Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DQJ4

Protein Details
Accession C5DQJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
362-385GKVNDLSKMVKKKKTKSSKGSRRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
371-385VKKKKTKSSKGSRRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 15.333, mito_nucl 9.832, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG zro:ZYRO0B00792g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSNATHKDITTQEVQTLLIEGAKYSASDDAEKAAKCYARILDLESQNAEIYLLLARCLYRLGLKRNDVFGGADDGEDSENDEDEDESDADDEDGEENGDDGEKKQKLNSKLYQFDHEEEDIDESTLQNFEDATNASAYVDARGESILQGGNGQDESKQQDEDEEEEQEADMSIGDTFEDFLQGNLFENGLELLYRARIMYMEPHGEDKEDSEALSKDTQLKLAQLYDLLGDIDQELEDFTQAVRDYEGSLKFYDKSLAPEEREILVDVYLKLTDALRWSDFDDKDSLNKEQRQRHLQELEKLIRSRIDENRSKDVEADQSHLERLKEDQESLKLDKPKAGKSLVPELMAQAILRQALGGSQGKVNDLSKMVKKKKTKSSKGSRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.22
3 0.21
4 0.17
5 0.12
6 0.11
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.09
11 0.09
12 0.12
13 0.12
14 0.14
15 0.14
16 0.17
17 0.22
18 0.22
19 0.23
20 0.25
21 0.25
22 0.23
23 0.27
24 0.26
25 0.24
26 0.25
27 0.29
28 0.32
29 0.33
30 0.35
31 0.31
32 0.3
33 0.26
34 0.25
35 0.2
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.15
47 0.22
48 0.29
49 0.37
50 0.43
51 0.46
52 0.48
53 0.48
54 0.42
55 0.36
56 0.29
57 0.26
58 0.2
59 0.16
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.11
64 0.12
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.14
89 0.16
90 0.17
91 0.21
92 0.29
93 0.34
94 0.43
95 0.5
96 0.5
97 0.56
98 0.58
99 0.6
100 0.56
101 0.52
102 0.47
103 0.39
104 0.32
105 0.24
106 0.23
107 0.17
108 0.15
109 0.13
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.08
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.16
149 0.15
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.06
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.07
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.13
204 0.13
205 0.15
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.13
234 0.14
235 0.13
236 0.14
237 0.15
238 0.16
239 0.16
240 0.17
241 0.14
242 0.17
243 0.2
244 0.24
245 0.24
246 0.25
247 0.26
248 0.24
249 0.24
250 0.21
251 0.16
252 0.13
253 0.12
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.12
263 0.12
264 0.13
265 0.16
266 0.22
267 0.22
268 0.23
269 0.24
270 0.22
271 0.25
272 0.27
273 0.3
274 0.3
275 0.37
276 0.43
277 0.48
278 0.55
279 0.61
280 0.61
281 0.65
282 0.65
283 0.64
284 0.64
285 0.64
286 0.62
287 0.59
288 0.55
289 0.48
290 0.43
291 0.4
292 0.39
293 0.39
294 0.42
295 0.44
296 0.49
297 0.57
298 0.56
299 0.53
300 0.48
301 0.43
302 0.41
303 0.35
304 0.33
305 0.27
306 0.27
307 0.28
308 0.3
309 0.27
310 0.21
311 0.22
312 0.24
313 0.23
314 0.24
315 0.26
316 0.28
317 0.33
318 0.36
319 0.4
320 0.41
321 0.4
322 0.43
323 0.43
324 0.45
325 0.45
326 0.45
327 0.41
328 0.4
329 0.49
330 0.46
331 0.43
332 0.37
333 0.33
334 0.31
335 0.28
336 0.22
337 0.13
338 0.12
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.07
343 0.07
344 0.13
345 0.15
346 0.15
347 0.17
348 0.18
349 0.2
350 0.23
351 0.23
352 0.21
353 0.21
354 0.26
355 0.32
356 0.42
357 0.49
358 0.56
359 0.64
360 0.71
361 0.79
362 0.84
363 0.87
364 0.87
365 0.9