Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R779

Protein Details
Accession C4R779    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-84ERELKEELKKEKKRKIEELKEQERNKPKBasic
310-332FIYDGKSKYRRKEVSKEDQSDRFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-84LKEELKKEKKRKIEELKEQERNKPK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ppa:PAS_chr4_0929  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MPSLPEGKPEVLAKIDERVSFKKDEEKWIFEDGDEEFEYDDDLQRWVPEKRKIENDERELKEELKKEKKRKIEELKEQERNKPKSPPQTGVYITNLPSDTTLEEIEDAFGKLGTIGENLITGEKKIKLYRNEENQFKGDALVVYLKPESVDLAIEMLDGIQWRPLSKETIHVEKADFSHKESDSKAHNKDLTEEQKQVIKKRLQRLKSRSDDWKDDIQVEYERRQAEERFKHFVVLKNVFDLKTSEDDLFEIKQDIREGCEEIGSVTNVVLYDLEPEGIVSVRFSSKDDAARCAQEMNGRYFDGKKLEAFIYDGKSKYRRKEVSKEDQSDRFGTWLEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.28
4 0.32
5 0.34
6 0.36
7 0.37
8 0.37
9 0.41
10 0.41
11 0.49
12 0.5
13 0.5
14 0.49
15 0.51
16 0.49
17 0.4
18 0.37
19 0.27
20 0.25
21 0.21
22 0.18
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.13
27 0.14
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.13
32 0.17
33 0.21
34 0.28
35 0.35
36 0.41
37 0.47
38 0.56
39 0.61
40 0.67
41 0.71
42 0.72
43 0.73
44 0.7
45 0.67
46 0.6
47 0.56
48 0.52
49 0.48
50 0.5
51 0.5
52 0.57
53 0.62
54 0.68
55 0.75
56 0.77
57 0.82
58 0.84
59 0.83
60 0.85
61 0.86
62 0.88
63 0.88
64 0.83
65 0.81
66 0.8
67 0.75
68 0.69
69 0.68
70 0.66
71 0.67
72 0.7
73 0.67
74 0.59
75 0.59
76 0.57
77 0.51
78 0.47
79 0.39
80 0.33
81 0.3
82 0.28
83 0.21
84 0.19
85 0.16
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.09
110 0.11
111 0.14
112 0.18
113 0.25
114 0.3
115 0.37
116 0.44
117 0.52
118 0.56
119 0.57
120 0.56
121 0.51
122 0.46
123 0.39
124 0.31
125 0.21
126 0.15
127 0.11
128 0.11
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.07
151 0.08
152 0.1
153 0.11
154 0.18
155 0.19
156 0.24
157 0.25
158 0.25
159 0.24
160 0.23
161 0.24
162 0.22
163 0.19
164 0.16
165 0.2
166 0.2
167 0.22
168 0.21
169 0.23
170 0.25
171 0.32
172 0.32
173 0.32
174 0.33
175 0.31
176 0.34
177 0.39
178 0.38
179 0.35
180 0.34
181 0.3
182 0.33
183 0.35
184 0.36
185 0.36
186 0.36
187 0.39
188 0.48
189 0.55
190 0.58
191 0.66
192 0.69
193 0.71
194 0.71
195 0.7
196 0.7
197 0.67
198 0.65
199 0.59
200 0.57
201 0.48
202 0.43
203 0.38
204 0.31
205 0.29
206 0.26
207 0.24
208 0.23
209 0.22
210 0.22
211 0.24
212 0.25
213 0.31
214 0.37
215 0.39
216 0.42
217 0.41
218 0.44
219 0.44
220 0.48
221 0.46
222 0.43
223 0.39
224 0.36
225 0.38
226 0.35
227 0.33
228 0.27
229 0.21
230 0.19
231 0.2
232 0.17
233 0.15
234 0.15
235 0.16
236 0.15
237 0.13
238 0.12
239 0.11
240 0.12
241 0.15
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.17
246 0.16
247 0.15
248 0.14
249 0.12
250 0.14
251 0.12
252 0.1
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.05
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.07
269 0.09
270 0.1
271 0.12
272 0.15
273 0.18
274 0.25
275 0.26
276 0.3
277 0.32
278 0.33
279 0.32
280 0.3
281 0.28
282 0.27
283 0.29
284 0.29
285 0.28
286 0.27
287 0.28
288 0.29
289 0.31
290 0.3
291 0.28
292 0.24
293 0.25
294 0.25
295 0.24
296 0.26
297 0.26
298 0.27
299 0.3
300 0.3
301 0.32
302 0.4
303 0.46
304 0.52
305 0.59
306 0.62
307 0.66
308 0.76
309 0.8
310 0.83
311 0.86
312 0.85
313 0.82
314 0.79
315 0.74
316 0.66
317 0.57
318 0.47