Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DPS0

Protein Details
Accession C5DPS0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-163QDKVNKKTSSARERAKKRKKSTLSDMLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-155NKKTSSARERAKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007175  Rpr2/Snm1/Rpp21  
Gene Ontology GO:1902555  C:endoribonuclease complex  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0034470  P:ncRNA processing  
KEGG zro:ZYRO0A05588g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04032  Rpr2  
Amino Acid Sequences MSMNRSQAEKFKDIHLNHKYNLIHMLPSTEVPALSGFYLKSFYNGTKRYRLRLPESIVEPDSKFCGNCGAVRIPLFNTDMSITESNNEATSESTRTLQYTCLHCKNQAQVAPVRVQKQTPVNVKQSVGAKEEEQKQDKVNKKTSSARERAKKRKKSTLSDMLSQKNEEKKSKSFSLSLESMIQND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.55
4 0.51
5 0.57
6 0.5
7 0.43
8 0.46
9 0.37
10 0.29
11 0.24
12 0.25
13 0.19
14 0.19
15 0.19
16 0.14
17 0.13
18 0.12
19 0.12
20 0.1
21 0.09
22 0.1
23 0.08
24 0.08
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.12
29 0.16
30 0.23
31 0.29
32 0.33
33 0.4
34 0.44
35 0.47
36 0.52
37 0.55
38 0.54
39 0.55
40 0.56
41 0.51
42 0.51
43 0.5
44 0.44
45 0.39
46 0.33
47 0.26
48 0.23
49 0.18
50 0.15
51 0.12
52 0.14
53 0.13
54 0.14
55 0.16
56 0.16
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.14
61 0.15
62 0.15
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.13
68 0.13
69 0.11
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.12
85 0.15
86 0.19
87 0.25
88 0.29
89 0.3
90 0.31
91 0.33
92 0.34
93 0.35
94 0.33
95 0.29
96 0.27
97 0.29
98 0.32
99 0.32
100 0.31
101 0.27
102 0.25
103 0.26
104 0.29
105 0.33
106 0.36
107 0.38
108 0.4
109 0.42
110 0.42
111 0.41
112 0.41
113 0.36
114 0.31
115 0.27
116 0.23
117 0.27
118 0.34
119 0.38
120 0.36
121 0.35
122 0.38
123 0.45
124 0.52
125 0.54
126 0.56
127 0.52
128 0.55
129 0.62
130 0.67
131 0.68
132 0.69
133 0.71
134 0.72
135 0.79
136 0.84
137 0.86
138 0.87
139 0.86
140 0.88
141 0.87
142 0.86
143 0.86
144 0.85
145 0.8
146 0.77
147 0.75
148 0.71
149 0.65
150 0.58
151 0.54
152 0.51
153 0.53
154 0.52
155 0.5
156 0.5
157 0.55
158 0.59
159 0.58
160 0.53
161 0.49
162 0.5
163 0.46
164 0.42
165 0.39