Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DSM8

Protein Details
Accession C5DSM8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-61GSKLTKEQLRKREVRRAARRKVEAKKPAHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-59QLRKREVRRAARRKVEAKKP
Subcellular Location(s) mito 21.5, cyto_mito 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002143  Ribosomal_L1  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG zro:ZYRO0C01518g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MIGLIPSLRSQLLGSTSRCLFHTAALLRAEEAGSKLTKEQLRKREVRRAARRKVEAKKPAHTHPLYMPTPLALRYLRAVEVGYPASQQVITVTTSVVADRGNPPIAGNVSLPSPLKDVLVAVFSNDEQQLSMARDKFRCHLVGGSDIIAKIKQGEIPVDFDKAFATPDIAQELTSQVARILGPKQVLPMAKRGTVASDLEPLIKDSFGSIPFRQKGNSISLAVAKCEFSDRQVLENLLAVQTAFKEAVSNQKAKRPSILGRTTLTTTHGPGIVIDLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.27
3 0.28
4 0.29
5 0.29
6 0.3
7 0.25
8 0.22
9 0.28
10 0.24
11 0.28
12 0.28
13 0.27
14 0.24
15 0.24
16 0.22
17 0.15
18 0.14
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.13
23 0.19
24 0.24
25 0.32
26 0.4
27 0.47
28 0.56
29 0.64
30 0.71
31 0.74
32 0.79
33 0.81
34 0.83
35 0.84
36 0.85
37 0.85
38 0.86
39 0.85
40 0.85
41 0.84
42 0.83
43 0.79
44 0.78
45 0.74
46 0.72
47 0.73
48 0.64
49 0.57
50 0.52
51 0.54
52 0.46
53 0.41
54 0.35
55 0.26
56 0.26
57 0.23
58 0.21
59 0.13
60 0.13
61 0.14
62 0.15
63 0.14
64 0.14
65 0.13
66 0.11
67 0.13
68 0.13
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.11
95 0.09
96 0.09
97 0.11
98 0.11
99 0.09
100 0.1
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.05
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.12
119 0.13
120 0.16
121 0.17
122 0.19
123 0.2
124 0.21
125 0.2
126 0.18
127 0.17
128 0.15
129 0.16
130 0.15
131 0.14
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.09
136 0.08
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.13
144 0.14
145 0.15
146 0.15
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.07
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.15
173 0.18
174 0.17
175 0.23
176 0.23
177 0.24
178 0.24
179 0.23
180 0.22
181 0.22
182 0.22
183 0.17
184 0.17
185 0.16
186 0.16
187 0.16
188 0.16
189 0.14
190 0.12
191 0.11
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.17
196 0.17
197 0.25
198 0.28
199 0.3
200 0.29
201 0.29
202 0.3
203 0.31
204 0.33
205 0.26
206 0.24
207 0.28
208 0.28
209 0.27
210 0.25
211 0.19
212 0.16
213 0.18
214 0.17
215 0.14
216 0.21
217 0.21
218 0.23
219 0.25
220 0.26
221 0.22
222 0.24
223 0.23
224 0.15
225 0.14
226 0.11
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.08
231 0.07
232 0.08
233 0.09
234 0.2
235 0.25
236 0.32
237 0.33
238 0.4
239 0.45
240 0.45
241 0.5
242 0.46
243 0.49
244 0.52
245 0.56
246 0.53
247 0.52
248 0.54
249 0.5
250 0.44
251 0.41
252 0.33
253 0.28
254 0.27
255 0.25
256 0.21
257 0.19