Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DZQ6

Protein Details
Accession C5DZQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-246KEAISKKMKKEQNKKKKENGKPKQPRSGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-244SKKMKKEQNKKKKENGKPKQPRS
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.833, mito_nucl 10.499, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG zro:ZYRO0G06402g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MTDAFDQALENPETASQIHLPTNDVDLGDLGSDESSSSSYESEDSDEEEEEVAEYGDAEEEEEGGGGDVIKSKHEVTEEQVPDLPDDYEIPESATISPIGKIKSAFDNNIIIEAVVSGEKRVLKEGSILCLEDKSLIGILCEVFGPLQKPFYRVALPVSKKERFDQLKEQLGSNVCIVVPEAHWVDTFELKKLKGTDASNGYDEELPEEEQEFSDDEKEAISKKMKKEQNKKKKENGKPKQPRSGGVDKIPNNLQSMKVPQAMTSVSYRSRNSRQAPQQSPPAAYEQPHHQYQPPRPRPQAIPQPQLPPQTQQPIYQPPPTPYNYGVPYVQQSPSFQQPPSFQQPPSFQPFVSPYPQPQPLYQAPMYYPPQPQPQFPMPGPAPGPGPAPAPVQQNMQQVLQLHQLLVQQQQQQQQQQQGQNQHFNYDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.14
4 0.17
5 0.19
6 0.2
7 0.21
8 0.21
9 0.24
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.14
14 0.13
15 0.11
16 0.1
17 0.07
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.12
30 0.12
31 0.14
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.13
37 0.11
38 0.1
39 0.08
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.04
52 0.05
53 0.04
54 0.05
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.12
59 0.12
60 0.14
61 0.16
62 0.18
63 0.19
64 0.29
65 0.29
66 0.29
67 0.31
68 0.29
69 0.28
70 0.27
71 0.23
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.14
86 0.14
87 0.15
88 0.15
89 0.17
90 0.24
91 0.28
92 0.28
93 0.27
94 0.29
95 0.28
96 0.28
97 0.26
98 0.17
99 0.13
100 0.11
101 0.09
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.08
106 0.1
107 0.1
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.19
112 0.2
113 0.21
114 0.21
115 0.21
116 0.18
117 0.18
118 0.18
119 0.12
120 0.11
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.12
135 0.13
136 0.15
137 0.16
138 0.19
139 0.2
140 0.19
141 0.24
142 0.28
143 0.3
144 0.35
145 0.41
146 0.42
147 0.42
148 0.43
149 0.47
150 0.43
151 0.46
152 0.48
153 0.48
154 0.52
155 0.51
156 0.5
157 0.44
158 0.4
159 0.36
160 0.27
161 0.2
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.16
177 0.16
178 0.18
179 0.19
180 0.19
181 0.2
182 0.2
183 0.23
184 0.25
185 0.27
186 0.25
187 0.24
188 0.24
189 0.19
190 0.18
191 0.14
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.1
208 0.15
209 0.2
210 0.23
211 0.32
212 0.38
213 0.47
214 0.57
215 0.66
216 0.71
217 0.77
218 0.82
219 0.83
220 0.88
221 0.88
222 0.89
223 0.87
224 0.88
225 0.87
226 0.87
227 0.87
228 0.78
229 0.72
230 0.68
231 0.65
232 0.57
233 0.52
234 0.52
235 0.43
236 0.45
237 0.43
238 0.36
239 0.3
240 0.28
241 0.24
242 0.18
243 0.2
244 0.2
245 0.22
246 0.2
247 0.19
248 0.19
249 0.19
250 0.18
251 0.17
252 0.16
253 0.16
254 0.2
255 0.21
256 0.25
257 0.31
258 0.38
259 0.41
260 0.48
261 0.53
262 0.6
263 0.63
264 0.61
265 0.63
266 0.57
267 0.54
268 0.46
269 0.41
270 0.33
271 0.29
272 0.27
273 0.26
274 0.28
275 0.29
276 0.29
277 0.3
278 0.36
279 0.44
280 0.53
281 0.56
282 0.6
283 0.61
284 0.65
285 0.65
286 0.67
287 0.69
288 0.66
289 0.64
290 0.6
291 0.62
292 0.61
293 0.61
294 0.53
295 0.46
296 0.42
297 0.43
298 0.4
299 0.37
300 0.38
301 0.43
302 0.45
303 0.48
304 0.46
305 0.4
306 0.44
307 0.44
308 0.42
309 0.35
310 0.37
311 0.33
312 0.33
313 0.3
314 0.26
315 0.27
316 0.27
317 0.26
318 0.22
319 0.22
320 0.23
321 0.3
322 0.31
323 0.29
324 0.3
325 0.32
326 0.38
327 0.44
328 0.44
329 0.38
330 0.41
331 0.45
332 0.47
333 0.51
334 0.45
335 0.36
336 0.36
337 0.4
338 0.38
339 0.38
340 0.34
341 0.31
342 0.36
343 0.43
344 0.41
345 0.37
346 0.4
347 0.39
348 0.44
349 0.41
350 0.36
351 0.31
352 0.36
353 0.38
354 0.35
355 0.36
356 0.33
357 0.43
358 0.43
359 0.43
360 0.44
361 0.48
362 0.49
363 0.45
364 0.49
365 0.4
366 0.43
367 0.42
368 0.36
369 0.31
370 0.26
371 0.28
372 0.2
373 0.21
374 0.18
375 0.2
376 0.23
377 0.25
378 0.26
379 0.29
380 0.34
381 0.38
382 0.39
383 0.36
384 0.34
385 0.31
386 0.32
387 0.33
388 0.28
389 0.21
390 0.21
391 0.23
392 0.23
393 0.26
394 0.29
395 0.3
396 0.34
397 0.42
398 0.46
399 0.52
400 0.55
401 0.6
402 0.62
403 0.63
404 0.65
405 0.68
406 0.69
407 0.7
408 0.64