Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DW82

Protein Details
Accession C5DW82    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
524-549LTGVPHAKLRRTRRARSKELEPHQLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
534-537RTRR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027267  AH/BAR_dom_sf  
IPR001683  PX_dom  
IPR036871  PX_dom_sf  
IPR044106  PX_Snx41/Atg20  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0010008  C:endosome membrane  
GO:0032266  F:phosphatidylinositol-3-phosphate binding  
GO:0006914  P:autophagy  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG zro:ZYRO0D12694g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00787  PX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50195  PX  
CDD cd06867  PX_SNX41_42  
Amino Acid Sequences MDIFGDSEEEDNNPFSGTNHLYASGIAAVENGEDDFIPKGFMEDEPLVNSNSANQDDDQDNDQDDYQNDEEGEEQGLLIDHEEQEQQRGEQEEEEEERSGTTLSDTTTQFEPYVSLTMSMANNVDHSTSFEADKDIQVIDAGEYKDPWGKRAIGYSLRFQGQDVIRRYSEFDTLRQALVRLLPTVVVPPIPFKHPLIKYFLSPLSVENDSKTIEKRKRMFSSFLNNCIKVPEIRDHIVFKKFLDPEYAWKNVLSSPPIVILPVNNLLAPPLNPTKPSPLHLLLPGPISISRLDSSAHSGTSLEVETQFAHLEALFKKSKEVYQPLHRIIKQHRSHFHDLSSFFAELGAYYNAFSLEDNVIANARSMLQIKSLSNGIEKIGHGFDVNYVSSEILVDNLLSLFEEPLGEILQFLDDAARILQFRKLKQMQYQIIEHTISKRENRARSLQESQTQLKRLENVLQKNAQESPTIAEAVKHIENSMHEGVTLPQPQTSEEQSNKPLLEGYSQNYHQNNQKNASSASSVLTGVPHAKLRRTRRARSKELEPHQLTETERQDEIQKLHKEIDKLNECFKLVSRDIDEVNRSSLESLQRLARYINDKWEFMLKNFAKSMVNWLSECLKAWKNARSVVDAIES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.17
4 0.19
5 0.2
6 0.2
7 0.21
8 0.2
9 0.2
10 0.21
11 0.16
12 0.12
13 0.1
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.06
19 0.06
20 0.05
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.09
25 0.08
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.15
30 0.17
31 0.18
32 0.21
33 0.22
34 0.22
35 0.21
36 0.21
37 0.19
38 0.21
39 0.21
40 0.2
41 0.19
42 0.22
43 0.23
44 0.26
45 0.25
46 0.22
47 0.22
48 0.21
49 0.21
50 0.2
51 0.19
52 0.22
53 0.2
54 0.2
55 0.18
56 0.17
57 0.17
58 0.15
59 0.16
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.07
68 0.09
69 0.12
70 0.12
71 0.16
72 0.17
73 0.17
74 0.19
75 0.21
76 0.21
77 0.2
78 0.21
79 0.22
80 0.23
81 0.25
82 0.22
83 0.19
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.11
88 0.1
89 0.08
90 0.09
91 0.14
92 0.14
93 0.17
94 0.18
95 0.19
96 0.18
97 0.17
98 0.17
99 0.13
100 0.15
101 0.12
102 0.11
103 0.1
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.13
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.09
113 0.11
114 0.13
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.15
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.13
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.18
136 0.19
137 0.2
138 0.25
139 0.29
140 0.32
141 0.34
142 0.38
143 0.39
144 0.39
145 0.37
146 0.33
147 0.34
148 0.3
149 0.36
150 0.35
151 0.35
152 0.33
153 0.34
154 0.37
155 0.31
156 0.34
157 0.27
158 0.25
159 0.28
160 0.29
161 0.29
162 0.26
163 0.25
164 0.2
165 0.21
166 0.2
167 0.13
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.11
173 0.09
174 0.08
175 0.11
176 0.13
177 0.15
178 0.17
179 0.18
180 0.26
181 0.29
182 0.31
183 0.35
184 0.34
185 0.33
186 0.35
187 0.34
188 0.27
189 0.24
190 0.23
191 0.19
192 0.2
193 0.19
194 0.16
195 0.16
196 0.16
197 0.17
198 0.2
199 0.25
200 0.29
201 0.37
202 0.42
203 0.5
204 0.56
205 0.58
206 0.59
207 0.56
208 0.61
209 0.56
210 0.59
211 0.56
212 0.49
213 0.45
214 0.42
215 0.37
216 0.27
217 0.26
218 0.22
219 0.22
220 0.23
221 0.25
222 0.27
223 0.3
224 0.32
225 0.3
226 0.25
227 0.28
228 0.27
229 0.26
230 0.27
231 0.24
232 0.26
233 0.3
234 0.31
235 0.25
236 0.24
237 0.24
238 0.21
239 0.22
240 0.18
241 0.14
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.1
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.12
258 0.12
259 0.14
260 0.15
261 0.22
262 0.23
263 0.25
264 0.26
265 0.25
266 0.25
267 0.26
268 0.25
269 0.2
270 0.19
271 0.17
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.07
299 0.07
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.14
304 0.15
305 0.17
306 0.2
307 0.25
308 0.26
309 0.34
310 0.4
311 0.44
312 0.49
313 0.47
314 0.47
315 0.47
316 0.52
317 0.49
318 0.5
319 0.52
320 0.54
321 0.59
322 0.55
323 0.51
324 0.45
325 0.4
326 0.36
327 0.31
328 0.23
329 0.17
330 0.16
331 0.14
332 0.09
333 0.11
334 0.08
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.07
353 0.08
354 0.09
355 0.11
356 0.11
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.03
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.06
405 0.07
406 0.12
407 0.16
408 0.17
409 0.26
410 0.31
411 0.34
412 0.41
413 0.49
414 0.5
415 0.5
416 0.51
417 0.43
418 0.4
419 0.37
420 0.32
421 0.25
422 0.25
423 0.24
424 0.24
425 0.31
426 0.36
427 0.4
428 0.44
429 0.49
430 0.5
431 0.54
432 0.58
433 0.54
434 0.52
435 0.52
436 0.52
437 0.5
438 0.47
439 0.43
440 0.38
441 0.36
442 0.33
443 0.35
444 0.37
445 0.38
446 0.4
447 0.42
448 0.41
449 0.4
450 0.41
451 0.34
452 0.27
453 0.22
454 0.19
455 0.17
456 0.17
457 0.15
458 0.13
459 0.13
460 0.16
461 0.17
462 0.14
463 0.12
464 0.13
465 0.14
466 0.19
467 0.2
468 0.16
469 0.14
470 0.15
471 0.16
472 0.2
473 0.23
474 0.17
475 0.16
476 0.17
477 0.19
478 0.21
479 0.24
480 0.26
481 0.26
482 0.31
483 0.33
484 0.36
485 0.35
486 0.32
487 0.29
488 0.22
489 0.23
490 0.21
491 0.22
492 0.25
493 0.26
494 0.32
495 0.32
496 0.35
497 0.38
498 0.43
499 0.46
500 0.44
501 0.45
502 0.42
503 0.42
504 0.41
505 0.36
506 0.28
507 0.24
508 0.2
509 0.18
510 0.15
511 0.14
512 0.13
513 0.13
514 0.14
515 0.18
516 0.19
517 0.25
518 0.34
519 0.43
520 0.52
521 0.6
522 0.68
523 0.74
524 0.82
525 0.85
526 0.83
527 0.85
528 0.84
529 0.82
530 0.83
531 0.75
532 0.68
533 0.6
534 0.57
535 0.48
536 0.46
537 0.43
538 0.35
539 0.33
540 0.31
541 0.33
542 0.34
543 0.35
544 0.36
545 0.36
546 0.35
547 0.4
548 0.43
549 0.42
550 0.42
551 0.5
552 0.49
553 0.48
554 0.51
555 0.48
556 0.46
557 0.43
558 0.41
559 0.39
560 0.32
561 0.34
562 0.32
563 0.32
564 0.33
565 0.37
566 0.38
567 0.32
568 0.33
569 0.28
570 0.25
571 0.23
572 0.25
573 0.25
574 0.23
575 0.24
576 0.28
577 0.28
578 0.29
579 0.29
580 0.31
581 0.32
582 0.33
583 0.41
584 0.39
585 0.38
586 0.39
587 0.46
588 0.42
589 0.37
590 0.45
591 0.36
592 0.38
593 0.39
594 0.39
595 0.33
596 0.31
597 0.39
598 0.35
599 0.37
600 0.31
601 0.33
602 0.34
603 0.33
604 0.34
605 0.32
606 0.29
607 0.32
608 0.38
609 0.42
610 0.45
611 0.5
612 0.51
613 0.5
614 0.48