FuNGI

C5DRR7

Protein Details

Accession

C5DRR7

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-36	IKPDRLRRNFLRARRSRGAT	Hydrophilic
272-291	DGGGRAKRGNTRRKTRQLKV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
28-33	RARRSR
276-286	RAKRGNTRRKT

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	zro:ZYRO0B10626g -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MAYSRSGNGSSGVSPFIKPDRLRRNFLRARRSRGATPKTTIKKDDPEIQEARERMMLHQGNSTMENGKIKVKEEAPEEFNEFPLRAVAKEELDNMRTHLLKFQSKKGINPTQDFHLPIRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEITDYKKKQESERTGNKRNNDNVAQNQTGEAVENHVDKRSPGSPPAGTQAGTEASPEDPSGAESPQGQGPSAGENPSKPTEGMPVVTKLEEAGPAADPTKVGMVKYDGEEALDEQDDLATMDPLADVAPDGGGRAKRGNTRRKTRQLKVLDENAKKLRFEEFYPWVMEDFDGYNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVEDDGSFTMIPADKVYKFTARNKYATLTIEEAEKRMDKKSGEVPRWLMKHLDNIGTTTTRYDRTKRRLKAVNDQHGNDDGEHSDNSEVELDYDEEFADDEEAPIIDGDEKENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDENAPNEDEEDDLFNEKKIDEEGERIKRALQKTELAALYSSDDEEINPYLSESDVENKEQSEQGNKENSEESPSSKKGSPKKNVGSSSSLNAHREPQIKVKSIKDCVIVLKADKKVLTNFPGGDWNPELSKRKREDGTADAAENTPSKKVKLEENATPLIAEQDIIDAIGDGKVNVKDFGKTIRRKYPGPDNKKLMVAIVKKLCRKVDDEHMELKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.22
3	0.25
4	0.31
5	0.33
6	0.41
7	0.49
8	0.55
9	0.63
10	0.66
11	0.72
12	0.73
13	0.79
14	0.8
15	0.77
16	0.8
17	0.81
18	0.79
19	0.77
20	0.79
21	0.79
22	0.74
23	0.72
24	0.73
25	0.73
26	0.74
27	0.72
28	0.68
29	0.68
30	0.67
31	0.7
32	0.65
33	0.64
34	0.6
35	0.57
36	0.57
37	0.49
38	0.45
39	0.39
40	0.34
41	0.28
42	0.35
43	0.35
44	0.29
45	0.33
46	0.32
47	0.3
48	0.31
49	0.31
50	0.23
51	0.22
52	0.24
53	0.22
54	0.26
55	0.27
56	0.27
57	0.32
58	0.32
59	0.35
60	0.35
61	0.4
62	0.37
63	0.38
64	0.4
65	0.35
66	0.33
67	0.3
68	0.26
69	0.21
70	0.21
71	0.18
72	0.15
73	0.17
74	0.18
75	0.19
76	0.2
77	0.24
78	0.25
79	0.26
80	0.26
81	0.24
82	0.26
83	0.25
84	0.24
85	0.25
86	0.28
87	0.34
88	0.38
89	0.44
90	0.5
91	0.51
92	0.56
93	0.6
94	0.63
95	0.61
96	0.62
97	0.57
98	0.52
99	0.53
100	0.51
101	0.43
102	0.42
103	0.35
104	0.37
105	0.45
106	0.44
107	0.47
108	0.51
109	0.57
110	0.58
111	0.67
112	0.71
113	0.69
114	0.67
115	0.67
116	0.63
117	0.58
118	0.56
119	0.47
120	0.38
121	0.29
122	0.32
123	0.3
124	0.34
125	0.37
126	0.33
127	0.32
128	0.32
129	0.36
130	0.37
131	0.42
132	0.45
133	0.46
134	0.52
135	0.59
136	0.61
137	0.64
138	0.68
139	0.69
140	0.68
141	0.73
142	0.74
143	0.76
144	0.79
145	0.78
146	0.76
147	0.71
148	0.68
149	0.62
150	0.59
151	0.57
152	0.58
153	0.52
154	0.44
155	0.39
156	0.32
157	0.27
158	0.22
159	0.15
160	0.1
161	0.11
162	0.13
163	0.14
164	0.14
165	0.15
166	0.14
167	0.18
168	0.19
169	0.2
170	0.2
171	0.24
172	0.24
173	0.26
174	0.3
175	0.27
176	0.24
177	0.21
178	0.2
179	0.16
180	0.15
181	0.13
182	0.1
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.08
187	0.07
188	0.08
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.11
194	0.13
195	0.13
196	0.11
197	0.1
198	0.1
199	0.13
200	0.14
201	0.15
202	0.14
203	0.14
204	0.18
205	0.2
206	0.2
207	0.17
208	0.16
209	0.18
210	0.18
211	0.19
212	0.17
213	0.17
214	0.17
215	0.17
216	0.16
217	0.13
218	0.12
219	0.11
220	0.09
221	0.08
222	0.07
223	0.08
224	0.09
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.1
229	0.1
230	0.09
231	0.1
232	0.11
233	0.12
234	0.13
235	0.15
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.07
243	0.06
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.04
249	0.03
250	0.04
251	0.03
252	0.04
253	0.04
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.06
261	0.07
262	0.08
263	0.1
264	0.13
265	0.21
266	0.3
267	0.4
268	0.46
269	0.56
270	0.66
271	0.74
272	0.8
273	0.79
274	0.8
275	0.77
276	0.75
277	0.71
278	0.7
279	0.68
280	0.6
281	0.6
282	0.56
283	0.5
284	0.42
285	0.37
286	0.31
287	0.24
288	0.24
289	0.25
290	0.24
291	0.24
292	0.25
293	0.24
294	0.21
295	0.19
296	0.17
297	0.12
298	0.09
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.07
305	0.06
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.06
310	0.06
311	0.08
312	0.07
313	0.07
314	0.08
315	0.07
316	0.07
317	0.06
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.08
334	0.08
335	0.1
336	0.12
337	0.15
338	0.19
339	0.27
340	0.36
341	0.37
342	0.39
343	0.38
344	0.38
345	0.36
346	0.34
347	0.28
348	0.2
349	0.17
350	0.18
351	0.17
352	0.16
353	0.14
354	0.15
355	0.14
356	0.14
357	0.17
358	0.14
359	0.17
360	0.25
361	0.32
362	0.33
363	0.35
364	0.36
365	0.39
366	0.4
367	0.38
368	0.32
369	0.24
370	0.27
371	0.27
372	0.26
373	0.21
374	0.2
375	0.21
376	0.19
377	0.18
378	0.14
379	0.14
380	0.15
381	0.17
382	0.23
383	0.31
384	0.4
385	0.5
386	0.52
387	0.59
388	0.64
389	0.66
390	0.7
391	0.72
392	0.72
393	0.67
394	0.64
395	0.57
396	0.51
397	0.47
398	0.36
399	0.26
400	0.17
401	0.14
402	0.13
403	0.12
404	0.09
405	0.08
406	0.09
407	0.09
408	0.08
409	0.06
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.08
414	0.07
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.07
429	0.12
430	0.13
431	0.14
432	0.15
433	0.15
434	0.18
435	0.23
436	0.3
437	0.35
438	0.37
439	0.4
440	0.42
441	0.45
442	0.51
443	0.5
444	0.44
445	0.37
446	0.34
447	0.32
448	0.32
449	0.28
450	0.19
451	0.14
452	0.13
453	0.13
454	0.13
455	0.12
456	0.11
457	0.12
458	0.12
459	0.14
460	0.12
461	0.1
462	0.1
463	0.11
464	0.1
465	0.12
466	0.12
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.11
471	0.1
472	0.12
473	0.11
474	0.16
475	0.24
476	0.3
477	0.32
478	0.32
479	0.35
480	0.38
481	0.39
482	0.4
483	0.35
484	0.32
485	0.33
486	0.38
487	0.35
488	0.3
489	0.27
490	0.22
491	0.19
492	0.16
493	0.14
494	0.09
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.1
499	0.09
500	0.09
501	0.09
502	0.08
503	0.09
504	0.09
505	0.08
506	0.14
507	0.15
508	0.17
509	0.18
510	0.18
511	0.2
512	0.21
513	0.21
514	0.23
515	0.23
516	0.27
517	0.33
518	0.33
519	0.33
520	0.33
521	0.32
522	0.3
523	0.29
524	0.28
525	0.28
526	0.29
527	0.31
528	0.34
529	0.41
530	0.44
531	0.53
532	0.58
533	0.61
534	0.69
535	0.73
536	0.74
537	0.71
538	0.68
539	0.6
540	0.56
541	0.53
542	0.47
543	0.41
544	0.38
545	0.37
546	0.37
547	0.39
548	0.37
549	0.39
550	0.43
551	0.47
552	0.5
553	0.54
554	0.55
555	0.56
556	0.56
557	0.5
558	0.45
559	0.41
560	0.4
561	0.35
562	0.31
563	0.34
564	0.33
565	0.33
566	0.32
567	0.32
568	0.33
569	0.37
570	0.37
571	0.35
572	0.33
573	0.31
574	0.38
575	0.35
576	0.35
577	0.3
578	0.28
579	0.26
580	0.32
581	0.38
582	0.36
583	0.46
584	0.46
585	0.52
586	0.53
587	0.56
588	0.56
589	0.53
590	0.56
591	0.49
592	0.45
593	0.39
594	0.36
595	0.33
596	0.29
597	0.25
598	0.22
599	0.2
600	0.2
601	0.24
602	0.26
603	0.33
604	0.41
605	0.46
606	0.48
607	0.52
608	0.53
609	0.49
610	0.46
611	0.37
612	0.29
613	0.23
614	0.15
615	0.09
616	0.08
617	0.08
618	0.07
619	0.07
620	0.06
621	0.06
622	0.07
623	0.07
624	0.06
625	0.1
626	0.12
627	0.14
628	0.16
629	0.17
630	0.18
631	0.19
632	0.29
633	0.35
634	0.42
635	0.49
636	0.57
637	0.61
638	0.62
639	0.68
640	0.7
641	0.71
642	0.73
643	0.74
644	0.72
645	0.7
646	0.7
647	0.63
648	0.56
649	0.53
650	0.48
651	0.47
652	0.49
653	0.52
654	0.54
655	0.6
656	0.6
657	0.55
658	0.55
659	0.53
660	0.55
661	0.56
662	0.56

C5DRR7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer