Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DX30

Protein Details
Accession C5DX30    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-100ESQPKIPPPKESKKPVYRERSTPHydrophilic
125-149NNNTNSQDKKNQKEKKNQKGQLLREHydrophilic
367-392MLKKQQRNLRKWQKLENERNGRRDKYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
286-288KRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG zro:ZYRO0F01782g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MTKLQAVEYAVIKIPDILPLQESEVRALCDQLLTSSNGNPDRIAEGFLDILGHSDLSFDFVIGFNNLLSAEEQKPAVESQPKIPPPKESKKPVYRERSTPSLPSEHLSKKNNSSNSKSSNSNSNNNNTNSQDKKNQKEKKNQKGQLLREIEQVSKFLEQEPNPNDVQKFACNCQGSRHPLFEAAPNCLSCGKIICIREGLHLSGCSHCGQDFISLEERFKILQLLKQEKEELENGSARPPEPTEKQRAGKNKAGKSYKISTGIGTNLFTEQDKLFDLLERQKEREKRREKVLRTKEDEQKQEEQNKIVQEREASLDPELAQAQDRLDKLLYFQDTSAERTKIIDNVSDFSMANDSNQWGSARERALMLKKQQRNLRKWQKLENERNGRRDKYVVSMDIGPNGKVTMKEVHKDRGGAVAHSDEEISDVSDEEDARDLKTIHALKDEIESDRRQKGSKLESNTWDYERDKKQFKRPVYIGKDTEDVSKSAKQQQDHARKPRVQADGSDEHFWDKLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.19
4 0.17
5 0.16
6 0.17
7 0.22
8 0.23
9 0.24
10 0.22
11 0.23
12 0.24
13 0.23
14 0.23
15 0.19
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.17
22 0.19
23 0.25
24 0.27
25 0.28
26 0.26
27 0.24
28 0.25
29 0.24
30 0.23
31 0.17
32 0.15
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.09
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.1
44 0.1
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.15
60 0.14
61 0.16
62 0.16
63 0.21
64 0.23
65 0.23
66 0.28
67 0.37
68 0.43
69 0.48
70 0.49
71 0.53
72 0.56
73 0.65
74 0.68
75 0.68
76 0.73
77 0.76
78 0.84
79 0.85
80 0.86
81 0.82
82 0.8
83 0.77
84 0.74
85 0.68
86 0.62
87 0.56
88 0.5
89 0.45
90 0.39
91 0.4
92 0.4
93 0.44
94 0.46
95 0.47
96 0.51
97 0.57
98 0.63
99 0.62
100 0.62
101 0.63
102 0.64
103 0.62
104 0.58
105 0.53
106 0.55
107 0.54
108 0.54
109 0.51
110 0.51
111 0.54
112 0.52
113 0.54
114 0.47
115 0.49
116 0.46
117 0.46
118 0.5
119 0.51
120 0.58
121 0.64
122 0.71
123 0.72
124 0.78
125 0.84
126 0.86
127 0.88
128 0.85
129 0.84
130 0.84
131 0.8
132 0.78
133 0.73
134 0.63
135 0.59
136 0.54
137 0.46
138 0.38
139 0.33
140 0.25
141 0.2
142 0.19
143 0.16
144 0.2
145 0.19
146 0.26
147 0.29
148 0.31
149 0.3
150 0.32
151 0.29
152 0.25
153 0.26
154 0.23
155 0.23
156 0.22
157 0.28
158 0.27
159 0.27
160 0.3
161 0.36
162 0.38
163 0.38
164 0.38
165 0.32
166 0.32
167 0.33
168 0.33
169 0.28
170 0.24
171 0.23
172 0.21
173 0.21
174 0.19
175 0.19
176 0.13
177 0.14
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.16
182 0.18
183 0.18
184 0.21
185 0.2
186 0.19
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.14
191 0.15
192 0.13
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.11
198 0.11
199 0.12
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.1
209 0.12
210 0.19
211 0.26
212 0.26
213 0.28
214 0.29
215 0.26
216 0.27
217 0.26
218 0.2
219 0.15
220 0.16
221 0.15
222 0.16
223 0.17
224 0.15
225 0.14
226 0.14
227 0.16
228 0.19
229 0.24
230 0.28
231 0.34
232 0.37
233 0.42
234 0.49
235 0.51
236 0.53
237 0.56
238 0.53
239 0.55
240 0.55
241 0.52
242 0.49
243 0.47
244 0.44
245 0.39
246 0.35
247 0.27
248 0.25
249 0.25
250 0.2
251 0.16
252 0.13
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.1
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.11
264 0.15
265 0.22
266 0.23
267 0.24
268 0.3
269 0.38
270 0.45
271 0.53
272 0.56
273 0.54
274 0.63
275 0.7
276 0.71
277 0.75
278 0.77
279 0.76
280 0.75
281 0.78
282 0.75
283 0.73
284 0.71
285 0.65
286 0.61
287 0.58
288 0.57
289 0.51
290 0.44
291 0.4
292 0.39
293 0.36
294 0.3
295 0.25
296 0.19
297 0.19
298 0.2
299 0.18
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.12
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.11
315 0.12
316 0.16
317 0.17
318 0.14
319 0.14
320 0.16
321 0.17
322 0.21
323 0.24
324 0.2
325 0.19
326 0.2
327 0.21
328 0.2
329 0.2
330 0.19
331 0.16
332 0.17
333 0.18
334 0.18
335 0.16
336 0.14
337 0.15
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.12
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.17
351 0.2
352 0.26
353 0.3
354 0.37
355 0.42
356 0.47
357 0.53
358 0.59
359 0.65
360 0.66
361 0.71
362 0.74
363 0.73
364 0.73
365 0.76
366 0.79
367 0.8
368 0.84
369 0.83
370 0.83
371 0.8
372 0.83
373 0.81
374 0.73
375 0.65
376 0.58
377 0.49
378 0.44
379 0.43
380 0.36
381 0.31
382 0.34
383 0.31
384 0.33
385 0.32
386 0.25
387 0.21
388 0.2
389 0.18
390 0.14
391 0.16
392 0.19
393 0.22
394 0.28
395 0.32
396 0.38
397 0.39
398 0.4
399 0.38
400 0.37
401 0.34
402 0.29
403 0.27
404 0.22
405 0.2
406 0.19
407 0.19
408 0.11
409 0.11
410 0.1
411 0.09
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.09
417 0.08
418 0.12
419 0.11
420 0.12
421 0.14
422 0.14
423 0.13
424 0.21
425 0.24
426 0.22
427 0.25
428 0.25
429 0.24
430 0.28
431 0.3
432 0.25
433 0.27
434 0.3
435 0.32
436 0.38
437 0.4
438 0.37
439 0.39
440 0.43
441 0.49
442 0.52
443 0.55
444 0.56
445 0.59
446 0.64
447 0.64
448 0.58
449 0.52
450 0.47
451 0.48
452 0.49
453 0.51
454 0.55
455 0.59
456 0.67
457 0.71
458 0.76
459 0.77
460 0.76
461 0.78
462 0.77
463 0.78
464 0.71
465 0.65
466 0.62
467 0.52
468 0.51
469 0.42
470 0.35
471 0.3
472 0.32
473 0.33
474 0.39
475 0.43
476 0.38
477 0.46
478 0.55
479 0.62
480 0.67
481 0.72
482 0.74
483 0.74
484 0.79
485 0.78
486 0.75
487 0.66
488 0.6
489 0.58
490 0.57
491 0.56
492 0.52
493 0.44
494 0.39