Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DPC6

Protein Details
Accession C5DPC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-28RQTAQDVSRKDKRRHNIESKVGKIYHydrophilic
277-302EKEQDNRTSERRKHRTSQRYTAKSAPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
KEGG zro:ZYRO0A02244g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MSQRQTAQDVSRKDKRRHNIESKVGKIYQTFVLDKDSYYKDRLTALQTDLTTLHQGNNKSYLRTLRDYEEERDLELVRLRLFEEYRVSRSGVEFQEDIEKAKVEHERLVKLCKEKLYENIQHKIKMLQEDRLLMDVANAHSYAIDYYRGKYQKHTRSHGANGWESSSNEVGGAGTGRGDSANESATDTGTERRSLRRRAATKGAPATSRLASHAEESDFQTNYSSAQGGTNNQNAGGGGPISALKSQDARSTDVNSDSEFMQDISDHAELYALLFGEKEQDNRTSERRKHRTSQRYTAKSAPPLPSLNQDEVSEDIAMIRQMTDQPPAPFKPKTSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.76
3 0.79
4 0.82
5 0.84
6 0.84
7 0.86
8 0.87
9 0.83
10 0.8
11 0.71
12 0.62
13 0.53
14 0.46
15 0.4
16 0.36
17 0.32
18 0.26
19 0.3
20 0.28
21 0.28
22 0.31
23 0.31
24 0.29
25 0.31
26 0.31
27 0.26
28 0.29
29 0.32
30 0.3
31 0.29
32 0.29
33 0.31
34 0.29
35 0.29
36 0.26
37 0.25
38 0.24
39 0.2
40 0.21
41 0.21
42 0.23
43 0.24
44 0.32
45 0.32
46 0.3
47 0.34
48 0.36
49 0.38
50 0.4
51 0.41
52 0.36
53 0.41
54 0.44
55 0.44
56 0.43
57 0.38
58 0.34
59 0.33
60 0.29
61 0.25
62 0.23
63 0.22
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.21
71 0.23
72 0.25
73 0.27
74 0.27
75 0.24
76 0.25
77 0.29
78 0.23
79 0.23
80 0.2
81 0.19
82 0.25
83 0.24
84 0.25
85 0.19
86 0.18
87 0.15
88 0.19
89 0.22
90 0.17
91 0.23
92 0.24
93 0.28
94 0.3
95 0.35
96 0.35
97 0.36
98 0.37
99 0.35
100 0.35
101 0.32
102 0.36
103 0.4
104 0.43
105 0.45
106 0.5
107 0.49
108 0.47
109 0.46
110 0.43
111 0.37
112 0.37
113 0.33
114 0.29
115 0.29
116 0.29
117 0.29
118 0.27
119 0.24
120 0.16
121 0.14
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.09
132 0.08
133 0.1
134 0.17
135 0.2
136 0.21
137 0.28
138 0.37
139 0.43
140 0.5
141 0.54
142 0.53
143 0.54
144 0.58
145 0.54
146 0.49
147 0.41
148 0.34
149 0.31
150 0.26
151 0.22
152 0.19
153 0.15
154 0.11
155 0.09
156 0.08
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.1
176 0.1
177 0.13
178 0.13
179 0.21
180 0.28
181 0.33
182 0.39
183 0.45
184 0.48
185 0.51
186 0.58
187 0.55
188 0.55
189 0.55
190 0.5
191 0.41
192 0.39
193 0.36
194 0.29
195 0.25
196 0.2
197 0.17
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.14
202 0.14
203 0.17
204 0.18
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.1
212 0.07
213 0.09
214 0.1
215 0.13
216 0.17
217 0.19
218 0.18
219 0.18
220 0.17
221 0.16
222 0.15
223 0.12
224 0.07
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.11
233 0.12
234 0.16
235 0.18
236 0.2
237 0.22
238 0.25
239 0.26
240 0.26
241 0.26
242 0.22
243 0.21
244 0.18
245 0.16
246 0.13
247 0.11
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.1
264 0.12
265 0.13
266 0.15
267 0.19
268 0.22
269 0.27
270 0.35
271 0.41
272 0.48
273 0.57
274 0.64
275 0.68
276 0.75
277 0.82
278 0.84
279 0.84
280 0.86
281 0.86
282 0.83
283 0.81
284 0.79
285 0.75
286 0.72
287 0.7
288 0.63
289 0.57
290 0.54
291 0.51
292 0.51
293 0.49
294 0.45
295 0.4
296 0.35
297 0.33
298 0.31
299 0.3
300 0.22
301 0.16
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.12
309 0.15
310 0.19
311 0.23
312 0.27
313 0.33
314 0.37
315 0.42
316 0.41