Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DV69

Protein Details
Accession C5DV69    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
274-295AQKAREERSRQRNKRSHRAIDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
250-259LKAEAKKQIA
261-291DENREKGEKLRILAQKAREERSRQRNKRSHR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG zro:ZYRO0D04334g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MSFTSLLPAPKHSQSVPEDNFNAEQKNKELAVRALTHQKDEQDIERSVFDSAITNNLKFQDFVPIRQKDFGLQIPLPSQNEIDETYRRTKGIFEQILLKNTQPEAATIRNNQRALENTQEILVHSTGGKSNRKLKVIEHAKDPLQPNAHRAKKVVAPPVDEPMTPIFHKTDSVETAKKVSKEEKDMWKIPPAISSWKNPNGYTIGIDKRLAMDGRYNKDKMQAHEINDGFSQLSAALEMADRKARQELKLKAEAKKQIAEDENREKGEKLRILAQKAREERSRQRNKRSHRAIDDGYNNEATHREAIRKSRREELERDIRKSKMSTADRLRELAYSQGREVSEKVVLGAAKSTNSSGAHYDSRLFTKGANTQAKRGEGQVYDNPLFSQLGSSYRANLNKLDKDVEDEASMSAGQTKPIEFTAATDNNDADKEKEEHKEYGLSKKDDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.49
3 0.48
4 0.5
5 0.47
6 0.46
7 0.49
8 0.44
9 0.43
10 0.36
11 0.35
12 0.31
13 0.35
14 0.33
15 0.32
16 0.33
17 0.31
18 0.34
19 0.34
20 0.36
21 0.4
22 0.4
23 0.42
24 0.41
25 0.39
26 0.38
27 0.38
28 0.38
29 0.34
30 0.35
31 0.32
32 0.3
33 0.29
34 0.25
35 0.22
36 0.17
37 0.14
38 0.12
39 0.19
40 0.21
41 0.2
42 0.22
43 0.24
44 0.25
45 0.23
46 0.23
47 0.26
48 0.25
49 0.31
50 0.38
51 0.41
52 0.42
53 0.44
54 0.44
55 0.36
56 0.39
57 0.36
58 0.33
59 0.29
60 0.29
61 0.3
62 0.33
63 0.32
64 0.28
65 0.25
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.2
71 0.23
72 0.28
73 0.29
74 0.29
75 0.27
76 0.28
77 0.31
78 0.38
79 0.36
80 0.31
81 0.38
82 0.42
83 0.45
84 0.43
85 0.37
86 0.29
87 0.27
88 0.28
89 0.19
90 0.17
91 0.18
92 0.21
93 0.25
94 0.29
95 0.37
96 0.41
97 0.41
98 0.4
99 0.39
100 0.39
101 0.39
102 0.39
103 0.33
104 0.26
105 0.27
106 0.26
107 0.24
108 0.22
109 0.18
110 0.11
111 0.09
112 0.1
113 0.13
114 0.19
115 0.23
116 0.26
117 0.35
118 0.4
119 0.43
120 0.43
121 0.41
122 0.46
123 0.51
124 0.49
125 0.45
126 0.44
127 0.42
128 0.46
129 0.47
130 0.41
131 0.37
132 0.35
133 0.36
134 0.42
135 0.46
136 0.41
137 0.41
138 0.39
139 0.39
140 0.44
141 0.46
142 0.39
143 0.37
144 0.37
145 0.41
146 0.38
147 0.32
148 0.27
149 0.21
150 0.21
151 0.18
152 0.18
153 0.14
154 0.13
155 0.15
156 0.14
157 0.15
158 0.16
159 0.2
160 0.21
161 0.21
162 0.25
163 0.27
164 0.27
165 0.27
166 0.29
167 0.29
168 0.33
169 0.4
170 0.44
171 0.48
172 0.51
173 0.5
174 0.49
175 0.47
176 0.41
177 0.36
178 0.29
179 0.29
180 0.28
181 0.3
182 0.31
183 0.35
184 0.37
185 0.34
186 0.34
187 0.3
188 0.27
189 0.25
190 0.23
191 0.19
192 0.19
193 0.19
194 0.17
195 0.16
196 0.17
197 0.15
198 0.11
199 0.15
200 0.19
201 0.24
202 0.28
203 0.28
204 0.27
205 0.34
206 0.36
207 0.32
208 0.36
209 0.35
210 0.34
211 0.4
212 0.4
213 0.34
214 0.3
215 0.28
216 0.19
217 0.15
218 0.12
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.14
231 0.16
232 0.2
233 0.28
234 0.33
235 0.37
236 0.46
237 0.49
238 0.49
239 0.53
240 0.55
241 0.49
242 0.46
243 0.41
244 0.37
245 0.37
246 0.36
247 0.36
248 0.37
249 0.37
250 0.34
251 0.35
252 0.31
253 0.29
254 0.33
255 0.29
256 0.23
257 0.28
258 0.31
259 0.35
260 0.39
261 0.42
262 0.42
263 0.44
264 0.48
265 0.44
266 0.47
267 0.52
268 0.59
269 0.65
270 0.65
271 0.72
272 0.76
273 0.8
274 0.84
275 0.84
276 0.82
277 0.76
278 0.75
279 0.67
280 0.65
281 0.62
282 0.53
283 0.46
284 0.38
285 0.32
286 0.26
287 0.24
288 0.18
289 0.17
290 0.15
291 0.18
292 0.2
293 0.3
294 0.4
295 0.46
296 0.48
297 0.53
298 0.58
299 0.6
300 0.61
301 0.6
302 0.61
303 0.6
304 0.63
305 0.58
306 0.53
307 0.5
308 0.47
309 0.43
310 0.42
311 0.4
312 0.43
313 0.48
314 0.54
315 0.53
316 0.53
317 0.49
318 0.39
319 0.36
320 0.34
321 0.3
322 0.24
323 0.23
324 0.25
325 0.25
326 0.26
327 0.26
328 0.21
329 0.17
330 0.16
331 0.15
332 0.14
333 0.13
334 0.12
335 0.14
336 0.12
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.14
342 0.15
343 0.15
344 0.18
345 0.2
346 0.2
347 0.22
348 0.22
349 0.24
350 0.24
351 0.23
352 0.2
353 0.23
354 0.27
355 0.34
356 0.41
357 0.4
358 0.44
359 0.49
360 0.5
361 0.46
362 0.43
363 0.39
364 0.3
365 0.35
366 0.34
367 0.36
368 0.34
369 0.34
370 0.31
371 0.28
372 0.26
373 0.21
374 0.18
375 0.11
376 0.13
377 0.17
378 0.18
379 0.19
380 0.25
381 0.29
382 0.29
383 0.33
384 0.38
385 0.39
386 0.42
387 0.42
388 0.36
389 0.39
390 0.39
391 0.35
392 0.28
393 0.24
394 0.21
395 0.18
396 0.18
397 0.12
398 0.14
399 0.12
400 0.14
401 0.14
402 0.15
403 0.16
404 0.17
405 0.19
406 0.14
407 0.17
408 0.24
409 0.27
410 0.28
411 0.28
412 0.28
413 0.27
414 0.29
415 0.28
416 0.2
417 0.21
418 0.22
419 0.27
420 0.34
421 0.37
422 0.38
423 0.39
424 0.46
425 0.44
426 0.5
427 0.53