Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DSE0

Protein Details
Accession C5DSE0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
176-198GEWYCSEKCRREAKKNELGSKKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
188-201AKKNELGSKKGLKR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028651  ING_fam  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG zro:ZYRO0B16104g  -  
CDD cd15505  PHD_ING  
Amino Acid Sequences MDIRYNFLNTLDHFPCELIRTLWTLQSLDTSLDQNEDEDNQDQIAVQMENQVDFLEDLVQSRIKTLTLQRNELLQMQEIRRRYDATRSKDSSKNAPLTIRLNLRNSNSNRVDKASRASVKNNTGKPNITRREEPQEETYCVCHNVSYGSMIACDNDSCSIEWFHYGCVGIVRPLEGEWYCSEKCRREAKKNELGSKKGLKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.24
4 0.23
5 0.16
6 0.16
7 0.18
8 0.19
9 0.21
10 0.21
11 0.19
12 0.17
13 0.18
14 0.18
15 0.15
16 0.15
17 0.15
18 0.13
19 0.14
20 0.14
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.08
33 0.07
34 0.1
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.1
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.12
52 0.19
53 0.27
54 0.29
55 0.33
56 0.32
57 0.34
58 0.35
59 0.35
60 0.28
61 0.21
62 0.21
63 0.2
64 0.24
65 0.24
66 0.25
67 0.24
68 0.25
69 0.24
70 0.3
71 0.36
72 0.39
73 0.45
74 0.47
75 0.51
76 0.53
77 0.55
78 0.51
79 0.49
80 0.45
81 0.38
82 0.35
83 0.33
84 0.3
85 0.31
86 0.29
87 0.26
88 0.25
89 0.27
90 0.28
91 0.33
92 0.33
93 0.38
94 0.37
95 0.37
96 0.36
97 0.36
98 0.36
99 0.29
100 0.3
101 0.29
102 0.29
103 0.29
104 0.32
105 0.35
106 0.41
107 0.47
108 0.48
109 0.46
110 0.43
111 0.44
112 0.45
113 0.49
114 0.48
115 0.46
116 0.45
117 0.45
118 0.52
119 0.52
120 0.5
121 0.48
122 0.45
123 0.42
124 0.4
125 0.37
126 0.28
127 0.27
128 0.23
129 0.16
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.09
145 0.11
146 0.12
147 0.11
148 0.14
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.11
154 0.13
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.15
162 0.13
163 0.15
164 0.15
165 0.21
166 0.21
167 0.26
168 0.33
169 0.35
170 0.43
171 0.51
172 0.58
173 0.63
174 0.73
175 0.77
176 0.81
177 0.84
178 0.86
179 0.84
180 0.78
181 0.76