Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DWL0

Protein Details
Accession C5DWL0    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
264-289VAALSKKKFNGKKITIRKARLSKLKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-110KVGKSRTFSKLRRSR
269-284KKKFNGKKITIRKARL
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034244  Rrt5_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG zro:ZYRO0D15686g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12409  RRM1_RRT5  
Amino Acid Sequences MSANRVYVSNLNFNTTEDELLEHFKEFQVISVLIPSQTVRFFRNNQVRPLGIGYAEFPNPEKAQEAIESLNGQLFKDRELRLKPYVPYSPERVSRKVGKSRTFSKLRRSRKESGDVLISASGPFNEDLAAQGDSTSPEAVPEASNESSPHEHREGDQERNSEAAGGNDGTNVTNPGNAAASTTAANASSSLSPQEMAYSNDTLYLGYLPKDVDDIEIRDHLDSYYPNEIWIFRTRPKGKHLQLHRHFMAALVTVKTRENLDDVVAALSKKKFNGKKITIRKARLSKLKEVQSMADSPPTEQLDVDAISQSKLQAQLQEATENTQQLEQIPQSQKVTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.3
3 0.26
4 0.18
5 0.19
6 0.17
7 0.2
8 0.2
9 0.16
10 0.16
11 0.15
12 0.17
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.14
18 0.16
19 0.16
20 0.14
21 0.15
22 0.14
23 0.12
24 0.16
25 0.18
26 0.19
27 0.25
28 0.29
29 0.39
30 0.49
31 0.52
32 0.54
33 0.57
34 0.53
35 0.5
36 0.48
37 0.39
38 0.28
39 0.24
40 0.2
41 0.18
42 0.18
43 0.16
44 0.15
45 0.19
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.16
50 0.17
51 0.18
52 0.18
53 0.14
54 0.15
55 0.15
56 0.13
57 0.15
58 0.14
59 0.12
60 0.14
61 0.13
62 0.15
63 0.21
64 0.23
65 0.27
66 0.31
67 0.37
68 0.39
69 0.44
70 0.43
71 0.43
72 0.46
73 0.44
74 0.43
75 0.44
76 0.44
77 0.47
78 0.5
79 0.47
80 0.48
81 0.52
82 0.56
83 0.59
84 0.61
85 0.61
86 0.62
87 0.66
88 0.69
89 0.7
90 0.66
91 0.68
92 0.7
93 0.73
94 0.77
95 0.77
96 0.76
97 0.74
98 0.78
99 0.69
100 0.62
101 0.55
102 0.45
103 0.38
104 0.3
105 0.23
106 0.15
107 0.13
108 0.09
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.13
134 0.15
135 0.16
136 0.19
137 0.17
138 0.17
139 0.17
140 0.26
141 0.27
142 0.3
143 0.32
144 0.3
145 0.28
146 0.29
147 0.28
148 0.19
149 0.15
150 0.1
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.06
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.12
204 0.13
205 0.12
206 0.13
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.12
211 0.16
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.16
216 0.18
217 0.23
218 0.23
219 0.23
220 0.34
221 0.39
222 0.43
223 0.49
224 0.56
225 0.56
226 0.62
227 0.67
228 0.68
229 0.69
230 0.74
231 0.68
232 0.59
233 0.53
234 0.44
235 0.35
236 0.27
237 0.22
238 0.15
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.16
243 0.15
244 0.14
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.13
254 0.15
255 0.16
256 0.18
257 0.27
258 0.32
259 0.39
260 0.5
261 0.56
262 0.64
263 0.73
264 0.81
265 0.81
266 0.82
267 0.83
268 0.81
269 0.81
270 0.8
271 0.75
272 0.74
273 0.73
274 0.75
275 0.7
276 0.63
277 0.57
278 0.51
279 0.48
280 0.4
281 0.36
282 0.29
283 0.25
284 0.29
285 0.28
286 0.24
287 0.21
288 0.21
289 0.18
290 0.18
291 0.18
292 0.15
293 0.14
294 0.14
295 0.15
296 0.14
297 0.15
298 0.17
299 0.18
300 0.19
301 0.22
302 0.27
303 0.28
304 0.31
305 0.28
306 0.3
307 0.31
308 0.28
309 0.26
310 0.22
311 0.2
312 0.18
313 0.23
314 0.2
315 0.27
316 0.3
317 0.34