
104 0.1
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.09
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.15
126 0.16
127 0.18
128 0.21
129 0.2
130 0.18
131 0.18
132 0.2
133 0.2
134 0.21
135 0.28
136 0.29
137 0.31
138 0.35
139 0.38
140 0.44
141 0.46
142 0.47
143 0.41
144 0.4
145 0.39
146 0.35
147 0.31
148 0.23
149 0.22
150 0.2
151 0.17
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.16
157 0.17
158 0.21
159 0.29
160 0.36
161 0.42
162 0.53
163 0.61
164 0.69
165 0.74
166 0.77
167 0.78
168 0.82
169 0.84
170 0.82
171 0.75
172 0.68
173 0.61
174 0.55
175 0.46
176 0.36
177 0.28
178 0.22
179 0.26
180 0.25
181 0.26
182 0.24
183 0.26
184 0.29
185 0.28
186 0.28
187 0.28
188 0.35
189 0.43
190 0.48
191 0.53
192 0.59
193 0.68
194 0.74
195 0.74
196 0.75
197 0.7
198 0.72
199 0.68
200 0.67
201 0.67
202 0.64
203 0.59
204 0.5
205 0.46
206 0.37
207 0.37
208 0.29
209 0.21
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.2
214 0.23
215 0.21
216 0.24
217 0.31
218 0.38
219 0.44
220 0.5
221 0.5
222 0.46
223 0.51
224 0.52
225 0.49
226 0.42
227 0.38
228 0.35
229 0.34
230 0.36
231 0.31
232 0.26
233 0.25
234 0.25
235 0.26
236 0.23
237 0.23
238 0.24
239 0.25
240 0.28
241 0.28
242 0.27
243 0.26
244 0.26
245 0.27
246 0.25
247 0.28
248 0.26
249 0.24
250 0.23
251 0.22
252 0.19
253 0.17
254 0.15
255 0.12
256 0.12
257 0.14
258 0.13
259 0.12
260 0.15
261 0.2
262 0.21
263 0.26
264 0.25
265 0.23
266 0.26
267 0.27
268 0.26
269 0.21
270 0.2
271 0.17
272 0.17
273 0.2
274 0.17
275 0.15
276 0.15
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.18
281 0.18
282 0.19
283 0.18
284 0.18
285 0.21
286 0.22
287 0.2
288 0.16
289 0.19
290 0.18
291 0.19
292 0.17
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.13
302 0.11
303 0.11
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.04
308 0.03
309 0.02
310 0.02
311 0.02
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.05
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.09
331 0.12
332 0.13
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.14
337 0.14
338 0.11
339 0.07
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.03
349 0.03
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.11
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.12
366 0.15
367 0.19
368 0.19
369 0.2
370 0.2
371 0.23
372 0.3
373 0.31
374 0.29
375 0.25
376 0.25
377 0.22
378 0.21
379 0.18
380 0.1
381 0.08
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.1
392 0.13
393 0.14
394 0.14
395 0.17
396 0.19
397 0.18
398 0.18
399 0.17
400 0.14
401 0.13
402 0.13
403 0.09
404 0.07
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.07
412 0.08
413 0.06
414 0.07
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.13
423 0.15
424 0.15
425 0.17
426 0.16
427 0.14
428 0.13
429 0.13
430 0.13
431 0.12
432 0.14
433 0.13
434 0.14
435 0.14
436 0.15
437 0.17
438 0.13
439 0.15
440 0.14
441 0.18
442 0.24
443 0.24
444 0.29
445 0.32
446 0.35
447 0.38
448 0.4
449 0.41
450 0.41
451 0.44
452 0.44
453 0.5
454 0.49
455 0.48
456 0.51
457 0.53
458 0.5
459 0.47
460 0.45
461 0.42
462 0.46
463 0.44
464 0.41
465 0.38
466 0.35
467 0.35
468 0.32
469 0.24
470 0.17
471 0.16
472 0.13
473 0.1
474 0.09
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.1
481 0.11
482 0.12
483 0.17
484 0.18
485 0.23
486 0.3
487 0.33
488 0.34
489 0.35
490 0.35
491 0.32
492 0.31
493 0.25
494 0.25
495 0.22
496 0.3
497 0.29
498 0.29
499 0.36
500 0.42
501 0.48
502 0.47
503 0.55
504 0.55
505 0.63
506 0.66
507 0.61
508 0.55
509 0.54
510 0.54
511 0.49
512 0.48
513 0.39
514 0.35
515 0.35
516 0.35
517 0.36
518 0.4
519 0.46
520 0.48
521 0.56
522 0.67
523 0.72
524 0.76
525 0.78
526 0.73
527 0.71
528 0.64
529 0.58
530 0.49
531 0.48
532 0.46
533 0.43
534 0.4
535 0.38
536 0.41
537 0.43
538 0.46
539 0.43
540 0.51
541 0.53
542 0.57
543 0.56
544 0.55
545 0.53
546 0.52
547 0.49
548 0.39
549 0.32
550 0.26
551 0.21
552 0.15
553 0.14
554 0.1
555 0.09
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.11
561 0.1
562 0.1
563 0.11
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.08
569 0.08
570 0.09
571 0.08
572 0.07
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.07
578 0.12
579 0.13
580 0.15
581 0.15
582 0.15
583 0.18
584 0.18
585 0.2
586 0.17
587 0.26
588 0.29
589 0.35
590 0.42
591 0.41
592 0.43
593 0.44
594 0.45
595 0.42
596 0.42
597 0.46
598 0.47
599 0.57
600 0.65