Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DU63

Protein Details
Accession C5DU63    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
425-445KDSIEKSKEKHKKINKGQVHDBasic
535-562HFYIHFYSTKPKKQNTTRKLHNNLKECAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005607  BSD_dom  
IPR035925  BSD_dom_sf  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR027079  Tfb1/GTF2H1  
IPR013876  TFIIH_BTF_p62_N  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG zro:ZYRO0C14212g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03909  BSD  
PF08567  PH_TFIIH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50858  BSD  
CDD cd13229  PH_TFIIH  
Amino Acid Sequences MSHSGAATFNKLSGIIAINEDVSPAELTWRSTDGDSSNTIILNTIDKLQATSANSEKMMLRLVAKVDETKKRKDNEGNEILPKPVTHVFNFNNRIVMDNIKSTLQHIISRYKDDDIYEEKRKKEEGSSGTPRLPSETPPTSSLINTATLDDSLSRAKLLSNLKLQQSLLREDKQLMRIFQEAVINSGLPPNEFWSTRIAMLRAYALSVSQKVGPYNVLSTIKPVASSDNKVNVNISREKIMSIFENYPIVKKAYTDNVPKNFKEPEFWARFFSSKLFRKLRGEKIMQHDRGDVIIDRYLTLDQEYDRKDDSILLHPVQKIIDLEGNDQDDPVLKGNKPDFTMQPGFDVNGHNDGSVDILKGMNRLSEKMVMSLENEYSRSNLNQDDVDREERSELVLGDLEEEYQEDYAMIHLKNQGERASLETKDSIEKSKEKHKKINKGQVHDQIDFVLQGLGTKLDLTDVGKNTSYNNEINQKVITAVKTNAKQAKHNNLDTMWGVQGAGKNDEPEATVKLPLDLLESCRMLHSTCCEFLKHFYIHFYSTKPKKQNTTRKLHNNLKECADKIFELFDDVQKGDGESMAAICKSCLKPVLDSINLAIQKYQESTPPVIKRAESTAAQPTVVLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.13
3 0.14
4 0.14
5 0.15
6 0.14
7 0.14
8 0.12
9 0.11
10 0.1
11 0.09
12 0.12
13 0.12
14 0.15
15 0.17
16 0.18
17 0.19
18 0.19
19 0.22
20 0.2
21 0.22
22 0.22
23 0.22
24 0.21
25 0.2
26 0.19
27 0.17
28 0.16
29 0.15
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.15
35 0.15
36 0.19
37 0.18
38 0.22
39 0.23
40 0.25
41 0.25
42 0.26
43 0.25
44 0.22
45 0.23
46 0.19
47 0.18
48 0.18
49 0.19
50 0.2
51 0.21
52 0.26
53 0.3
54 0.39
55 0.43
56 0.49
57 0.54
58 0.56
59 0.64
60 0.66
61 0.67
62 0.68
63 0.72
64 0.68
65 0.67
66 0.64
67 0.56
68 0.48
69 0.39
70 0.33
71 0.3
72 0.28
73 0.23
74 0.3
75 0.33
76 0.42
77 0.47
78 0.44
79 0.42
80 0.38
81 0.39
82 0.33
83 0.34
84 0.27
85 0.24
86 0.24
87 0.21
88 0.22
89 0.2
90 0.24
91 0.21
92 0.23
93 0.24
94 0.3
95 0.32
96 0.37
97 0.38
98 0.35
99 0.34
100 0.31
101 0.33
102 0.31
103 0.36
104 0.41
105 0.44
106 0.44
107 0.46
108 0.47
109 0.45
110 0.43
111 0.44
112 0.41
113 0.45
114 0.51
115 0.52
116 0.53
117 0.52
118 0.47
119 0.43
120 0.37
121 0.31
122 0.31
123 0.31
124 0.31
125 0.32
126 0.34
127 0.3
128 0.29
129 0.28
130 0.21
131 0.19
132 0.16
133 0.15
134 0.14
135 0.13
136 0.13
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.15
145 0.19
146 0.23
147 0.29
148 0.33
149 0.35
150 0.37
151 0.37
152 0.35
153 0.34
154 0.34
155 0.32
156 0.3
157 0.3
158 0.3
159 0.35
160 0.37
161 0.37
162 0.32
163 0.29
164 0.29
165 0.28
166 0.27
167 0.26
168 0.19
169 0.18
170 0.17
171 0.15
172 0.13
173 0.14
174 0.12
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.16
182 0.17
183 0.19
184 0.2
185 0.18
186 0.15
187 0.16
188 0.16
189 0.12
190 0.11
191 0.09
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.13
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.16
207 0.17
208 0.16
209 0.16
210 0.15
211 0.16
212 0.17
213 0.21
214 0.22
215 0.27
216 0.28
217 0.28
218 0.29
219 0.26
220 0.28
221 0.29
222 0.26
223 0.22
224 0.21
225 0.21
226 0.2
227 0.19
228 0.16
229 0.16
230 0.16
231 0.14
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.18
236 0.17
237 0.13
238 0.13
239 0.15
240 0.18
241 0.23
242 0.3
243 0.36
244 0.43
245 0.47
246 0.47
247 0.47
248 0.45
249 0.4
250 0.35
251 0.32
252 0.33
253 0.35
254 0.35
255 0.35
256 0.33
257 0.33
258 0.31
259 0.3
260 0.29
261 0.29
262 0.37
263 0.38
264 0.4
265 0.47
266 0.54
267 0.59
268 0.58
269 0.55
270 0.52
271 0.58
272 0.64
273 0.58
274 0.51
275 0.43
276 0.36
277 0.33
278 0.28
279 0.19
280 0.11
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.16
298 0.17
299 0.18
300 0.18
301 0.2
302 0.2
303 0.21
304 0.18
305 0.17
306 0.12
307 0.1
308 0.12
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.13
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.11
320 0.09
321 0.13
322 0.16
323 0.18
324 0.19
325 0.2
326 0.19
327 0.23
328 0.26
329 0.22
330 0.22
331 0.2
332 0.19
333 0.18
334 0.18
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.08
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.09
351 0.1
352 0.11
353 0.14
354 0.14
355 0.15
356 0.15
357 0.14
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.11
362 0.12
363 0.11
364 0.11
365 0.12
366 0.11
367 0.12
368 0.11
369 0.12
370 0.13
371 0.13
372 0.16
373 0.18
374 0.21
375 0.19
376 0.19
377 0.18
378 0.16
379 0.16
380 0.14
381 0.1
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.08
397 0.08
398 0.09
399 0.13
400 0.15
401 0.17
402 0.19
403 0.19
404 0.17
405 0.18
406 0.21
407 0.21
408 0.2
409 0.2
410 0.19
411 0.19
412 0.21
413 0.22
414 0.21
415 0.22
416 0.26
417 0.28
418 0.38
419 0.46
420 0.49
421 0.58
422 0.63
423 0.7
424 0.77
425 0.84
426 0.8
427 0.78
428 0.8
429 0.79
430 0.76
431 0.65
432 0.55
433 0.45
434 0.38
435 0.3
436 0.22
437 0.13
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.06
447 0.07
448 0.13
449 0.14
450 0.16
451 0.17
452 0.17
453 0.18
454 0.21
455 0.23
456 0.19
457 0.22
458 0.27
459 0.27
460 0.28
461 0.27
462 0.24
463 0.22
464 0.23
465 0.19
466 0.16
467 0.19
468 0.24
469 0.26
470 0.34
471 0.38
472 0.37
473 0.43
474 0.49
475 0.56
476 0.57
477 0.57
478 0.53
479 0.48
480 0.49
481 0.42
482 0.36
483 0.25
484 0.17
485 0.15
486 0.13
487 0.16
488 0.15
489 0.17
490 0.16
491 0.16
492 0.17
493 0.17
494 0.16
495 0.15
496 0.17
497 0.15
498 0.16
499 0.16
500 0.16
501 0.16
502 0.15
503 0.16
504 0.13
505 0.15
506 0.17
507 0.18
508 0.17
509 0.18
510 0.19
511 0.17
512 0.18
513 0.2
514 0.2
515 0.24
516 0.25
517 0.26
518 0.27
519 0.3
520 0.35
521 0.31
522 0.27
523 0.28
524 0.29
525 0.32
526 0.32
527 0.32
528 0.35
529 0.42
530 0.51
531 0.54
532 0.59
533 0.65
534 0.74
535 0.82
536 0.81
537 0.83
538 0.85
539 0.87
540 0.9
541 0.9
542 0.88
543 0.84
544 0.79
545 0.75
546 0.7
547 0.6
548 0.53
549 0.47
550 0.38
551 0.32
552 0.29
553 0.22
554 0.21
555 0.22
556 0.22
557 0.22
558 0.21
559 0.21
560 0.19
561 0.2
562 0.16
563 0.14
564 0.12
565 0.08
566 0.09
567 0.1
568 0.1
569 0.1
570 0.1
571 0.17
572 0.18
573 0.21
574 0.26
575 0.26
576 0.29
577 0.36
578 0.44
579 0.38
580 0.38
581 0.37
582 0.39
583 0.38
584 0.35
585 0.28
586 0.21
587 0.22
588 0.23
589 0.23
590 0.21
591 0.24
592 0.29
593 0.37
594 0.41
595 0.43
596 0.43
597 0.43
598 0.41
599 0.42
600 0.43
601 0.35
602 0.34
603 0.39
604 0.37
605 0.36