Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DZ47

Protein Details
Accession C5DZ47    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-56QISSWKQRLSAKKGKNNTGSQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12.333, cyto 7.5, cyto_pero 4.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013929  RNA_pol_II_AP1_C  
IPR013930  RNA_pol_II_AP1_N  
IPR039913  RPAP1/Rba50  
Gene Ontology GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG zro:ZYRO0F18150g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08620  RPAP1_C  
PF08621  RPAP1_N  
Amino Acid Sequences MDLLGDIVEKDTTNDNNTDAVNCDVHGFPEPFRPKQISSWKQRLSAKKGKNNTGSQPLPSEAPSKPSNPTSAAQSIHEENLQALKQMSPEAIEKERNELMESLDPKLVQKLIRNMEKRASENQQTLFPEVEGAPGTWVGGNRENGELPSLSDEQVDKALGIQSNSKPKEKSVSFAEEPSETPSQLPPKESLQDLDEDDVAPLDFQAAQSVDHMANQELFQDVHFMKPEESEEEKLRLDDPDFDSKLHDKFFPDLPKDVEKLKWMQPLPETKPGDTVIEDVSQCRFDFNGNLVPPTREITSTVHSALHHHSDDPQLAGYTIPELQRLSRSTFPAQRAIAVQTLGRILYKLGKQSYYQLVPEVDPETYKEEGSAQGVINKIYSMFWDLCNDCRIIDCLQDAADETKTRHISVRNYALEALWLWKTGGGDFRGKSPNSYNEDNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.23
4 0.23
5 0.23
6 0.21
7 0.21
8 0.18
9 0.17
10 0.18
11 0.16
12 0.17
13 0.21
14 0.2
15 0.18
16 0.28
17 0.34
18 0.34
19 0.4
20 0.43
21 0.4
22 0.48
23 0.58
24 0.58
25 0.62
26 0.7
27 0.69
28 0.72
29 0.78
30 0.78
31 0.77
32 0.77
33 0.77
34 0.76
35 0.8
36 0.82
37 0.82
38 0.79
39 0.77
40 0.76
41 0.68
42 0.62
43 0.56
44 0.48
45 0.41
46 0.36
47 0.33
48 0.24
49 0.27
50 0.28
51 0.27
52 0.3
53 0.31
54 0.33
55 0.32
56 0.33
57 0.34
58 0.35
59 0.35
60 0.32
61 0.33
62 0.31
63 0.29
64 0.28
65 0.21
66 0.17
67 0.2
68 0.18
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.14
75 0.12
76 0.14
77 0.17
78 0.2
79 0.25
80 0.25
81 0.29
82 0.3
83 0.29
84 0.28
85 0.24
86 0.23
87 0.24
88 0.26
89 0.23
90 0.22
91 0.22
92 0.21
93 0.22
94 0.22
95 0.18
96 0.22
97 0.28
98 0.35
99 0.44
100 0.46
101 0.47
102 0.51
103 0.53
104 0.51
105 0.49
106 0.47
107 0.44
108 0.46
109 0.44
110 0.43
111 0.4
112 0.38
113 0.32
114 0.25
115 0.21
116 0.17
117 0.16
118 0.11
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.1
126 0.14
127 0.15
128 0.16
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.18
133 0.15
134 0.11
135 0.14
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.13
142 0.12
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.14
149 0.18
150 0.27
151 0.3
152 0.33
153 0.31
154 0.31
155 0.39
156 0.35
157 0.35
158 0.31
159 0.36
160 0.34
161 0.34
162 0.35
163 0.27
164 0.27
165 0.27
166 0.22
167 0.15
168 0.15
169 0.16
170 0.2
171 0.2
172 0.21
173 0.19
174 0.21
175 0.22
176 0.22
177 0.21
178 0.16
179 0.17
180 0.16
181 0.15
182 0.12
183 0.1
184 0.1
185 0.09
186 0.07
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.06
205 0.07
206 0.06
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.14
217 0.16
218 0.17
219 0.18
220 0.18
221 0.18
222 0.18
223 0.15
224 0.13
225 0.15
226 0.17
227 0.21
228 0.22
229 0.21
230 0.23
231 0.25
232 0.26
233 0.23
234 0.21
235 0.15
236 0.17
237 0.22
238 0.26
239 0.26
240 0.26
241 0.28
242 0.29
243 0.3
244 0.29
245 0.25
246 0.22
247 0.24
248 0.27
249 0.3
250 0.28
251 0.29
252 0.31
253 0.38
254 0.41
255 0.46
256 0.43
257 0.36
258 0.38
259 0.37
260 0.33
261 0.25
262 0.22
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.1
272 0.09
273 0.11
274 0.13
275 0.18
276 0.17
277 0.19
278 0.2
279 0.2
280 0.2
281 0.21
282 0.19
283 0.13
284 0.15
285 0.16
286 0.18
287 0.19
288 0.2
289 0.19
290 0.18
291 0.21
292 0.21
293 0.23
294 0.21
295 0.19
296 0.2
297 0.21
298 0.22
299 0.2
300 0.17
301 0.13
302 0.12
303 0.12
304 0.09
305 0.08
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.12
311 0.17
312 0.19
313 0.22
314 0.24
315 0.28
316 0.33
317 0.39
318 0.41
319 0.43
320 0.41
321 0.37
322 0.35
323 0.33
324 0.28
325 0.22
326 0.19
327 0.14
328 0.15
329 0.13
330 0.11
331 0.09
332 0.09
333 0.14
334 0.17
335 0.22
336 0.24
337 0.25
338 0.26
339 0.32
340 0.38
341 0.35
342 0.33
343 0.3
344 0.29
345 0.27
346 0.29
347 0.25
348 0.18
349 0.15
350 0.16
351 0.17
352 0.17
353 0.16
354 0.14
355 0.14
356 0.15
357 0.17
358 0.17
359 0.14
360 0.16
361 0.17
362 0.17
363 0.16
364 0.14
365 0.13
366 0.11
367 0.11
368 0.13
369 0.13
370 0.14
371 0.2
372 0.22
373 0.24
374 0.26
375 0.25
376 0.21
377 0.21
378 0.22
379 0.18
380 0.19
381 0.17
382 0.15
383 0.15
384 0.15
385 0.15
386 0.15
387 0.17
388 0.17
389 0.18
390 0.25
391 0.26
392 0.27
393 0.31
394 0.34
395 0.38
396 0.45
397 0.53
398 0.48
399 0.48
400 0.48
401 0.43
402 0.38
403 0.32
404 0.26
405 0.18
406 0.15
407 0.14
408 0.15
409 0.15
410 0.16
411 0.21
412 0.21
413 0.27
414 0.27
415 0.33
416 0.39
417 0.4
418 0.42
419 0.44
420 0.49
421 0.49