Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DWN7

Protein Details
Accession C5DWN7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-65ESDLKREVKKLQRLREQIKSWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
272-288SKKEQRKLEREAKKAAK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR012270  CCR4-NOT_su3/5  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
IPR007207  Not_N  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG zro:ZYRO0D16302g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
PF04065  Not3  
Amino Acid Sequences MAHRKLQQEIDRVFKKINEGLEIFDTYYERHENCTNNPSQKDKLESDLKREVKKLQRLREQIKSWQSSPDIKDKDSLLDYRRSVEIAMEKYKAVEKASKEKAYSNISLKKSDMLDPKERERRDVSEFLSNDIEELERQYDSLQVEVDKLILLNKKKKTASSSNDDKKDKLKTLQSRYRWHQQQMELALRLLANEELDPEDVREIQDDISYFVDSNQEPDFVEDETIYDQLNLQSNEAIAHEVAQYFASQQAEEAEDDDASTVTTTKDGTKLSKKEQRKLEREAKKAAKSASRLPDADVSPSNGPSSPILSTTSTATVTTEIAEPPSSKQSKSPSPALDVVESSHSVMTTAPSTAKSPNGYNSSAPSTAPTEVEEHQVVHTHIHQSQNGITTTSTLKPATVPARPAGDLKWAVAASQGVEKDKKNNSHGGSNTTTGTSTPSAAATATAAHAAATGSTTASSNVSSRINSAANTPRLGTPSLATPTLAQHLEKSALTNSNANSAATAAAVLAAGAAAVNTNNKAIYKNGHSSMPTTATSALAHGNETHAEGEKNFNEKSTDIPPVVVDDYQSDVTDDELEQEPQPEPLSQDELRRREETREKLRKDFVQDFDLLVLPSGIQEFIMGAELFDNKIEAPDGKMGGYRRSRDECRIPRFDDVPLGVNPPAPLDAFRSTEQWDILRCSLRPIIQNSELNDQEKYEAILENFRSLEMFTLFYNYYFAVTPLEQEIASIILSERDWKVSKNCAMWFLRQSETKFANELCEVADYKIFKLDDWTVIDRLNFKLDYAALKNPSLVADSQLPKAQETDVLSHGQQLLQQLKQGGKSSILA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.46
3 0.41
4 0.4
5 0.36
6 0.33
7 0.34
8 0.35
9 0.34
10 0.28
11 0.25
12 0.23
13 0.17
14 0.21
15 0.22
16 0.2
17 0.23
18 0.28
19 0.31
20 0.36
21 0.44
22 0.48
23 0.51
24 0.56
25 0.57
26 0.58
27 0.59
28 0.6
29 0.54
30 0.54
31 0.56
32 0.54
33 0.56
34 0.6
35 0.61
36 0.59
37 0.6
38 0.61
39 0.61
40 0.68
41 0.7
42 0.7
43 0.73
44 0.78
45 0.82
46 0.83
47 0.79
48 0.78
49 0.78
50 0.74
51 0.65
52 0.62
53 0.59
54 0.57
55 0.56
56 0.57
57 0.51
58 0.46
59 0.48
60 0.43
61 0.43
62 0.4
63 0.4
64 0.35
65 0.38
66 0.38
67 0.38
68 0.37
69 0.33
70 0.29
71 0.27
72 0.29
73 0.28
74 0.31
75 0.29
76 0.28
77 0.29
78 0.33
79 0.31
80 0.27
81 0.28
82 0.29
83 0.38
84 0.47
85 0.5
86 0.48
87 0.5
88 0.53
89 0.54
90 0.54
91 0.53
92 0.52
93 0.5
94 0.51
95 0.48
96 0.46
97 0.42
98 0.43
99 0.43
100 0.42
101 0.48
102 0.51
103 0.6
104 0.64
105 0.63
106 0.61
107 0.57
108 0.55
109 0.53
110 0.53
111 0.47
112 0.47
113 0.46
114 0.44
115 0.41
116 0.35
117 0.28
118 0.23
119 0.2
120 0.12
121 0.13
122 0.12
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.13
127 0.13
128 0.14
129 0.13
130 0.11
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.09
135 0.08
136 0.12
137 0.17
138 0.24
139 0.31
140 0.36
141 0.43
142 0.46
143 0.5
144 0.54
145 0.58
146 0.59
147 0.6
148 0.66
149 0.68
150 0.74
151 0.72
152 0.66
153 0.62
154 0.62
155 0.58
156 0.54
157 0.54
158 0.55
159 0.63
160 0.7
161 0.73
162 0.75
163 0.76
164 0.8
165 0.77
166 0.74
167 0.71
168 0.65
169 0.64
170 0.61
171 0.59
172 0.5
173 0.42
174 0.37
175 0.29
176 0.25
177 0.19
178 0.13
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.13
200 0.12
201 0.14
202 0.13
203 0.12
204 0.12
205 0.14
206 0.14
207 0.11
208 0.12
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.08
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.15
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.1
254 0.12
255 0.18
256 0.26
257 0.31
258 0.39
259 0.48
260 0.54
261 0.59
262 0.67
263 0.72
264 0.7
265 0.74
266 0.76
267 0.76
268 0.74
269 0.75
270 0.72
271 0.66
272 0.63
273 0.58
274 0.53
275 0.48
276 0.51
277 0.48
278 0.45
279 0.41
280 0.39
281 0.4
282 0.35
283 0.34
284 0.27
285 0.23
286 0.2
287 0.2
288 0.19
289 0.14
290 0.15
291 0.12
292 0.13
293 0.1
294 0.1
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.14
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.18
313 0.19
314 0.18
315 0.22
316 0.27
317 0.34
318 0.38
319 0.42
320 0.36
321 0.38
322 0.41
323 0.39
324 0.33
325 0.26
326 0.22
327 0.18
328 0.16
329 0.13
330 0.09
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.09
340 0.11
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.19
345 0.22
346 0.23
347 0.22
348 0.23
349 0.24
350 0.22
351 0.21
352 0.17
353 0.15
354 0.15
355 0.14
356 0.13
357 0.12
358 0.13
359 0.15
360 0.14
361 0.13
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.11
366 0.12
367 0.12
368 0.14
369 0.16
370 0.16
371 0.16
372 0.17
373 0.19
374 0.18
375 0.16
376 0.13
377 0.12
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.11
382 0.11
383 0.1
384 0.15
385 0.16
386 0.16
387 0.17
388 0.16
389 0.18
390 0.19
391 0.19
392 0.16
393 0.17
394 0.15
395 0.14
396 0.14
397 0.12
398 0.11
399 0.11
400 0.11
401 0.07
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.11
406 0.12
407 0.17
408 0.22
409 0.26
410 0.27
411 0.32
412 0.33
413 0.36
414 0.37
415 0.36
416 0.33
417 0.3
418 0.28
419 0.22
420 0.2
421 0.14
422 0.15
423 0.11
424 0.09
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.16
456 0.2
457 0.21
458 0.21
459 0.21
460 0.2
461 0.21
462 0.21
463 0.18
464 0.12
465 0.13
466 0.14
467 0.14
468 0.13
469 0.12
470 0.12
471 0.14
472 0.15
473 0.11
474 0.1
475 0.11
476 0.13
477 0.12
478 0.12
479 0.11
480 0.13
481 0.14
482 0.16
483 0.15
484 0.18
485 0.18
486 0.17
487 0.15
488 0.13
489 0.12
490 0.09
491 0.08
492 0.04
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.02
497 0.02
498 0.02
499 0.02
500 0.02
501 0.02
502 0.02
503 0.03
504 0.04
505 0.04
506 0.05
507 0.06
508 0.07
509 0.08
510 0.12
511 0.17
512 0.21
513 0.23
514 0.24
515 0.24
516 0.25
517 0.26
518 0.25
519 0.2
520 0.17
521 0.16
522 0.14
523 0.14
524 0.13
525 0.12
526 0.09
527 0.1
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.09
536 0.13
537 0.15
538 0.18
539 0.17
540 0.17
541 0.18
542 0.18
543 0.2
544 0.2
545 0.21
546 0.18
547 0.18
548 0.17
549 0.18
550 0.19
551 0.15
552 0.12
553 0.09
554 0.12
555 0.12
556 0.12
557 0.1
558 0.09
559 0.09
560 0.1
561 0.09
562 0.09
563 0.1
564 0.11
565 0.11
566 0.12
567 0.12
568 0.12
569 0.13
570 0.11
571 0.11
572 0.12
573 0.17
574 0.17
575 0.25
576 0.32
577 0.35
578 0.39
579 0.41
580 0.41
581 0.43
582 0.51
583 0.52
584 0.56
585 0.62
586 0.62
587 0.65
588 0.7
589 0.66
590 0.65
591 0.63
592 0.55
593 0.49
594 0.45
595 0.39
596 0.34
597 0.31
598 0.22
599 0.15
600 0.11
601 0.07
602 0.06
603 0.06
604 0.05
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.06
610 0.06
611 0.05
612 0.06
613 0.07
614 0.07
615 0.07
616 0.07
617 0.05
618 0.06
619 0.07
620 0.07
621 0.09
622 0.12
623 0.12
624 0.12
625 0.16
626 0.17
627 0.24
628 0.3
629 0.31
630 0.35
631 0.41
632 0.45
633 0.5
634 0.59
635 0.61
636 0.63
637 0.67
638 0.63
639 0.61
640 0.59
641 0.52
642 0.46
643 0.38
644 0.33
645 0.27
646 0.26
647 0.22
648 0.21
649 0.19
650 0.16
651 0.15
652 0.12
653 0.12
654 0.14
655 0.17
656 0.19
657 0.2
658 0.21
659 0.23
660 0.25
661 0.25
662 0.23
663 0.22
664 0.23
665 0.25
666 0.27
667 0.25
668 0.27
669 0.3
670 0.31
671 0.34
672 0.35
673 0.38
674 0.41
675 0.45
676 0.44
677 0.47
678 0.46
679 0.42
680 0.37
681 0.31
682 0.25
683 0.22
684 0.2
685 0.15
686 0.14
687 0.14
688 0.19
689 0.19
690 0.21
691 0.2
692 0.19
693 0.18
694 0.15
695 0.17
696 0.12
697 0.12
698 0.1
699 0.13
700 0.14
701 0.14
702 0.15
703 0.12
704 0.13
705 0.12
706 0.12
707 0.12
708 0.12
709 0.13
710 0.14
711 0.15
712 0.13
713 0.12
714 0.12
715 0.1
716 0.09
717 0.08
718 0.07
719 0.07
720 0.08
721 0.12
722 0.12
723 0.17
724 0.18
725 0.21
726 0.26
727 0.33
728 0.39
729 0.41
730 0.43
731 0.46
732 0.48
733 0.5
734 0.51
735 0.47
736 0.46
737 0.46
738 0.46
739 0.46
740 0.46
741 0.42
742 0.39
743 0.35
744 0.35
745 0.3
746 0.27
747 0.2
748 0.2
749 0.2
750 0.18
751 0.21
752 0.18
753 0.18
754 0.23
755 0.22
756 0.19
757 0.23
758 0.25
759 0.26
760 0.31
761 0.34
762 0.29
763 0.31
764 0.33
765 0.3
766 0.29
767 0.29
768 0.23
769 0.2
770 0.21
771 0.21
772 0.25
773 0.27
774 0.32
775 0.3
776 0.3
777 0.31
778 0.29
779 0.28
780 0.24
781 0.21
782 0.18
783 0.23
784 0.25
785 0.28
786 0.31
787 0.31
788 0.29
789 0.3
790 0.27
791 0.23
792 0.24
793 0.24
794 0.23
795 0.26
796 0.25
797 0.27
798 0.27
799 0.23
800 0.22
801 0.25
802 0.27
803 0.25
804 0.29
805 0.29
806 0.32
807 0.36
808 0.38
809 0.33