Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DT51

Protein Details
Accession C5DT51    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-100ASKPEESKKRPLERIKPSIRTRBasic
269-296EWHRREAGKAQRREKKYQKELLKMRMKTBasic
299-319QEFTTKIKERKHGKAHEHDFSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
272-300RREAGKAQRREKKYQKELLKMRMKTRAQE
303-311TKIKERKHG
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG zro:ZYRO0C05522g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MSKMNDEQKARIEANRERALERLKKRGILKDNELKQIEKRNEPTKEPFKEATANTPHQSLVTESQASANVPSNSTSSDASKPEESKKRPLERIKPSIRTRDYIEYDFSTMKNLHGGYINPEDRPSTFDDEDVMGSKRQKTLEDWKREQQERRYLYENAPPPTHISEASKCIECGINIEMDPVMDDVFKIRVCKSCVKKMPQKYSLLTKTECKEDYFLTESELMDETIFHKLEKPNPHSGTFARMQLFVRCEVEAFAFKKWQSEEGLDAEWHRREAGKAQRREKKYQKELLKMRMKTRAQEFTTKIKERKHGKAHEHDFSAAMEGGTDEDGHKLLRRRCIECGLETEEVTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.56
3 0.52
4 0.47
5 0.5
6 0.55
7 0.57
8 0.57
9 0.57
10 0.54
11 0.59
12 0.64
13 0.68
14 0.68
15 0.67
16 0.7
17 0.7
18 0.72
19 0.74
20 0.7
21 0.62
22 0.59
23 0.61
24 0.58
25 0.56
26 0.57
27 0.58
28 0.61
29 0.65
30 0.69
31 0.69
32 0.68
33 0.65
34 0.6
35 0.54
36 0.56
37 0.51
38 0.5
39 0.48
40 0.47
41 0.42
42 0.41
43 0.38
44 0.31
45 0.31
46 0.25
47 0.21
48 0.2
49 0.19
50 0.18
51 0.2
52 0.2
53 0.2
54 0.18
55 0.2
56 0.17
57 0.17
58 0.18
59 0.17
60 0.17
61 0.19
62 0.18
63 0.16
64 0.19
65 0.2
66 0.23
67 0.26
68 0.29
69 0.36
70 0.44
71 0.45
72 0.51
73 0.59
74 0.65
75 0.69
76 0.76
77 0.77
78 0.77
79 0.83
80 0.82
81 0.81
82 0.79
83 0.8
84 0.73
85 0.66
86 0.61
87 0.59
88 0.54
89 0.47
90 0.44
91 0.36
92 0.34
93 0.33
94 0.27
95 0.22
96 0.18
97 0.16
98 0.16
99 0.15
100 0.13
101 0.14
102 0.15
103 0.16
104 0.23
105 0.24
106 0.21
107 0.22
108 0.22
109 0.2
110 0.22
111 0.21
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.19
116 0.19
117 0.19
118 0.18
119 0.16
120 0.12
121 0.14
122 0.16
123 0.17
124 0.18
125 0.19
126 0.22
127 0.32
128 0.39
129 0.46
130 0.49
131 0.53
132 0.61
133 0.65
134 0.66
135 0.63
136 0.63
137 0.57
138 0.56
139 0.54
140 0.48
141 0.45
142 0.45
143 0.43
144 0.36
145 0.33
146 0.29
147 0.27
148 0.26
149 0.25
150 0.19
151 0.17
152 0.16
153 0.19
154 0.21
155 0.19
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.13
160 0.13
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.09
177 0.13
178 0.17
179 0.26
180 0.3
181 0.39
182 0.45
183 0.52
184 0.6
185 0.65
186 0.71
187 0.69
188 0.68
189 0.61
190 0.63
191 0.6
192 0.56
193 0.48
194 0.44
195 0.4
196 0.4
197 0.38
198 0.3
199 0.26
200 0.23
201 0.25
202 0.22
203 0.2
204 0.18
205 0.18
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.12
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.11
214 0.11
215 0.09
216 0.13
217 0.16
218 0.23
219 0.32
220 0.37
221 0.43
222 0.46
223 0.47
224 0.46
225 0.43
226 0.43
227 0.36
228 0.35
229 0.26
230 0.25
231 0.25
232 0.26
233 0.27
234 0.23
235 0.22
236 0.18
237 0.17
238 0.16
239 0.16
240 0.18
241 0.17
242 0.17
243 0.19
244 0.19
245 0.23
246 0.23
247 0.24
248 0.21
249 0.22
250 0.23
251 0.22
252 0.23
253 0.2
254 0.21
255 0.23
256 0.21
257 0.19
258 0.17
259 0.16
260 0.16
261 0.24
262 0.33
263 0.38
264 0.46
265 0.56
266 0.65
267 0.7
268 0.79
269 0.81
270 0.81
271 0.82
272 0.82
273 0.81
274 0.82
275 0.84
276 0.84
277 0.83
278 0.78
279 0.74
280 0.74
281 0.68
282 0.65
283 0.65
284 0.63
285 0.58
286 0.61
287 0.59
288 0.59
289 0.66
290 0.67
291 0.65
292 0.63
293 0.68
294 0.67
295 0.73
296 0.74
297 0.74
298 0.75
299 0.81
300 0.81
301 0.79
302 0.74
303 0.65
304 0.55
305 0.46
306 0.39
307 0.29
308 0.21
309 0.14
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.1
318 0.15
319 0.22
320 0.27
321 0.36
322 0.43
323 0.46
324 0.51
325 0.59
326 0.58
327 0.54
328 0.54
329 0.5
330 0.45