Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DTJ7

Protein Details
Accession C5DTJ7    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-85KCNNCSQRGHFKRNCPHVICHydrophilic
235-262DDEPARKRSKPSSKKRKHNSNNGNGYGNHydrophilic
325-351MDNSRYGRPSSRRNQPRSNYKNYNSFKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-252ARKRSKPSSKKRKH
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.833, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016713  Air1/2_Saccharomycetales  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0043229  C:intracellular organelle  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0043633  P:polyadenylation-dependent RNA catabolic process  
KEGG zro:ZYRO0C09108g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSMLREFETMDTLPFVKETAPQPRDKVVAPTIDEVDDNPEDLRDMRGQGRYFGVAGEDGINEAEPKCNNCSQRGHFKRNCPHVICTYCGAMDDHYSHHCLKAIKCSNCNESGHYRSQCPNKWKRVFCTLCNSKRHSRDRCPSVWRVYILKDENSKRTLPMHAFYCYNCGGKGHLGDECDSRRSSRVPNDDGSAFSGDNLSSELKKDYFQNLRKQRLERDSEFDYKDYEFDDALYDDEPARKRSKPSSKKRKHNSNNGNGYGNGNGSGNGNGNGNGNGNNRHRRSAQPVQPVQRGGTLPPARNRSHPLDFPRNGGGRNASTVTQNMDNSRYGRPSSRRNQPRSNYKNYNSFKPFRSGTLNMRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.11
4 0.16
5 0.22
6 0.3
7 0.35
8 0.39
9 0.42
10 0.46
11 0.48
12 0.45
13 0.45
14 0.39
15 0.39
16 0.38
17 0.38
18 0.35
19 0.32
20 0.31
21 0.25
22 0.25
23 0.2
24 0.18
25 0.15
26 0.13
27 0.13
28 0.14
29 0.17
30 0.13
31 0.16
32 0.2
33 0.27
34 0.27
35 0.29
36 0.3
37 0.28
38 0.26
39 0.23
40 0.19
41 0.13
42 0.13
43 0.11
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.11
51 0.11
52 0.14
53 0.18
54 0.24
55 0.27
56 0.32
57 0.4
58 0.43
59 0.53
60 0.59
61 0.65
62 0.66
63 0.73
64 0.77
65 0.79
66 0.81
67 0.74
68 0.69
69 0.67
70 0.64
71 0.56
72 0.49
73 0.4
74 0.31
75 0.28
76 0.24
77 0.16
78 0.15
79 0.14
80 0.14
81 0.15
82 0.18
83 0.17
84 0.18
85 0.2
86 0.22
87 0.22
88 0.31
89 0.38
90 0.4
91 0.45
92 0.49
93 0.5
94 0.51
95 0.5
96 0.44
97 0.41
98 0.41
99 0.44
100 0.42
101 0.41
102 0.42
103 0.49
104 0.52
105 0.55
106 0.59
107 0.62
108 0.69
109 0.7
110 0.69
111 0.72
112 0.69
113 0.63
114 0.64
115 0.64
116 0.62
117 0.64
118 0.65
119 0.62
120 0.67
121 0.73
122 0.71
123 0.71
124 0.73
125 0.73
126 0.73
127 0.72
128 0.68
129 0.64
130 0.59
131 0.51
132 0.43
133 0.38
134 0.39
135 0.34
136 0.32
137 0.33
138 0.33
139 0.35
140 0.36
141 0.34
142 0.29
143 0.29
144 0.29
145 0.24
146 0.25
147 0.23
148 0.22
149 0.23
150 0.21
151 0.23
152 0.2
153 0.19
154 0.15
155 0.13
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.11
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.14
164 0.14
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.16
170 0.2
171 0.24
172 0.29
173 0.3
174 0.31
175 0.33
176 0.32
177 0.3
178 0.27
179 0.21
180 0.14
181 0.11
182 0.1
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.12
193 0.18
194 0.26
195 0.32
196 0.41
197 0.48
198 0.56
199 0.61
200 0.62
201 0.63
202 0.62
203 0.63
204 0.56
205 0.52
206 0.49
207 0.49
208 0.47
209 0.4
210 0.33
211 0.26
212 0.24
213 0.19
214 0.15
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.12
224 0.14
225 0.16
226 0.19
227 0.21
228 0.25
229 0.35
230 0.46
231 0.52
232 0.62
233 0.7
234 0.77
235 0.85
236 0.92
237 0.93
238 0.92
239 0.93
240 0.92
241 0.91
242 0.9
243 0.82
244 0.74
245 0.63
246 0.54
247 0.43
248 0.33
249 0.23
250 0.14
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.14
262 0.15
263 0.21
264 0.28
265 0.37
266 0.38
267 0.42
268 0.44
269 0.46
270 0.53
271 0.56
272 0.57
273 0.58
274 0.64
275 0.66
276 0.68
277 0.64
278 0.56
279 0.5
280 0.43
281 0.33
282 0.36
283 0.35
284 0.35
285 0.41
286 0.47
287 0.45
288 0.48
289 0.54
290 0.51
291 0.52
292 0.53
293 0.55
294 0.59
295 0.59
296 0.58
297 0.59
298 0.54
299 0.48
300 0.44
301 0.4
302 0.31
303 0.33
304 0.31
305 0.25
306 0.24
307 0.24
308 0.25
309 0.25
310 0.25
311 0.24
312 0.25
313 0.28
314 0.29
315 0.32
316 0.32
317 0.31
318 0.37
319 0.42
320 0.5
321 0.56
322 0.64
323 0.7
324 0.75
325 0.82
326 0.84
327 0.88
328 0.86
329 0.87
330 0.86
331 0.82
332 0.84
333 0.79
334 0.79
335 0.77
336 0.74
337 0.68
338 0.65
339 0.61
340 0.55
341 0.57
342 0.53