Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DYV7

Protein Details
Accession C5DYV7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
360-394KVENERRNSRSRIQRKPIKKDSKERARVSKWDLPKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
365-388RRNSRSRIQRKPIKKDSKERARVS
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.666, cyto 6.5, cyto_pero 5.166, cyto_mito 4.666, golg 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040132  Tex1/THOC3  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
KEGG zro:ZYRO0F16104g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MNSNVVNGYCEKLVSGMLNKQHVEAIEDDRYSHVVSRSQSRFAAPISSNRILNLEFHPSGHYMAYSREDGSLTVWRLANVSFARSKKMVIPNAMSRWVSWNHQEISEFATCSGNHELYIWGVDEKKREIVKLRTLSSGNKNNKIERCIFDAQGRWLLSQQGLVLQFWDVKSDYQLKQSYQLDELEANVSDDDVITAVVWTNSGSHVIVGLNSGKMCILQVGEDSVRPLLFIEAHRSAITSMVMDPWGEKLITGGADGSCNIWGLATMCCEKTIDKHSRICCMDVDPSGKILAVTTADNTVQFYDTNELQLLASQNLKTTESDPLIKFYPDKSWFILSGKDDSIERHFTPGNYNDLISFYKVENERRNSRSRIQRKPIKKDSKERARVSKWDLPKTSRFNDRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.18
3 0.22
4 0.27
5 0.32
6 0.32
7 0.33
8 0.33
9 0.3
10 0.28
11 0.25
12 0.26
13 0.25
14 0.25
15 0.25
16 0.24
17 0.25
18 0.23
19 0.24
20 0.21
21 0.21
22 0.24
23 0.34
24 0.36
25 0.39
26 0.39
27 0.37
28 0.37
29 0.33
30 0.37
31 0.29
32 0.33
33 0.38
34 0.4
35 0.38
36 0.36
37 0.37
38 0.3
39 0.31
40 0.27
41 0.26
42 0.23
43 0.23
44 0.25
45 0.24
46 0.24
47 0.22
48 0.19
49 0.13
50 0.15
51 0.18
52 0.18
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.16
57 0.18
58 0.21
59 0.19
60 0.22
61 0.21
62 0.2
63 0.21
64 0.21
65 0.24
66 0.18
67 0.21
68 0.23
69 0.23
70 0.28
71 0.28
72 0.29
73 0.31
74 0.39
75 0.4
76 0.39
77 0.44
78 0.46
79 0.49
80 0.52
81 0.44
82 0.36
83 0.36
84 0.33
85 0.3
86 0.28
87 0.3
88 0.27
89 0.29
90 0.29
91 0.25
92 0.27
93 0.26
94 0.22
95 0.17
96 0.18
97 0.16
98 0.2
99 0.22
100 0.17
101 0.15
102 0.16
103 0.15
104 0.13
105 0.14
106 0.1
107 0.08
108 0.11
109 0.12
110 0.14
111 0.16
112 0.21
113 0.21
114 0.23
115 0.29
116 0.33
117 0.41
118 0.44
119 0.45
120 0.43
121 0.44
122 0.47
123 0.48
124 0.52
125 0.49
126 0.51
127 0.52
128 0.55
129 0.57
130 0.56
131 0.52
132 0.45
133 0.45
134 0.4
135 0.38
136 0.35
137 0.34
138 0.31
139 0.31
140 0.29
141 0.22
142 0.2
143 0.2
144 0.17
145 0.15
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.08
156 0.08
157 0.11
158 0.17
159 0.17
160 0.22
161 0.25
162 0.23
163 0.29
164 0.31
165 0.3
166 0.26
167 0.25
168 0.2
169 0.18
170 0.18
171 0.12
172 0.1
173 0.09
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.05
216 0.07
217 0.07
218 0.13
219 0.13
220 0.15
221 0.14
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.08
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.14
259 0.22
260 0.28
261 0.32
262 0.39
263 0.41
264 0.49
265 0.5
266 0.47
267 0.4
268 0.34
269 0.32
270 0.28
271 0.29
272 0.21
273 0.2
274 0.19
275 0.18
276 0.15
277 0.12
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.14
297 0.14
298 0.11
299 0.14
300 0.13
301 0.14
302 0.15
303 0.17
304 0.16
305 0.16
306 0.21
307 0.21
308 0.27
309 0.26
310 0.28
311 0.28
312 0.28
313 0.28
314 0.24
315 0.3
316 0.28
317 0.31
318 0.3
319 0.31
320 0.32
321 0.32
322 0.36
323 0.29
324 0.29
325 0.27
326 0.26
327 0.23
328 0.24
329 0.27
330 0.28
331 0.26
332 0.26
333 0.27
334 0.27
335 0.33
336 0.34
337 0.34
338 0.29
339 0.29
340 0.25
341 0.26
342 0.27
343 0.22
344 0.2
345 0.15
346 0.21
347 0.25
348 0.33
349 0.4
350 0.46
351 0.53
352 0.58
353 0.65
354 0.64
355 0.7
356 0.73
357 0.74
358 0.77
359 0.79
360 0.83
361 0.86
362 0.9
363 0.92
364 0.92
365 0.92
366 0.91
367 0.92
368 0.93
369 0.92
370 0.9
371 0.9
372 0.86
373 0.84
374 0.82
375 0.8
376 0.78
377 0.77
378 0.76
379 0.72
380 0.74
381 0.74
382 0.72