Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DQD5

Protein Details
Accession C5DQD5    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
309-335GELPSIKQTKGKKRKDRQKMGTKSDLTHydrophilic
425-453ADEVSKGKLSQRRNKERKAKSTKGITNSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
318-327KGKKRKDRQK
432-445KLSQRRNKERKAKS
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.833, cyto 4, cyto_pero 2.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG zro:ZYRO0A10604g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MSKRFNKKNSQKYVVVHRPHDDPEYYDNDASEHVLVPASNPNTAKTAERPPPLVEDPVQTAGKKENEHVGEAMLYGINFDDSKYDYTQHLKPIGTDPENSLYIPAKKPVDKTKSKKSIDDLFVEPKYQNADPSKNEPLFARGVAKPEYLERQQNVADELTGFRPDMNPALREALEALEDEAYVVNKDRELRKAQENTDENDEDDIFQQLLEGGQAADDEEFEDNLDEWDIDNLDEYEDEHYQKEMEELDNVENLEDLKNIDYQADVQRFKKEKKRDIFEDEVSSTGPQSVEPEDEVEEEEEEEEIDGLGELPSIKQTKGKKRKDRQKMGTKSDLTGFSMTSSAIARTETMTILDDKYDNVISGYENYQDEQEDLEEKQSKPFDMSQERSDFESMLDDFLDNYELGKGGREFHKKDEEEQNMKNAADEVSKGKLSQRRNKERKAKSTKGITNSLSSLHI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.77
3 0.71
4 0.65
5 0.61
6 0.58
7 0.57
8 0.47
9 0.41
10 0.39
11 0.4
12 0.4
13 0.36
14 0.32
15 0.28
16 0.27
17 0.24
18 0.2
19 0.14
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.18
25 0.18
26 0.21
27 0.21
28 0.22
29 0.24
30 0.26
31 0.28
32 0.26
33 0.34
34 0.38
35 0.42
36 0.43
37 0.42
38 0.47
39 0.47
40 0.46
41 0.38
42 0.33
43 0.33
44 0.36
45 0.35
46 0.28
47 0.27
48 0.3
49 0.32
50 0.31
51 0.29
52 0.32
53 0.32
54 0.34
55 0.33
56 0.27
57 0.23
58 0.21
59 0.19
60 0.11
61 0.09
62 0.07
63 0.06
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.09
69 0.12
70 0.13
71 0.15
72 0.18
73 0.23
74 0.27
75 0.31
76 0.33
77 0.31
78 0.31
79 0.35
80 0.4
81 0.37
82 0.35
83 0.32
84 0.31
85 0.32
86 0.3
87 0.26
88 0.22
89 0.24
90 0.25
91 0.27
92 0.28
93 0.3
94 0.36
95 0.44
96 0.5
97 0.56
98 0.62
99 0.68
100 0.73
101 0.73
102 0.73
103 0.69
104 0.69
105 0.63
106 0.59
107 0.52
108 0.48
109 0.45
110 0.42
111 0.35
112 0.27
113 0.27
114 0.23
115 0.24
116 0.24
117 0.28
118 0.3
119 0.36
120 0.43
121 0.39
122 0.4
123 0.35
124 0.32
125 0.29
126 0.26
127 0.25
128 0.18
129 0.21
130 0.22
131 0.22
132 0.19
133 0.2
134 0.25
135 0.24
136 0.28
137 0.25
138 0.27
139 0.27
140 0.27
141 0.27
142 0.21
143 0.18
144 0.13
145 0.13
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.13
153 0.14
154 0.13
155 0.14
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.11
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.06
165 0.05
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.11
174 0.13
175 0.18
176 0.22
177 0.26
178 0.33
179 0.38
180 0.39
181 0.44
182 0.44
183 0.42
184 0.43
185 0.39
186 0.31
187 0.27
188 0.25
189 0.17
190 0.14
191 0.13
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.06
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.08
250 0.14
251 0.19
252 0.2
253 0.21
254 0.29
255 0.33
256 0.39
257 0.46
258 0.49
259 0.54
260 0.61
261 0.67
262 0.65
263 0.69
264 0.68
265 0.62
266 0.57
267 0.48
268 0.39
269 0.32
270 0.26
271 0.18
272 0.13
273 0.11
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.03
294 0.04
295 0.03
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.15
303 0.24
304 0.35
305 0.46
306 0.56
307 0.64
308 0.74
309 0.84
310 0.9
311 0.93
312 0.92
313 0.92
314 0.91
315 0.88
316 0.87
317 0.78
318 0.68
319 0.61
320 0.52
321 0.44
322 0.34
323 0.26
324 0.18
325 0.16
326 0.14
327 0.11
328 0.1
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.11
342 0.1
343 0.13
344 0.12
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.09
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.16
362 0.21
363 0.21
364 0.27
365 0.28
366 0.27
367 0.29
368 0.32
369 0.35
370 0.39
371 0.43
372 0.44
373 0.46
374 0.47
375 0.46
376 0.43
377 0.35
378 0.26
379 0.25
380 0.18
381 0.15
382 0.14
383 0.12
384 0.11
385 0.11
386 0.12
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.12
393 0.12
394 0.16
395 0.24
396 0.32
397 0.35
398 0.41
399 0.52
400 0.5
401 0.56
402 0.61
403 0.63
404 0.61
405 0.61
406 0.61
407 0.54
408 0.52
409 0.46
410 0.37
411 0.29
412 0.23
413 0.23
414 0.19
415 0.2
416 0.21
417 0.21
418 0.27
419 0.32
420 0.4
421 0.48
422 0.56
423 0.64
424 0.73
425 0.83
426 0.87
427 0.91
428 0.92
429 0.92
430 0.9
431 0.88
432 0.89
433 0.86
434 0.83
435 0.8
436 0.72
437 0.66
438 0.58