Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5E4F8

Protein Details
Accession C5E4F8    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-86SHSMGLRRSKRVPQQKSKQDVADHydrophilic
94-123AEAARKRKAQSTAKAKARARERERERYRAKBasic
466-490VQSRYEIRSKKKHVKKQLSNGKKEDHydrophilic
783-804YGDTKPSQRLLRRSQRRNVSYGHydrophilic
847-877DEEESRGTRKRGRPGRPPKQTRSVRRNTRRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-129ARKRKAQSTAKAKARARERERERYRAKVAAMKK
474-482SKKKHVKKQ
853-877GTRKRGRPGRPPKQTRSVRRNTRRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.833, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG zro:ZYRO0E05610g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSESQDLSVRPEEPLSADTQENGSANVTGNASDDQPPNEKKLGQLTFDDFENIKRVENAPNMSSHSMGLRRSKRVPQQKSKQDVADIMEQEAEAEAARKRKAQSTAKAKARARERERERYRAKVAAMKKNEASGNTTSKKPANGPTTSSAAPENQEPPLTNDNWSPNMPLLSSDFKTHHSVISRLKNPNMKPVLYAGDVMKVMGFVNKFYQFFDTDVLNLSFQNFEVGLDLYPGGPVGEVIGIYDETKQRTLLYQDYLPIKDVVSSQDKMNLLFLTLLKLTFSQSKAGELQKSHQPLTNLDQMKAQKKPFTMLVRQLRNSARTWGYPKEWRMNDIDKEEFFQPKSKLFENDEIEESVDPKMSEILTPNIYQWHHHEPVPLEEDPLQSSELEKDGILALNPRDRIILLRAMVDWCGSQSPRIRNEIYHLSHTKRDPAFGVQTQHAPRYLVEGSAVTYAQFRKLCSIVQSRYEIRSKKKHVKKQLSNGKKEDLSIKLKILEEIKQTLKDMPKEEKDQTMINLYEKWEKLFEGELPDNPLSNPFEDEVYKLRQQEFFIGRVPHIGDFYLPRLHTYPDEGIISTYMNVRNLKSMHDKYANGEIDSLALFEKNGQIMSTQFKVLYHDTISLIRDTAQGQPTLGKTYWYEMCHDTKTLKEFLEFLDCKIVVGENQGKDSQPGELSENGLPSEEVKDESKDEAKDGSKDEAQDDPKDEAKDESKDEAKDESKDESRDEKGKSGTNSILNKNPLPKESRFNPARNKLRFLKDYLSEMYDILKVFEDLREQYGDTKPSQRLLRRSQRRNVSYGFDSDAEEADVDMGEEYVDEEKNVEYDDDDDAALDYEDDYQDADEEESRGTRKRGRPGRPPKQTRSVRRNTRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.2
4 0.19
5 0.19
6 0.2
7 0.22
8 0.2
9 0.19
10 0.16
11 0.14
12 0.15
13 0.16
14 0.15
15 0.12
16 0.14
17 0.14
18 0.15
19 0.19
20 0.21
21 0.22
22 0.3
23 0.32
24 0.36
25 0.38
26 0.37
27 0.35
28 0.42
29 0.43
30 0.38
31 0.4
32 0.39
33 0.38
34 0.37
35 0.37
36 0.28
37 0.26
38 0.29
39 0.25
40 0.21
41 0.22
42 0.24
43 0.28
44 0.34
45 0.36
46 0.32
47 0.34
48 0.38
49 0.37
50 0.35
51 0.29
52 0.27
53 0.27
54 0.3
55 0.37
56 0.39
57 0.45
58 0.5
59 0.59
60 0.64
61 0.71
62 0.77
63 0.78
64 0.82
65 0.86
66 0.87
67 0.84
68 0.78
69 0.7
70 0.63
71 0.56
72 0.53
73 0.43
74 0.36
75 0.3
76 0.26
77 0.22
78 0.19
79 0.14
80 0.07
81 0.08
82 0.11
83 0.16
84 0.18
85 0.22
86 0.25
87 0.32
88 0.42
89 0.49
90 0.56
91 0.61
92 0.7
93 0.74
94 0.8
95 0.77
96 0.75
97 0.75
98 0.76
99 0.73
100 0.73
101 0.74
102 0.76
103 0.79
104 0.82
105 0.78
106 0.76
107 0.74
108 0.68
109 0.63
110 0.6
111 0.61
112 0.61
113 0.61
114 0.58
115 0.54
116 0.54
117 0.52
118 0.46
119 0.42
120 0.37
121 0.4
122 0.38
123 0.39
124 0.38
125 0.38
126 0.4
127 0.4
128 0.43
129 0.41
130 0.41
131 0.43
132 0.43
133 0.45
134 0.42
135 0.38
136 0.31
137 0.26
138 0.25
139 0.24
140 0.22
141 0.19
142 0.2
143 0.2
144 0.24
145 0.27
146 0.27
147 0.25
148 0.27
149 0.3
150 0.32
151 0.31
152 0.27
153 0.24
154 0.23
155 0.21
156 0.18
157 0.18
158 0.2
159 0.21
160 0.22
161 0.22
162 0.24
163 0.29
164 0.29
165 0.29
166 0.27
167 0.31
168 0.36
169 0.44
170 0.49
171 0.49
172 0.54
173 0.58
174 0.56
175 0.61
176 0.57
177 0.48
178 0.42
179 0.4
180 0.37
181 0.31
182 0.31
183 0.21
184 0.2
185 0.19
186 0.17
187 0.14
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.09
193 0.14
194 0.17
195 0.18
196 0.19
197 0.21
198 0.19
199 0.2
200 0.21
201 0.17
202 0.14
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.08
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.09
232 0.1
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.15
238 0.18
239 0.19
240 0.2
241 0.2
242 0.24
243 0.27
244 0.27
245 0.26
246 0.23
247 0.19
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.19
253 0.18
254 0.23
255 0.23
256 0.22
257 0.23
258 0.18
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.09
266 0.1
267 0.11
268 0.14
269 0.15
270 0.16
271 0.16
272 0.18
273 0.22
274 0.25
275 0.27
276 0.24
277 0.27
278 0.29
279 0.33
280 0.32
281 0.3
282 0.28
283 0.27
284 0.31
285 0.36
286 0.31
287 0.28
288 0.31
289 0.34
290 0.38
291 0.4
292 0.38
293 0.33
294 0.32
295 0.34
296 0.36
297 0.38
298 0.38
299 0.42
300 0.48
301 0.51
302 0.51
303 0.54
304 0.5
305 0.47
306 0.43
307 0.39
308 0.32
309 0.29
310 0.32
311 0.31
312 0.33
313 0.36
314 0.4
315 0.43
316 0.42
317 0.41
318 0.42
319 0.43
320 0.42
321 0.4
322 0.38
323 0.29
324 0.31
325 0.3
326 0.27
327 0.23
328 0.25
329 0.22
330 0.23
331 0.26
332 0.26
333 0.28
334 0.3
335 0.36
336 0.34
337 0.35
338 0.32
339 0.29
340 0.28
341 0.24
342 0.21
343 0.13
344 0.11
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.15
356 0.15
357 0.16
358 0.19
359 0.23
360 0.24
361 0.24
362 0.26
363 0.24
364 0.27
365 0.3
366 0.25
367 0.19
368 0.19
369 0.19
370 0.16
371 0.16
372 0.13
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.14
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.11
399 0.09
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.09
404 0.15
405 0.2
406 0.23
407 0.27
408 0.27
409 0.26
410 0.3
411 0.35
412 0.31
413 0.32
414 0.32
415 0.3
416 0.34
417 0.34
418 0.37
419 0.29
420 0.28
421 0.24
422 0.23
423 0.25
424 0.23
425 0.25
426 0.19
427 0.24
428 0.24
429 0.24
430 0.21
431 0.18
432 0.15
433 0.17
434 0.16
435 0.11
436 0.11
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.06
442 0.07
443 0.08
444 0.11
445 0.12
446 0.12
447 0.13
448 0.14
449 0.15
450 0.18
451 0.25
452 0.23
453 0.25
454 0.29
455 0.28
456 0.31
457 0.36
458 0.36
459 0.37
460 0.44
461 0.49
462 0.55
463 0.63
464 0.68
465 0.74
466 0.8
467 0.82
468 0.83
469 0.86
470 0.85
471 0.83
472 0.76
473 0.69
474 0.59
475 0.51
476 0.44
477 0.39
478 0.34
479 0.28
480 0.26
481 0.25
482 0.25
483 0.26
484 0.24
485 0.21
486 0.19
487 0.21
488 0.22
489 0.2
490 0.21
491 0.23
492 0.25
493 0.25
494 0.27
495 0.29
496 0.32
497 0.36
498 0.36
499 0.35
500 0.32
501 0.3
502 0.27
503 0.26
504 0.22
505 0.18
506 0.18
507 0.17
508 0.21
509 0.2
510 0.2
511 0.16
512 0.15
513 0.15
514 0.15
515 0.15
516 0.15
517 0.16
518 0.16
519 0.2
520 0.2
521 0.19
522 0.18
523 0.19
524 0.14
525 0.14
526 0.14
527 0.1
528 0.11
529 0.11
530 0.13
531 0.14
532 0.17
533 0.19
534 0.2
535 0.22
536 0.23
537 0.23
538 0.29
539 0.28
540 0.26
541 0.27
542 0.26
543 0.24
544 0.24
545 0.24
546 0.17
547 0.15
548 0.14
549 0.1
550 0.1
551 0.13
552 0.15
553 0.14
554 0.15
555 0.16
556 0.17
557 0.17
558 0.19
559 0.18
560 0.16
561 0.17
562 0.15
563 0.14
564 0.13
565 0.13
566 0.09
567 0.11
568 0.11
569 0.13
570 0.15
571 0.15
572 0.18
573 0.19
574 0.23
575 0.29
576 0.3
577 0.33
578 0.36
579 0.36
580 0.35
581 0.44
582 0.41
583 0.32
584 0.29
585 0.23
586 0.19
587 0.18
588 0.16
589 0.07
590 0.06
591 0.05
592 0.05
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.09
599 0.13
600 0.14
601 0.13
602 0.13
603 0.13
604 0.17
605 0.18
606 0.18
607 0.16
608 0.16
609 0.17
610 0.18
611 0.19
612 0.16
613 0.14
614 0.13
615 0.13
616 0.13
617 0.17
618 0.17
619 0.16
620 0.16
621 0.19
622 0.19
623 0.22
624 0.2
625 0.17
626 0.15
627 0.19
628 0.23
629 0.22
630 0.24
631 0.23
632 0.27
633 0.27
634 0.28
635 0.26
636 0.24
637 0.27
638 0.27
639 0.24
640 0.21
641 0.2
642 0.2
643 0.29
644 0.25
645 0.22
646 0.25
647 0.25
648 0.24
649 0.23
650 0.22
651 0.12
652 0.18
653 0.24
654 0.19
655 0.21
656 0.22
657 0.22
658 0.23
659 0.23
660 0.19
661 0.14
662 0.14
663 0.15
664 0.15
665 0.18
666 0.18
667 0.18
668 0.16
669 0.15
670 0.13
671 0.12
672 0.13
673 0.11
674 0.12
675 0.12
676 0.14
677 0.15
678 0.19
679 0.22
680 0.21
681 0.21
682 0.24
683 0.25
684 0.26
685 0.27
686 0.28
687 0.26
688 0.26
689 0.27
690 0.29
691 0.3
692 0.3
693 0.31
694 0.29
695 0.31
696 0.31
697 0.3
698 0.27
699 0.28
700 0.29
701 0.29
702 0.31
703 0.32
704 0.31
705 0.32
706 0.34
707 0.32
708 0.31
709 0.31
710 0.32
711 0.32
712 0.33
713 0.35
714 0.34
715 0.37
716 0.4
717 0.4
718 0.39
719 0.38
720 0.42
721 0.41
722 0.41
723 0.4
724 0.42
725 0.46
726 0.45
727 0.48
728 0.46
729 0.47
730 0.5
731 0.49
732 0.46
733 0.46
734 0.45
735 0.47
736 0.47
737 0.54
738 0.53
739 0.58
740 0.63
741 0.68
742 0.74
743 0.71
744 0.74
745 0.72
746 0.74
747 0.7
748 0.65
749 0.61
750 0.54
751 0.54
752 0.49
753 0.44
754 0.35
755 0.31
756 0.28
757 0.23
758 0.2
759 0.16
760 0.14
761 0.12
762 0.12
763 0.13
764 0.15
765 0.15
766 0.17
767 0.18
768 0.18
769 0.22
770 0.26
771 0.28
772 0.28
773 0.33
774 0.33
775 0.38
776 0.46
777 0.49
778 0.53
779 0.61
780 0.69
781 0.72
782 0.79
783 0.82
784 0.85
785 0.82
786 0.79
787 0.72
788 0.68
789 0.6
790 0.54
791 0.48
792 0.38
793 0.35
794 0.3
795 0.26
796 0.2
797 0.16
798 0.13
799 0.1
800 0.09
801 0.07
802 0.06
803 0.05
804 0.04
805 0.04
806 0.06
807 0.07
808 0.08
809 0.08
810 0.08
811 0.09
812 0.1
813 0.11
814 0.1
815 0.09
816 0.1
817 0.12
818 0.12
819 0.12
820 0.11
821 0.11
822 0.11
823 0.1
824 0.09
825 0.07
826 0.08
827 0.08
828 0.08
829 0.08
830 0.08
831 0.08
832 0.09
833 0.1
834 0.1
835 0.11
836 0.12
837 0.14
838 0.17
839 0.21
840 0.25
841 0.33
842 0.4
843 0.5
844 0.58
845 0.66
846 0.74
847 0.81
848 0.87
849 0.89
850 0.91
851 0.89
852 0.9
853 0.91
854 0.91
855 0.9
856 0.9
857 0.9