Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DPF2

Protein Details
Accession C5DPF2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
960-979ALGTRRKQEKSEKKAAAKESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
965-978RKQEKSEKKAAAKE
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG zro:ZYRO0A02860g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MPQLFIHEDSDDEQLQLELSRQAEEAVELNKAPDQDQPEESPSLEKTPSLEKTPAEPSQPLYPLIPEENLDDNGLKPNLDDIRQVDIQLNLPLTFQQQVVENTLVTDDPLVILGKGIGIISIVANLLFTLATPTRINGQPKRSFVIVMNASPGDNLRISEELQELSWLSSCSEDIQGEDNDIDEDSQRPFHVINAESQNADKRQKLYNSGGIFSVTSRILIVDLLSGLLHPSRITGIVVLNVEKLKSFSNESFILEIYRSKNKWGFIKAFSESPESFVTQFSPLMRKLKELRLKNVTLWPRFRVEISQCLNNAVNPQINKVVEVKVSQTNSMSQIQFGLMECLKKCIAEMNRKNPELVLETWNIENALDPTFVKSIDAVMVPNWHRISYESKQLIKDIRFLKNLLKLLVSGDAVDFYEELQLSLDANKPSISRKYSESPWLMADESQMVISYAKKRIYSDGEYVLEEMPKWEQLISIMEDISYQRAYKDVSGPTLIVCSSYTTASQLARVLSQADRKDGFRRSMLRKLQLYKERREESKTLVKEIREREPDAMPELNVSAAFAKEQVITRRRRTRGAAAMAAVERLKNAGTGEDIESVIDDYNIKEELEPEGLLEMADNEATAPTTEYEDEDDFGEKLFHDMSHNAITKEIWDQRTQYFQFVHRGDQIIIEIFANITDDSYLQEIMPSNIIMYEPDLTFIRRVEIHRAIHREMPPNVCFMYYSNSVEEQGHLVSIRKEKDAFTKLIRENSMLSHHFEADEDLSHYKNLAERKVKLNKLRRITTRVAGGQAALADFTQDIVIVDTREFNAALPGLLYRYGVRVVPCMLTVGDYVITPDICIERKSIADLIGSIQNRRLVSQCKKMRSHYKYPTLLIEFEEGQSFSLEPFSERRNYKSKELSTVHPISNKLSQDEIQSELAKLVMRFPGLKIIWSSSPLQTVNMILELKIGREQPDPSQSVALGTRRKQEKSEKKAAAKESDQKKYARLLRIPGISKVEYFNIRKKVKSYEKLKSLSSQELHDLLGDEDLVDKLCRFLQAEKDDEEDELADSDIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.13
4 0.13
5 0.12
6 0.12
7 0.14
8 0.13
9 0.14
10 0.14
11 0.15
12 0.16
13 0.14
14 0.15
15 0.14
16 0.15
17 0.16
18 0.17
19 0.16
20 0.18
21 0.22
22 0.25
23 0.29
24 0.32
25 0.34
26 0.35
27 0.35
28 0.33
29 0.29
30 0.29
31 0.25
32 0.22
33 0.2
34 0.27
35 0.31
36 0.33
37 0.34
38 0.32
39 0.36
40 0.43
41 0.44
42 0.41
43 0.38
44 0.37
45 0.4
46 0.41
47 0.38
48 0.31
49 0.29
50 0.28
51 0.29
52 0.26
53 0.2
54 0.21
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.2
59 0.19
60 0.24
61 0.23
62 0.2
63 0.16
64 0.21
65 0.23
66 0.24
67 0.27
68 0.23
69 0.29
70 0.3
71 0.3
72 0.27
73 0.25
74 0.25
75 0.25
76 0.24
77 0.17
78 0.17
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.15
83 0.13
84 0.16
85 0.18
86 0.22
87 0.22
88 0.2
89 0.18
90 0.19
91 0.17
92 0.13
93 0.11
94 0.07
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.04
116 0.09
117 0.09
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.2
122 0.26
123 0.34
124 0.36
125 0.46
126 0.5
127 0.53
128 0.57
129 0.52
130 0.49
131 0.42
132 0.44
133 0.38
134 0.31
135 0.31
136 0.27
137 0.26
138 0.24
139 0.23
140 0.16
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.13
145 0.14
146 0.16
147 0.17
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.15
166 0.14
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.14
178 0.19
179 0.18
180 0.23
181 0.28
182 0.29
183 0.28
184 0.3
185 0.33
186 0.32
187 0.35
188 0.32
189 0.3
190 0.36
191 0.39
192 0.45
193 0.45
194 0.47
195 0.45
196 0.43
197 0.4
198 0.33
199 0.29
200 0.23
201 0.2
202 0.13
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.17
235 0.16
236 0.21
237 0.22
238 0.23
239 0.23
240 0.21
241 0.2
242 0.16
243 0.18
244 0.18
245 0.24
246 0.23
247 0.27
248 0.31
249 0.34
250 0.4
251 0.43
252 0.44
253 0.4
254 0.45
255 0.42
256 0.4
257 0.38
258 0.37
259 0.31
260 0.29
261 0.26
262 0.22
263 0.21
264 0.19
265 0.19
266 0.14
267 0.16
268 0.15
269 0.17
270 0.19
271 0.25
272 0.25
273 0.29
274 0.33
275 0.41
276 0.48
277 0.49
278 0.54
279 0.55
280 0.57
281 0.55
282 0.57
283 0.56
284 0.54
285 0.52
286 0.47
287 0.42
288 0.41
289 0.39
290 0.37
291 0.33
292 0.35
293 0.35
294 0.36
295 0.33
296 0.35
297 0.35
298 0.29
299 0.27
300 0.21
301 0.21
302 0.17
303 0.19
304 0.2
305 0.2
306 0.2
307 0.21
308 0.2
309 0.17
310 0.18
311 0.19
312 0.2
313 0.21
314 0.2
315 0.19
316 0.19
317 0.21
318 0.25
319 0.22
320 0.17
321 0.17
322 0.16
323 0.16
324 0.14
325 0.14
326 0.1
327 0.13
328 0.13
329 0.15
330 0.15
331 0.14
332 0.14
333 0.18
334 0.24
335 0.33
336 0.41
337 0.49
338 0.57
339 0.57
340 0.57
341 0.5
342 0.45
343 0.38
344 0.32
345 0.25
346 0.19
347 0.2
348 0.19
349 0.19
350 0.17
351 0.13
352 0.11
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.12
368 0.13
369 0.18
370 0.18
371 0.16
372 0.16
373 0.18
374 0.25
375 0.23
376 0.31
377 0.31
378 0.34
379 0.35
380 0.37
381 0.41
382 0.34
383 0.38
384 0.35
385 0.35
386 0.34
387 0.35
388 0.36
389 0.37
390 0.37
391 0.31
392 0.26
393 0.21
394 0.2
395 0.2
396 0.16
397 0.1
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.04
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.1
412 0.09
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.14
417 0.19
418 0.2
419 0.18
420 0.23
421 0.27
422 0.29
423 0.36
424 0.34
425 0.3
426 0.29
427 0.28
428 0.25
429 0.2
430 0.17
431 0.11
432 0.09
433 0.08
434 0.07
435 0.06
436 0.06
437 0.08
438 0.11
439 0.15
440 0.16
441 0.18
442 0.18
443 0.22
444 0.27
445 0.29
446 0.28
447 0.28
448 0.27
449 0.26
450 0.26
451 0.23
452 0.17
453 0.13
454 0.11
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.05
460 0.06
461 0.08
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.09
469 0.08
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.09
475 0.13
476 0.13
477 0.14
478 0.14
479 0.14
480 0.13
481 0.13
482 0.12
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.08
490 0.09
491 0.09
492 0.1
493 0.1
494 0.09
495 0.09
496 0.09
497 0.1
498 0.1
499 0.15
500 0.15
501 0.16
502 0.17
503 0.18
504 0.23
505 0.25
506 0.25
507 0.24
508 0.31
509 0.33
510 0.41
511 0.44
512 0.45
513 0.46
514 0.48
515 0.51
516 0.53
517 0.53
518 0.5
519 0.55
520 0.53
521 0.51
522 0.51
523 0.45
524 0.43
525 0.46
526 0.41
527 0.37
528 0.36
529 0.35
530 0.36
531 0.38
532 0.39
533 0.34
534 0.35
535 0.33
536 0.31
537 0.3
538 0.27
539 0.24
540 0.17
541 0.13
542 0.12
543 0.09
544 0.08
545 0.07
546 0.05
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.05
551 0.06
552 0.09
553 0.15
554 0.21
555 0.27
556 0.35
557 0.44
558 0.46
559 0.49
560 0.51
561 0.52
562 0.53
563 0.52
564 0.45
565 0.36
566 0.35
567 0.31
568 0.28
569 0.2
570 0.12
571 0.08
572 0.07
573 0.06
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.05
578 0.07
579 0.08
580 0.09
581 0.09
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.07
586 0.06
587 0.05
588 0.04
589 0.05
590 0.06
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.08
595 0.09
596 0.08
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.04
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.06
613 0.06
614 0.07
615 0.09
616 0.09
617 0.1
618 0.1
619 0.1
620 0.09
621 0.09
622 0.09
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.07
628 0.08
629 0.1
630 0.16
631 0.18
632 0.17
633 0.17
634 0.17
635 0.16
636 0.21
637 0.24
638 0.2
639 0.19
640 0.22
641 0.23
642 0.31
643 0.31
644 0.28
645 0.25
646 0.26
647 0.32
648 0.31
649 0.32
650 0.27
651 0.27
652 0.24
653 0.23
654 0.21
655 0.13
656 0.13
657 0.1
658 0.08
659 0.06
660 0.05
661 0.06
662 0.05
663 0.04
664 0.04
665 0.04
666 0.05
667 0.06
668 0.07
669 0.05
670 0.07
671 0.07
672 0.08
673 0.08
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.06
679 0.06
680 0.08
681 0.07
682 0.09
683 0.09
684 0.1
685 0.11
686 0.11
687 0.12
688 0.13
689 0.15
690 0.21
691 0.27
692 0.3
693 0.35
694 0.4
695 0.4
696 0.43
697 0.46
698 0.45
699 0.42
700 0.43
701 0.38
702 0.35
703 0.34
704 0.27
705 0.23
706 0.18
707 0.2
708 0.17
709 0.18
710 0.17
711 0.18
712 0.19
713 0.19
714 0.18
715 0.14
716 0.11
717 0.1
718 0.09
719 0.1
720 0.12
721 0.17
722 0.18
723 0.19
724 0.2
725 0.22
726 0.29
727 0.33
728 0.32
729 0.31
730 0.38
731 0.39
732 0.44
733 0.43
734 0.36
735 0.33
736 0.32
737 0.34
738 0.26
739 0.26
740 0.22
741 0.22
742 0.2
743 0.19
744 0.19
745 0.14
746 0.13
747 0.12
748 0.11
749 0.12
750 0.12
751 0.12
752 0.11
753 0.13
754 0.17
755 0.22
756 0.28
757 0.31
758 0.4
759 0.49
760 0.56
761 0.62
762 0.68
763 0.68
764 0.71
765 0.75
766 0.72
767 0.7
768 0.68
769 0.62
770 0.59
771 0.52
772 0.46
773 0.38
774 0.31
775 0.25
776 0.2
777 0.16
778 0.1
779 0.07
780 0.06
781 0.05
782 0.05
783 0.05
784 0.04
785 0.04
786 0.05
787 0.07
788 0.07
789 0.07
790 0.08
791 0.09
792 0.1
793 0.1
794 0.08
795 0.1
796 0.09
797 0.09
798 0.08
799 0.08
800 0.08
801 0.08
802 0.09
803 0.07
804 0.08
805 0.1
806 0.11
807 0.12
808 0.13
809 0.14
810 0.15
811 0.14
812 0.14
813 0.13
814 0.12
815 0.11
816 0.1
817 0.09
818 0.08
819 0.09
820 0.09
821 0.08
822 0.07
823 0.08
824 0.1
825 0.11
826 0.11
827 0.12
828 0.12
829 0.13
830 0.16
831 0.16
832 0.15
833 0.14
834 0.14
835 0.15
836 0.2
837 0.2
838 0.18
839 0.2
840 0.23
841 0.23
842 0.24
843 0.26
844 0.29
845 0.36
846 0.46
847 0.51
848 0.55
849 0.61
850 0.68
851 0.74
852 0.74
853 0.77
854 0.76
855 0.78
856 0.75
857 0.72
858 0.7
859 0.62
860 0.54
861 0.45
862 0.38
863 0.29
864 0.24
865 0.23
866 0.16
867 0.14
868 0.14
869 0.12
870 0.09
871 0.1
872 0.09
873 0.1
874 0.13
875 0.16
876 0.24
877 0.26
878 0.32
879 0.4
880 0.44
881 0.51
882 0.57
883 0.57
884 0.59
885 0.6
886 0.59
887 0.59
888 0.59
889 0.55
890 0.49
891 0.46
892 0.41
893 0.43
894 0.4
895 0.33
896 0.31
897 0.29
898 0.29
899 0.3
900 0.29
901 0.26
902 0.25
903 0.23
904 0.2
905 0.2
906 0.18
907 0.16
908 0.16
909 0.15
910 0.16
911 0.17
912 0.17
913 0.25
914 0.23
915 0.25
916 0.24
917 0.25
918 0.26
919 0.27
920 0.3
921 0.23
922 0.27
923 0.26
924 0.25
925 0.22
926 0.21
927 0.19
928 0.19
929 0.18
930 0.13
931 0.16
932 0.15
933 0.15
934 0.18
935 0.19
936 0.18
937 0.21
938 0.24
939 0.26
940 0.34
941 0.35
942 0.33
943 0.33
944 0.3
945 0.3
946 0.32
947 0.33
948 0.32
949 0.34
950 0.41
951 0.46
952 0.49
953 0.53
954 0.6
955 0.64
956 0.67
957 0.74
958 0.74
959 0.75
960 0.8
961 0.8
962 0.76
963 0.73
964 0.73
965 0.72
966 0.72
967 0.68
968 0.62
969 0.59
970 0.6
971 0.6
972 0.6
973 0.56
974 0.54
975 0.57
976 0.63
977 0.62
978 0.58
979 0.56
980 0.48
981 0.44
982 0.4
983 0.38
984 0.38
985 0.4
986 0.44
987 0.48
988 0.51
989 0.53
990 0.54
991 0.6
992 0.63
993 0.67
994 0.69
995 0.69
996 0.74
997 0.74
998 0.74
999 0.7
1000 0.65
1001 0.63
1002 0.56
1003 0.49
1004 0.44
1005 0.41
1006 0.38
1007 0.31
1008 0.27
1009 0.19
1010 0.17
1011 0.14
1012 0.09
1013 0.09
1014 0.09
1015 0.1
1016 0.09
1017 0.09
1018 0.1
1019 0.12
1020 0.14
1021 0.16
1022 0.2
1023 0.28
1024 0.34
1025 0.38
1026 0.39
1027 0.41
1028 0.39
1029 0.37
1030 0.33
1031 0.24
1032 0.19
1033 0.15