Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DPN1

Protein Details
Accession C5DPN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
359-389RPIERRSTFPSNKQRFHKKRSVDRRVPNLGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
370-378NKQRFHKKR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR013632  DNA_recomb/repair_Rad51_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR020588  RecA_ATP-bd  
IPR047348  XRCC3-like_C  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140664  F:ATP-dependent DNA damage sensor activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0061982  P:meiosis I cell cycle process  
KEGG zro:ZYRO0A04708g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08423  Rad51  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50162  RECA_2  
CDD cd19491  XRCC3  
Amino Acid Sequences MDLYDELPQSSLLCDEEFTSLLDACKKYQVSVVDFLTLPSKELARQLQRSTNEVDKFQKSMIAEYDDQLMNFNEVKPISEVEGPVPFTTTDVGIDEALGGGIYTHGITEVFGESSTGKSQLLMQLCLSVQLPTNMGGIKGKCVYISTEGDLPTQRLASMISAREELVKHGVSQENVYTVTCCDLINQDHILNVQLPILLENSRGAIKLIIIDSISHHMRVELPTRDFKDHQDNRFYVDQVAERLLDLANKHALAVVVANQVSDRPLFESPEPYVAELTDYEYQLGWWVGWRNSSIIYHQKYNEPKNVNSDYQDNEDLLSDDEDGKLIHDEIARVENLSRTKAAKVTVANSEKALPPDKRPIERRSTFPSNKQRFHKKRSVDRRVPNLGLNWAKHLSSRILLSKSYRASPMIRRGELHLYKGSDPTTFWQVKRLFKVVFSAYADSKEIPFMITKRGLESSLGDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.14
7 0.13
8 0.15
9 0.2
10 0.2
11 0.2
12 0.27
13 0.26
14 0.25
15 0.29
16 0.33
17 0.32
18 0.37
19 0.36
20 0.32
21 0.32
22 0.31
23 0.31
24 0.25
25 0.22
26 0.17
27 0.17
28 0.16
29 0.22
30 0.3
31 0.34
32 0.41
33 0.45
34 0.51
35 0.52
36 0.54
37 0.54
38 0.53
39 0.48
40 0.46
41 0.47
42 0.43
43 0.42
44 0.39
45 0.37
46 0.3
47 0.3
48 0.28
49 0.27
50 0.25
51 0.24
52 0.29
53 0.25
54 0.25
55 0.23
56 0.2
57 0.17
58 0.17
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.16
63 0.16
64 0.17
65 0.17
66 0.18
67 0.18
68 0.17
69 0.2
70 0.2
71 0.18
72 0.18
73 0.16
74 0.14
75 0.14
76 0.12
77 0.1
78 0.09
79 0.1
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.06
85 0.05
86 0.04
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.09
102 0.11
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.11
107 0.16
108 0.17
109 0.17
110 0.16
111 0.17
112 0.17
113 0.18
114 0.16
115 0.12
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.1
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.13
124 0.13
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.14
130 0.16
131 0.17
132 0.18
133 0.17
134 0.19
135 0.19
136 0.21
137 0.21
138 0.19
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.15
154 0.13
155 0.12
156 0.15
157 0.17
158 0.16
159 0.16
160 0.15
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.1
171 0.11
172 0.13
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.11
179 0.1
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.1
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.12
207 0.16
208 0.17
209 0.19
210 0.23
211 0.26
212 0.29
213 0.28
214 0.29
215 0.36
216 0.38
217 0.4
218 0.42
219 0.39
220 0.4
221 0.41
222 0.38
223 0.28
224 0.23
225 0.2
226 0.14
227 0.15
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.1
254 0.11
255 0.14
256 0.14
257 0.18
258 0.18
259 0.16
260 0.15
261 0.13
262 0.13
263 0.1
264 0.13
265 0.11
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.07
273 0.07
274 0.1
275 0.1
276 0.12
277 0.13
278 0.12
279 0.14
280 0.14
281 0.16
282 0.22
283 0.24
284 0.27
285 0.28
286 0.34
287 0.4
288 0.45
289 0.49
290 0.45
291 0.44
292 0.47
293 0.5
294 0.45
295 0.4
296 0.38
297 0.32
298 0.32
299 0.31
300 0.24
301 0.19
302 0.18
303 0.16
304 0.14
305 0.12
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.13
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.14
323 0.15
324 0.17
325 0.18
326 0.17
327 0.19
328 0.21
329 0.22
330 0.22
331 0.23
332 0.24
333 0.31
334 0.33
335 0.32
336 0.3
337 0.31
338 0.29
339 0.29
340 0.33
341 0.26
342 0.28
343 0.37
344 0.43
345 0.49
346 0.54
347 0.58
348 0.61
349 0.63
350 0.64
351 0.63
352 0.67
353 0.65
354 0.68
355 0.72
356 0.72
357 0.75
358 0.79
359 0.81
360 0.81
361 0.84
362 0.83
363 0.82
364 0.83
365 0.87
366 0.89
367 0.87
368 0.87
369 0.87
370 0.86
371 0.78
372 0.71
373 0.62
374 0.59
375 0.55
376 0.46
377 0.42
378 0.35
379 0.33
380 0.31
381 0.31
382 0.26
383 0.22
384 0.26
385 0.27
386 0.28
387 0.3
388 0.33
389 0.37
390 0.38
391 0.38
392 0.36
393 0.34
394 0.37
395 0.43
396 0.49
397 0.51
398 0.49
399 0.48
400 0.5
401 0.57
402 0.54
403 0.5
404 0.46
405 0.41
406 0.4
407 0.42
408 0.38
409 0.29
410 0.27
411 0.27
412 0.31
413 0.33
414 0.31
415 0.37
416 0.42
417 0.49
418 0.54
419 0.56
420 0.48
421 0.44
422 0.5
423 0.44
424 0.44
425 0.4
426 0.37
427 0.32
428 0.34
429 0.34
430 0.29
431 0.26
432 0.22
433 0.19
434 0.16
435 0.19
436 0.18
437 0.24
438 0.28
439 0.28
440 0.31
441 0.33
442 0.33
443 0.3