Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DR24

Protein Details
Accession C5DR24    Localization Confidence Low Confidence Score 6.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-30QTVGKRAIKGYKPQKLPNRNDNVIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 5, cyto_nucl 5, cyto 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046885  MnmA-like_C  
IPR046884  MnmA-like_central  
IPR023382  MnmA-like_central_sf  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR004506  tRNA-specific_2-thiouridylase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0061708  F:tRNA-5-taurinomethyluridine 2-sulfurtransferase  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG zro:ZYRO0B04994g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03054  tRNA_Me_trans  
PF20258  tRNA_Me_trans_C  
PF20259  tRNA_Me_trans_M  
CDD cd01998  tRNA_Me_trans  
Amino Acid Sequences MLSRFAQTVGKRAIKGYKPQKLPNRNDNVIIAMSSGVDSSVSAALFAEQYPNARGIYIQSWGKSQSLTDPQLEPCYERDWKDVGRVAEHLGIPVDKVNFEKEYWLDVFEPMLESYNKGWTPNPDIGCNRFVKFGKLREYLDQQYGANNYWLVTGHYARVLSSSYNDQPHLLRSFYPAKDQSYYLSQVDTDILGQLIFPTGHLTKPEVRELAVAAGLTTTSQKPDSQGICFVNNSQSGKFKHFLEHYLPNSPGNIVTIEEDGNKRVWGRHPGLWSHTIGQKVGLSMPQGDPRYAGSWYISDKLQDSNELVIVRGRDNPALYQDTVTITNTFSLDLNFRRLMKEAIEQGKLFIQYRSLQDPIAVKDCHFDQDETVLKLGSAQRAMAPGQYCCLYLQNRVLGSGTISRVGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.6
3 0.62
4 0.63
5 0.66
6 0.74
7 0.81
8 0.82
9 0.85
10 0.85
11 0.84
12 0.78
13 0.73
14 0.64
15 0.57
16 0.47
17 0.37
18 0.27
19 0.17
20 0.14
21 0.11
22 0.09
23 0.06
24 0.05
25 0.05
26 0.06
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.09
33 0.09
34 0.1
35 0.09
36 0.12
37 0.13
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.13
42 0.14
43 0.16
44 0.2
45 0.21
46 0.2
47 0.22
48 0.24
49 0.25
50 0.22
51 0.2
52 0.22
53 0.27
54 0.3
55 0.31
56 0.31
57 0.32
58 0.37
59 0.37
60 0.31
61 0.25
62 0.27
63 0.28
64 0.27
65 0.29
66 0.29
67 0.3
68 0.34
69 0.37
70 0.33
71 0.31
72 0.3
73 0.28
74 0.28
75 0.27
76 0.21
77 0.17
78 0.16
79 0.14
80 0.15
81 0.14
82 0.1
83 0.12
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.18
88 0.16
89 0.19
90 0.19
91 0.2
92 0.18
93 0.16
94 0.16
95 0.13
96 0.14
97 0.1
98 0.12
99 0.1
100 0.11
101 0.12
102 0.17
103 0.17
104 0.17
105 0.19
106 0.21
107 0.26
108 0.31
109 0.32
110 0.31
111 0.34
112 0.36
113 0.39
114 0.38
115 0.33
116 0.32
117 0.31
118 0.33
119 0.35
120 0.38
121 0.42
122 0.43
123 0.44
124 0.43
125 0.49
126 0.45
127 0.42
128 0.37
129 0.29
130 0.27
131 0.26
132 0.22
133 0.17
134 0.14
135 0.11
136 0.1
137 0.11
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.11
146 0.1
147 0.08
148 0.09
149 0.13
150 0.15
151 0.17
152 0.18
153 0.18
154 0.18
155 0.21
156 0.21
157 0.18
158 0.15
159 0.18
160 0.24
161 0.24
162 0.29
163 0.27
164 0.28
165 0.29
166 0.29
167 0.26
168 0.23
169 0.25
170 0.19
171 0.17
172 0.15
173 0.13
174 0.13
175 0.11
176 0.08
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.11
190 0.14
191 0.17
192 0.19
193 0.17
194 0.17
195 0.16
196 0.16
197 0.14
198 0.1
199 0.08
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.09
210 0.15
211 0.16
212 0.16
213 0.21
214 0.21
215 0.22
216 0.22
217 0.21
218 0.19
219 0.2
220 0.2
221 0.17
222 0.21
223 0.21
224 0.25
225 0.27
226 0.25
227 0.27
228 0.27
229 0.29
230 0.29
231 0.34
232 0.32
233 0.34
234 0.34
235 0.29
236 0.28
237 0.25
238 0.2
239 0.13
240 0.11
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.13
252 0.17
253 0.24
254 0.27
255 0.31
256 0.34
257 0.36
258 0.39
259 0.4
260 0.37
261 0.32
262 0.3
263 0.26
264 0.23
265 0.21
266 0.18
267 0.16
268 0.15
269 0.13
270 0.11
271 0.12
272 0.14
273 0.19
274 0.19
275 0.19
276 0.18
277 0.19
278 0.2
279 0.18
280 0.17
281 0.12
282 0.13
283 0.15
284 0.17
285 0.15
286 0.14
287 0.15
288 0.17
289 0.17
290 0.17
291 0.16
292 0.15
293 0.17
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.15
298 0.14
299 0.17
300 0.17
301 0.17
302 0.18
303 0.19
304 0.22
305 0.24
306 0.23
307 0.2
308 0.2
309 0.2
310 0.2
311 0.2
312 0.16
313 0.13
314 0.14
315 0.13
316 0.13
317 0.11
318 0.11
319 0.14
320 0.16
321 0.21
322 0.22
323 0.23
324 0.24
325 0.26
326 0.26
327 0.24
328 0.28
329 0.31
330 0.34
331 0.36
332 0.35
333 0.34
334 0.36
335 0.35
336 0.31
337 0.23
338 0.21
339 0.22
340 0.26
341 0.3
342 0.27
343 0.25
344 0.27
345 0.31
346 0.31
347 0.34
348 0.3
349 0.26
350 0.28
351 0.29
352 0.3
353 0.28
354 0.25
355 0.2
356 0.26
357 0.3
358 0.29
359 0.28
360 0.24
361 0.21
362 0.25
363 0.27
364 0.24
365 0.21
366 0.19
367 0.2
368 0.23
369 0.24
370 0.24
371 0.23
372 0.19
373 0.21
374 0.22
375 0.21
376 0.2
377 0.25
378 0.23
379 0.27
380 0.32
381 0.35
382 0.34
383 0.34
384 0.34
385 0.28
386 0.29
387 0.28
388 0.24