Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DQJ8

Protein Details
Accession C5DQJ8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
734-755TGGNGKRKYGKRGGNNRFHDTPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034352  Rim4_RRM1  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG zro:ZYRO0B00924g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12453  RRM1_RIM4_like  
Amino Acid Sequences MTISSVMDPVAGGEDASMEQDIGGAINNSKVDTEISEDIGQLLPTEVSSAESDNLDDDDDDNDLDQENENLLDEITEEDIKRSSDGNGNNNEDGKNCFSVNQERKPLSVINNATNKKGNTKPLNQEQVAPTAEKSQGDSGETELQAQARAQARTQAQEKEDYVPKTESNGDANDTSDTGTTTSFRGRPSSCVFVASLAASLSDDELCISVTESFKQYGQLARVKVLRDPANRPYAFVQYTNDRDAKRALKMARGSMLNGRTLRCESARVNRTLFVTHVTPVYYLEVADLCGKFGELEQLVPSSDQNQFGRRYNYPSSNTSSWFVQFAYRDDAIRAFANLRTNSDWDVEWVQNIEVPKYYNLLNKKDKQQTTNSRGKSTVTENDLDEESEFGDNHDSFSSSNTTSSDDRIVIDKKSIFVGQLDQSVTKEKLLERFSTHGKISDLNLINKTNKVFTFIQFETEEAAAAALERENHAIFLNKTMHVQYKEVGGHRSRRNFRRDGFYGNVRNPGPGGAPNNGGSGGSNSTTTASAAAAAVVAAAAGHGGQGGQGRVFTGPQVNLAPPPINMYRRRAQENDTSNVVPPYMAQQMSTPTSEFDMNYIPYMNAGFRRKSSFVNNGWSSSRSHSMKSEMDTVCGDGATDATSDAPSESGGQTNSPTTYNNSSAGSMGQNNNNSTSHNGSDNNDGDDDDDDDENTNNSNNNNNNNNNNNNGNTNGNNGHHNSHHNYNVGNFNTGGNGKRKYGKRGGNNRFHDTPKPYYFQPYYYHPMHYPMGPLGPVAHAHPSQAAAAAAGNHPYMMIYPMPPPPPTGVDGNLLAQSLPLGPPGPMLHGSPPTSQSQDARSEANEFVPNTKSCQLDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.09
4 0.09
5 0.06
6 0.06
7 0.07
8 0.07
9 0.06
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.1
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.17
21 0.16
22 0.2
23 0.2
24 0.2
25 0.2
26 0.2
27 0.18
28 0.13
29 0.12
30 0.08
31 0.08
32 0.09
33 0.08
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.12
38 0.12
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.12
64 0.11
65 0.12
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.16
71 0.21
72 0.27
73 0.33
74 0.39
75 0.43
76 0.45
77 0.46
78 0.43
79 0.38
80 0.36
81 0.32
82 0.27
83 0.22
84 0.22
85 0.25
86 0.35
87 0.42
88 0.46
89 0.51
90 0.5
91 0.5
92 0.52
93 0.51
94 0.45
95 0.46
96 0.42
97 0.41
98 0.49
99 0.5
100 0.5
101 0.51
102 0.48
103 0.46
104 0.48
105 0.5
106 0.49
107 0.57
108 0.63
109 0.67
110 0.75
111 0.68
112 0.68
113 0.6
114 0.56
115 0.49
116 0.4
117 0.31
118 0.26
119 0.28
120 0.23
121 0.23
122 0.21
123 0.21
124 0.21
125 0.21
126 0.2
127 0.23
128 0.23
129 0.21
130 0.19
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.19
135 0.19
136 0.2
137 0.19
138 0.25
139 0.27
140 0.32
141 0.36
142 0.36
143 0.33
144 0.37
145 0.38
146 0.38
147 0.42
148 0.38
149 0.37
150 0.34
151 0.32
152 0.31
153 0.32
154 0.28
155 0.24
156 0.24
157 0.23
158 0.21
159 0.22
160 0.19
161 0.17
162 0.15
163 0.12
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.15
170 0.17
171 0.18
172 0.23
173 0.24
174 0.29
175 0.34
176 0.38
177 0.33
178 0.32
179 0.31
180 0.26
181 0.26
182 0.2
183 0.15
184 0.09
185 0.09
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.08
197 0.09
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.15
203 0.16
204 0.18
205 0.22
206 0.26
207 0.25
208 0.29
209 0.31
210 0.3
211 0.31
212 0.34
213 0.36
214 0.36
215 0.4
216 0.43
217 0.49
218 0.48
219 0.48
220 0.44
221 0.42
222 0.38
223 0.34
224 0.31
225 0.28
226 0.31
227 0.34
228 0.35
229 0.3
230 0.3
231 0.34
232 0.34
233 0.31
234 0.34
235 0.31
236 0.34
237 0.36
238 0.37
239 0.36
240 0.33
241 0.32
242 0.31
243 0.31
244 0.29
245 0.28
246 0.26
247 0.25
248 0.26
249 0.26
250 0.21
251 0.24
252 0.23
253 0.31
254 0.37
255 0.37
256 0.37
257 0.36
258 0.37
259 0.34
260 0.3
261 0.23
262 0.18
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.13
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.11
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.11
291 0.15
292 0.16
293 0.2
294 0.23
295 0.27
296 0.31
297 0.3
298 0.35
299 0.36
300 0.41
301 0.41
302 0.41
303 0.43
304 0.4
305 0.4
306 0.36
307 0.32
308 0.26
309 0.23
310 0.2
311 0.16
312 0.15
313 0.15
314 0.18
315 0.17
316 0.17
317 0.17
318 0.17
319 0.16
320 0.15
321 0.14
322 0.1
323 0.12
324 0.17
325 0.17
326 0.19
327 0.19
328 0.2
329 0.21
330 0.21
331 0.18
332 0.15
333 0.17
334 0.14
335 0.13
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.1
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.1
345 0.12
346 0.15
347 0.2
348 0.27
349 0.35
350 0.39
351 0.47
352 0.55
353 0.56
354 0.55
355 0.6
356 0.63
357 0.63
358 0.66
359 0.59
360 0.53
361 0.5
362 0.47
363 0.4
364 0.34
365 0.31
366 0.25
367 0.25
368 0.23
369 0.24
370 0.23
371 0.2
372 0.16
373 0.11
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.08
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.11
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.12
390 0.13
391 0.14
392 0.14
393 0.12
394 0.12
395 0.14
396 0.15
397 0.13
398 0.15
399 0.14
400 0.13
401 0.14
402 0.14
403 0.11
404 0.1
405 0.12
406 0.11
407 0.13
408 0.12
409 0.12
410 0.12
411 0.14
412 0.14
413 0.12
414 0.12
415 0.11
416 0.17
417 0.19
418 0.2
419 0.19
420 0.21
421 0.24
422 0.25
423 0.25
424 0.2
425 0.19
426 0.19
427 0.18
428 0.23
429 0.22
430 0.21
431 0.23
432 0.23
433 0.24
434 0.24
435 0.23
436 0.18
437 0.15
438 0.19
439 0.18
440 0.17
441 0.23
442 0.22
443 0.24
444 0.22
445 0.22
446 0.18
447 0.17
448 0.16
449 0.08
450 0.08
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.03
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.09
462 0.08
463 0.13
464 0.14
465 0.14
466 0.15
467 0.16
468 0.2
469 0.2
470 0.2
471 0.16
472 0.19
473 0.21
474 0.22
475 0.24
476 0.23
477 0.29
478 0.35
479 0.43
480 0.47
481 0.52
482 0.57
483 0.59
484 0.59
485 0.6
486 0.56
487 0.54
488 0.5
489 0.5
490 0.48
491 0.44
492 0.46
493 0.37
494 0.35
495 0.29
496 0.25
497 0.18
498 0.16
499 0.17
500 0.13
501 0.15
502 0.15
503 0.15
504 0.15
505 0.14
506 0.11
507 0.1
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.08
513 0.09
514 0.08
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.05
520 0.04
521 0.04
522 0.03
523 0.03
524 0.02
525 0.02
526 0.02
527 0.02
528 0.02
529 0.02
530 0.02
531 0.02
532 0.03
533 0.04
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.06
538 0.06
539 0.07
540 0.07
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.12
545 0.12
546 0.12
547 0.14
548 0.13
549 0.11
550 0.15
551 0.17
552 0.22
553 0.25
554 0.3
555 0.35
556 0.39
557 0.45
558 0.43
559 0.43
560 0.46
561 0.48
562 0.46
563 0.43
564 0.39
565 0.35
566 0.33
567 0.28
568 0.19
569 0.13
570 0.13
571 0.13
572 0.13
573 0.12
574 0.13
575 0.16
576 0.18
577 0.19
578 0.16
579 0.12
580 0.14
581 0.15
582 0.14
583 0.12
584 0.12
585 0.12
586 0.12
587 0.12
588 0.1
589 0.1
590 0.11
591 0.11
592 0.14
593 0.18
594 0.19
595 0.21
596 0.26
597 0.28
598 0.31
599 0.36
600 0.39
601 0.38
602 0.46
603 0.45
604 0.43
605 0.43
606 0.4
607 0.36
608 0.31
609 0.35
610 0.27
611 0.28
612 0.28
613 0.31
614 0.33
615 0.33
616 0.38
617 0.3
618 0.31
619 0.29
620 0.27
621 0.22
622 0.19
623 0.16
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.05
630 0.05
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.05
635 0.07
636 0.08
637 0.09
638 0.1
639 0.1
640 0.11
641 0.13
642 0.14
643 0.13
644 0.14
645 0.16
646 0.2
647 0.22
648 0.22
649 0.22
650 0.21
651 0.21
652 0.21
653 0.19
654 0.18
655 0.2
656 0.23
657 0.25
658 0.26
659 0.28
660 0.27
661 0.26
662 0.25
663 0.26
664 0.23
665 0.23
666 0.24
667 0.24
668 0.3
669 0.3
670 0.28
671 0.25
672 0.23
673 0.2
674 0.19
675 0.18
676 0.13
677 0.12
678 0.1
679 0.11
680 0.11
681 0.11
682 0.11
683 0.1
684 0.1
685 0.11
686 0.17
687 0.21
688 0.28
689 0.35
690 0.4
691 0.46
692 0.51
693 0.53
694 0.51
695 0.5
696 0.45
697 0.39
698 0.37
699 0.33
700 0.27
701 0.28
702 0.28
703 0.26
704 0.28
705 0.28
706 0.29
707 0.28
708 0.34
709 0.34
710 0.36
711 0.38
712 0.36
713 0.34
714 0.35
715 0.39
716 0.35
717 0.32
718 0.26
719 0.23
720 0.24
721 0.25
722 0.26
723 0.24
724 0.26
725 0.28
726 0.36
727 0.41
728 0.47
729 0.54
730 0.59
731 0.64
732 0.72
733 0.79
734 0.81
735 0.82
736 0.81
737 0.77
738 0.72
739 0.69
740 0.65
741 0.63
742 0.58
743 0.55
744 0.5
745 0.53
746 0.51
747 0.47
748 0.45
749 0.43
750 0.44
751 0.43
752 0.45
753 0.38
754 0.4
755 0.39
756 0.35
757 0.31
758 0.26
759 0.25
760 0.21
761 0.21
762 0.17
763 0.16
764 0.15
765 0.14
766 0.18
767 0.16
768 0.17
769 0.17
770 0.17
771 0.16
772 0.16
773 0.15
774 0.1
775 0.1
776 0.11
777 0.11
778 0.12
779 0.11
780 0.1
781 0.1
782 0.09
783 0.09
784 0.1
785 0.1
786 0.1
787 0.14
788 0.2
789 0.23
790 0.23
791 0.25
792 0.26
793 0.28
794 0.29
795 0.29
796 0.26
797 0.26
798 0.27
799 0.27
800 0.24
801 0.21
802 0.18
803 0.14
804 0.13
805 0.1
806 0.09
807 0.09
808 0.09
809 0.08
810 0.12
811 0.13
812 0.16
813 0.16
814 0.18
815 0.21
816 0.26
817 0.29
818 0.29
819 0.32
820 0.32
821 0.34
822 0.35
823 0.34
824 0.34
825 0.38
826 0.37
827 0.36
828 0.33
829 0.34
830 0.32
831 0.33
832 0.32
833 0.27
834 0.28
835 0.31
836 0.31
837 0.32
838 0.36