Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DY27

Protein Details
Accession C5DY27    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MTAMKRGRGRPRKNESKANETPKVSHydrophilic
49-71VVEATRRRPRRTAARKVTPDPEAHydrophilic
91-116DVDEETQKPDKRRKTRSPKTSIEINSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-15KRGRGRPRKNE
55-59RRPRR
101-106KRRKTR
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG zro:ZYRO0F09746g  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MTAMKRGRGRPRKNESKANETPKVSSKSSENDDNNNGNNDNIGIIKSAVVEATRRRPRRTAARKVTPDPEAELGVQLDKEDEDEEFVPEVDVDEETQKPDKRRKTRSPKTSIEINSSKVQQRGSNLERKGKIIRALKDLSSARDKIERIYGLNEHKLLRLAKVKEGFEPYLFCFPSEMIQRDSPYYVDCKPPCSIDNVYDKVIPSTSSLKFHDIDVKELDQIFTKNKKEHKIIINESETALQSEQSMEFPVLPYGKRHGFVYNSGGFITDMAWLSQDESDDQYLAVALSQYFERPSDSHLRMFESESHTSCIEIFRLNTNTLKFTKLQTLAHSFGEIWNLKWHEGCEKNGVLGVLAFVCQNGSFKLTEVTVPNDDSHVVRFFDEASLSVSMPNTNITCYDFLSPTSIICGFKNGFVAEFDLTDPEFPSYYHKMHDSYVISICVASSETERTTVGTLSVDGYFYIFDAKEIFTSKLEVTRFRGTNIIPIAYLPQLYAFVHSDGTNSLKTVVPRAAFGMHTIALQETTIVSVGTSRLHPLVLNGSSDGNIAIDNVSRRVLTGIKNSSVAHCSLRLWKWEYSKREDKYRLNHNYEIYKPSINEISGVKIDAHGVNISCIKWNETSAAGQFYAFANSAGLLTIEKLGND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.86
3 0.86
4 0.85
5 0.83
6 0.8
7 0.72
8 0.68
9 0.67
10 0.65
11 0.57
12 0.51
13 0.47
14 0.46
15 0.5
16 0.55
17 0.5
18 0.51
19 0.56
20 0.58
21 0.56
22 0.52
23 0.46
24 0.36
25 0.33
26 0.26
27 0.2
28 0.16
29 0.13
30 0.1
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.13
38 0.19
39 0.29
40 0.39
41 0.45
42 0.5
43 0.55
44 0.63
45 0.71
46 0.75
47 0.76
48 0.77
49 0.81
50 0.84
51 0.85
52 0.81
53 0.74
54 0.65
55 0.57
56 0.49
57 0.39
58 0.32
59 0.27
60 0.21
61 0.19
62 0.16
63 0.12
64 0.11
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.1
70 0.11
71 0.13
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.1
81 0.11
82 0.14
83 0.2
84 0.25
85 0.31
86 0.4
87 0.49
88 0.57
89 0.67
90 0.75
91 0.8
92 0.87
93 0.9
94 0.91
95 0.88
96 0.83
97 0.82
98 0.74
99 0.72
100 0.64
101 0.57
102 0.52
103 0.49
104 0.48
105 0.42
106 0.41
107 0.35
108 0.36
109 0.41
110 0.43
111 0.47
112 0.48
113 0.54
114 0.53
115 0.54
116 0.54
117 0.49
118 0.51
119 0.5
120 0.49
121 0.47
122 0.49
123 0.45
124 0.48
125 0.45
126 0.42
127 0.4
128 0.37
129 0.32
130 0.34
131 0.34
132 0.29
133 0.33
134 0.3
135 0.25
136 0.28
137 0.32
138 0.31
139 0.35
140 0.35
141 0.3
142 0.29
143 0.32
144 0.29
145 0.28
146 0.31
147 0.29
148 0.33
149 0.38
150 0.38
151 0.38
152 0.42
153 0.39
154 0.32
155 0.33
156 0.28
157 0.29
158 0.28
159 0.24
160 0.2
161 0.18
162 0.22
163 0.25
164 0.25
165 0.22
166 0.24
167 0.26
168 0.27
169 0.27
170 0.23
171 0.19
172 0.2
173 0.19
174 0.25
175 0.24
176 0.26
177 0.27
178 0.29
179 0.28
180 0.29
181 0.29
182 0.26
183 0.34
184 0.33
185 0.33
186 0.32
187 0.31
188 0.27
189 0.25
190 0.2
191 0.15
192 0.18
193 0.18
194 0.21
195 0.22
196 0.25
197 0.25
198 0.25
199 0.31
200 0.26
201 0.27
202 0.26
203 0.25
204 0.23
205 0.23
206 0.22
207 0.15
208 0.16
209 0.19
210 0.23
211 0.26
212 0.3
213 0.36
214 0.42
215 0.45
216 0.51
217 0.53
218 0.55
219 0.56
220 0.58
221 0.54
222 0.48
223 0.44
224 0.38
225 0.3
226 0.22
227 0.17
228 0.1
229 0.08
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.14
242 0.16
243 0.17
244 0.18
245 0.19
246 0.2
247 0.22
248 0.26
249 0.23
250 0.21
251 0.2
252 0.2
253 0.16
254 0.15
255 0.13
256 0.08
257 0.07
258 0.06
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.03
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.11
283 0.19
284 0.21
285 0.23
286 0.23
287 0.25
288 0.25
289 0.26
290 0.25
291 0.23
292 0.23
293 0.21
294 0.22
295 0.2
296 0.19
297 0.18
298 0.15
299 0.11
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.13
304 0.14
305 0.16
306 0.16
307 0.18
308 0.18
309 0.2
310 0.17
311 0.17
312 0.21
313 0.22
314 0.22
315 0.22
316 0.26
317 0.26
318 0.25
319 0.24
320 0.18
321 0.16
322 0.2
323 0.17
324 0.12
325 0.15
326 0.16
327 0.15
328 0.16
329 0.16
330 0.18
331 0.2
332 0.21
333 0.21
334 0.21
335 0.2
336 0.21
337 0.2
338 0.13
339 0.1
340 0.09
341 0.04
342 0.05
343 0.04
344 0.03
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.05
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.1
355 0.11
356 0.13
357 0.13
358 0.14
359 0.14
360 0.13
361 0.14
362 0.12
363 0.13
364 0.12
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.08
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.1
385 0.11
386 0.12
387 0.11
388 0.11
389 0.14
390 0.13
391 0.11
392 0.12
393 0.13
394 0.12
395 0.12
396 0.15
397 0.13
398 0.14
399 0.16
400 0.14
401 0.12
402 0.12
403 0.14
404 0.1
405 0.1
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.13
415 0.16
416 0.17
417 0.19
418 0.2
419 0.21
420 0.22
421 0.27
422 0.23
423 0.22
424 0.22
425 0.21
426 0.19
427 0.17
428 0.16
429 0.11
430 0.09
431 0.07
432 0.07
433 0.09
434 0.09
435 0.1
436 0.11
437 0.11
438 0.11
439 0.11
440 0.1
441 0.08
442 0.08
443 0.09
444 0.09
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.08
451 0.06
452 0.06
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.12
457 0.13
458 0.11
459 0.14
460 0.15
461 0.18
462 0.2
463 0.21
464 0.25
465 0.31
466 0.31
467 0.3
468 0.34
469 0.29
470 0.33
471 0.32
472 0.27
473 0.19
474 0.19
475 0.2
476 0.17
477 0.16
478 0.1
479 0.08
480 0.09
481 0.09
482 0.12
483 0.11
484 0.11
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.12
489 0.15
490 0.13
491 0.12
492 0.13
493 0.14
494 0.14
495 0.18
496 0.2
497 0.18
498 0.19
499 0.2
500 0.2
501 0.18
502 0.19
503 0.17
504 0.14
505 0.13
506 0.13
507 0.11
508 0.1
509 0.09
510 0.08
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.06
517 0.07
518 0.08
519 0.09
520 0.1
521 0.11
522 0.11
523 0.12
524 0.13
525 0.18
526 0.18
527 0.18
528 0.17
529 0.17
530 0.17
531 0.17
532 0.15
533 0.09
534 0.08
535 0.07
536 0.06
537 0.09
538 0.1
539 0.11
540 0.12
541 0.12
542 0.12
543 0.14
544 0.17
545 0.19
546 0.27
547 0.31
548 0.32
549 0.35
550 0.35
551 0.36
552 0.35
553 0.32
554 0.26
555 0.22
556 0.22
557 0.28
558 0.31
559 0.34
560 0.36
561 0.4
562 0.47
563 0.55
564 0.59
565 0.6
566 0.66
567 0.66
568 0.72
569 0.75
570 0.74
571 0.74
572 0.78
573 0.79
574 0.76
575 0.75
576 0.7
577 0.69
578 0.64
579 0.6
580 0.53
581 0.46
582 0.4
583 0.39
584 0.37
585 0.3
586 0.29
587 0.25
588 0.26
589 0.23
590 0.24
591 0.2
592 0.17
593 0.19
594 0.17
595 0.18
596 0.16
597 0.15
598 0.17
599 0.19
600 0.19
601 0.22
602 0.22
603 0.24
604 0.23
605 0.24
606 0.23
607 0.23
608 0.26
609 0.23
610 0.26
611 0.23
612 0.21
613 0.21
614 0.19
615 0.19
616 0.16
617 0.14
618 0.1
619 0.1
620 0.11
621 0.1
622 0.09
623 0.07
624 0.08
625 0.11