Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DP51

Protein Details
Accession C5DP51    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
191-213GKQGSRGGSKTRGKRQKRGTSGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-209EKKSKSSTRGGKQGSRGGSKTRGKRQKRG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 12, mito 9.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG zro:ZYRO0A00462g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MSRKLKRTNLFAKDVSSLLYAYGDVSQPLPETVQCLDELVSGYLVDVCSSAFRAAQNCQRNKLKLEDFRFAVRRDPIKLGRAEDLVATNKLITEAKKQFNGSDSSSLKRFKDGEGNDLEGEGEDEDYEDYDDEADEDAAGGGNTHLDDDDKHMDSEIHHKSKGNIDNSFEDDNELHQVKSEKKSKSSTRGGKQGSRGGSKTRGKRQKRGTSGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.39
3 0.3
4 0.22
5 0.16
6 0.14
7 0.11
8 0.09
9 0.11
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.09
18 0.11
19 0.12
20 0.12
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.07
33 0.05
34 0.05
35 0.06
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.09
40 0.12
41 0.16
42 0.25
43 0.34
44 0.36
45 0.43
46 0.48
47 0.5
48 0.51
49 0.54
50 0.53
51 0.53
52 0.55
53 0.52
54 0.48
55 0.5
56 0.51
57 0.44
58 0.41
59 0.38
60 0.35
61 0.33
62 0.37
63 0.35
64 0.36
65 0.38
66 0.35
67 0.31
68 0.29
69 0.26
70 0.21
71 0.19
72 0.16
73 0.14
74 0.12
75 0.1
76 0.09
77 0.1
78 0.11
79 0.09
80 0.15
81 0.22
82 0.24
83 0.27
84 0.28
85 0.27
86 0.29
87 0.31
88 0.24
89 0.24
90 0.23
91 0.23
92 0.25
93 0.27
94 0.25
95 0.25
96 0.24
97 0.18
98 0.25
99 0.24
100 0.25
101 0.25
102 0.26
103 0.23
104 0.22
105 0.21
106 0.13
107 0.12
108 0.07
109 0.05
110 0.03
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.09
136 0.13
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.24
143 0.28
144 0.28
145 0.28
146 0.29
147 0.31
148 0.39
149 0.46
150 0.43
151 0.37
152 0.38
153 0.4
154 0.43
155 0.42
156 0.34
157 0.29
158 0.23
159 0.21
160 0.23
161 0.21
162 0.16
163 0.17
164 0.21
165 0.25
166 0.33
167 0.4
168 0.39
169 0.44
170 0.53
171 0.59
172 0.65
173 0.7
174 0.71
175 0.72
176 0.77
177 0.78
178 0.75
179 0.74
180 0.71
181 0.67
182 0.64
183 0.58
184 0.54
185 0.57
186 0.59
187 0.63
188 0.67
189 0.71
190 0.73
191 0.8
192 0.85
193 0.87