Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DTC1

Protein Details
Accession C5DTC1    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-112SGLSLPKKGEKKRGKPPGKTNQSGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-106PKKGEKKRGKPPGK
271-274RRVK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG zro:ZYRO0C07282g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MVSPKREAEETLENATSIKKSRAGTPFGRTDPAFDIGNSEPGFDEASGAQGGEDVSTPFGQQQLGTEFEVLSLPKNAPPSTDLQRSDSGLSLPKKGEKKRGKPPGKTNQSGSVSAQQKSNASSSSTGAGPQSSKNSQSDPNKMSDVLFSAGVDIREEEALLNSSVNASKSHLQSTDVKIPSHPPFLHPDQVNQFMRKVCKEQNFSQNFAKNPEILRMMSSACESYMRDVITNSLIISRHRRKAVKINSGRRSETSVALKSIAMNQKKEEERRVKKRVALGLEKEDLENKMDSEETLHRASNVTAGLRAGSKKQYGWLTSSTSKPTSLGGLTSGKVASAVAARGDTGLRFREAREEPGIVMRDLLYALENRRNGVHNVISKGYARIRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.28
4 0.23
5 0.23
6 0.24
7 0.25
8 0.34
9 0.41
10 0.46
11 0.48
12 0.53
13 0.57
14 0.54
15 0.57
16 0.49
17 0.46
18 0.42
19 0.39
20 0.32
21 0.24
22 0.26
23 0.22
24 0.29
25 0.25
26 0.21
27 0.18
28 0.18
29 0.2
30 0.15
31 0.15
32 0.09
33 0.11
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.12
50 0.13
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.14
55 0.14
56 0.16
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.18
63 0.17
64 0.17
65 0.2
66 0.24
67 0.29
68 0.36
69 0.35
70 0.35
71 0.38
72 0.38
73 0.37
74 0.32
75 0.26
76 0.26
77 0.26
78 0.26
79 0.25
80 0.3
81 0.37
82 0.42
83 0.51
84 0.54
85 0.62
86 0.69
87 0.78
88 0.81
89 0.82
90 0.87
91 0.88
92 0.87
93 0.82
94 0.75
95 0.73
96 0.67
97 0.59
98 0.51
99 0.49
100 0.43
101 0.4
102 0.38
103 0.3
104 0.28
105 0.28
106 0.27
107 0.19
108 0.17
109 0.17
110 0.16
111 0.17
112 0.16
113 0.14
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.13
118 0.17
119 0.17
120 0.2
121 0.21
122 0.23
123 0.3
124 0.35
125 0.41
126 0.38
127 0.39
128 0.37
129 0.36
130 0.34
131 0.27
132 0.22
133 0.15
134 0.13
135 0.1
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.13
156 0.14
157 0.16
158 0.16
159 0.18
160 0.22
161 0.26
162 0.33
163 0.3
164 0.29
165 0.28
166 0.32
167 0.32
168 0.33
169 0.28
170 0.22
171 0.26
172 0.29
173 0.34
174 0.29
175 0.3
176 0.28
177 0.35
178 0.35
179 0.3
180 0.3
181 0.26
182 0.28
183 0.26
184 0.28
185 0.26
186 0.32
187 0.37
188 0.4
189 0.48
190 0.49
191 0.51
192 0.52
193 0.49
194 0.43
195 0.41
196 0.36
197 0.28
198 0.26
199 0.24
200 0.21
201 0.17
202 0.17
203 0.14
204 0.13
205 0.12
206 0.12
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.12
223 0.21
224 0.27
225 0.32
226 0.38
227 0.4
228 0.43
229 0.52
230 0.6
231 0.61
232 0.64
233 0.69
234 0.71
235 0.73
236 0.71
237 0.62
238 0.58
239 0.49
240 0.44
241 0.39
242 0.33
243 0.29
244 0.28
245 0.26
246 0.21
247 0.26
248 0.28
249 0.27
250 0.26
251 0.27
252 0.34
253 0.39
254 0.43
255 0.46
256 0.49
257 0.56
258 0.65
259 0.71
260 0.69
261 0.68
262 0.7
263 0.67
264 0.63
265 0.6
266 0.55
267 0.53
268 0.5
269 0.46
270 0.4
271 0.35
272 0.29
273 0.23
274 0.19
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.13
280 0.16
281 0.17
282 0.19
283 0.19
284 0.18
285 0.19
286 0.19
287 0.18
288 0.17
289 0.13
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.16
295 0.16
296 0.19
297 0.21
298 0.21
299 0.27
300 0.31
301 0.3
302 0.33
303 0.32
304 0.34
305 0.36
306 0.39
307 0.38
308 0.35
309 0.33
310 0.3
311 0.28
312 0.24
313 0.21
314 0.18
315 0.17
316 0.18
317 0.17
318 0.18
319 0.17
320 0.14
321 0.13
322 0.12
323 0.1
324 0.09
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.14
334 0.16
335 0.17
336 0.18
337 0.26
338 0.28
339 0.33
340 0.34
341 0.33
342 0.31
343 0.37
344 0.38
345 0.29
346 0.27
347 0.22
348 0.18
349 0.17
350 0.16
351 0.11
352 0.13
353 0.17
354 0.23
355 0.24
356 0.25
357 0.28
358 0.31
359 0.31
360 0.34
361 0.37
362 0.36
363 0.4
364 0.4
365 0.4
366 0.38
367 0.42