Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DR43

Protein Details
Accession C5DR43    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-68AANNPSQKQNKGNGKKNDKKSADGGDKTAPKSFRRSKARNNNRRRDRGTKRGPPGVKHydrophilic
240-284ALAGDNKPKKSKKKKKKSQQKEVKEPKPKKNKTKKSKSGAQAGGKBasic
305-351LEAAGKKELQRRKKVQDTDGKPTEKSKSSAKKNSKKPVKLLKKEPQEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-66QNKGNGKKNDKKSADGGDKTAPKSFRRSKARNNNRRRDRGTKRGPPG
246-280KPKKSKKKKKKSQQKEVKEPKPKKNKTKKSKSGAQ
310-348KKELQRRKKVQDTDGKPTEKSKSSAKKNSKKPVKLLKKE
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG zro:ZYRO0B05412g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MPNMAVDEPHKAANNPSQKQNKGNGKKNDKKSADGGDKTAPKSFRRSKARNNNRRRDRGTKRGPPGVKLILRLLPPTLTKDQFLETLKPVVGDLSSWQLLRWYYVQGYYTSKIFAEPVYSRCYFIFSNMDQLKHFAQLVEPLTFVDDKDNSAKAVLKLSSYCESYDDDNRKPSRSSEALEGSLDQDIFFQTFMNSMKLMEQSSEYSYADVNLLKPLEKEMNKQRELELAIQKRSESALVALAGDNKPKKSKKKKKKSQQKEVKEPKPKKNKTKKSKSGAQAGGKGSTTAPASDGKSGDNSNVVILEAAGKKELQRRKKVQDTDGKPTEKSKSSAKKNSKKPVKLLKKEPQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.43
3 0.51
4 0.57
5 0.6
6 0.66
7 0.71
8 0.73
9 0.73
10 0.78
11 0.79
12 0.81
13 0.86
14 0.89
15 0.9
16 0.82
17 0.77
18 0.73
19 0.72
20 0.71
21 0.63
22 0.57
23 0.54
24 0.56
25 0.53
26 0.53
27 0.47
28 0.41
29 0.48
30 0.54
31 0.56
32 0.61
33 0.68
34 0.73
35 0.81
36 0.89
37 0.9
38 0.91
39 0.92
40 0.92
41 0.94
42 0.9
43 0.9
44 0.88
45 0.88
46 0.88
47 0.87
48 0.84
49 0.84
50 0.78
51 0.7
52 0.67
53 0.65
54 0.56
55 0.49
56 0.44
57 0.39
58 0.37
59 0.35
60 0.29
61 0.23
62 0.22
63 0.25
64 0.28
65 0.25
66 0.25
67 0.25
68 0.26
69 0.28
70 0.29
71 0.27
72 0.23
73 0.24
74 0.23
75 0.22
76 0.2
77 0.16
78 0.13
79 0.1
80 0.09
81 0.11
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.13
86 0.13
87 0.15
88 0.15
89 0.13
90 0.13
91 0.15
92 0.16
93 0.16
94 0.2
95 0.19
96 0.18
97 0.17
98 0.16
99 0.15
100 0.14
101 0.12
102 0.13
103 0.14
104 0.15
105 0.2
106 0.21
107 0.22
108 0.21
109 0.24
110 0.19
111 0.2
112 0.22
113 0.17
114 0.26
115 0.27
116 0.28
117 0.25
118 0.27
119 0.25
120 0.21
121 0.21
122 0.12
123 0.1
124 0.13
125 0.15
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.08
134 0.1
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.12
139 0.14
140 0.12
141 0.15
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.16
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.13
150 0.14
151 0.16
152 0.23
153 0.24
154 0.24
155 0.3
156 0.31
157 0.32
158 0.31
159 0.3
160 0.29
161 0.27
162 0.27
163 0.24
164 0.25
165 0.24
166 0.23
167 0.22
168 0.17
169 0.15
170 0.13
171 0.08
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.17
204 0.18
205 0.24
206 0.31
207 0.4
208 0.42
209 0.42
210 0.41
211 0.38
212 0.39
213 0.39
214 0.38
215 0.34
216 0.34
217 0.34
218 0.33
219 0.3
220 0.28
221 0.22
222 0.14
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.09
228 0.12
229 0.12
230 0.16
231 0.18
232 0.18
233 0.26
234 0.33
235 0.43
236 0.52
237 0.63
238 0.69
239 0.79
240 0.88
241 0.91
242 0.96
243 0.96
244 0.96
245 0.96
246 0.95
247 0.95
248 0.95
249 0.94
250 0.93
251 0.91
252 0.9
253 0.9
254 0.89
255 0.89
256 0.9
257 0.91
258 0.91
259 0.94
260 0.93
261 0.91
262 0.91
263 0.87
264 0.86
265 0.83
266 0.78
267 0.73
268 0.65
269 0.58
270 0.48
271 0.41
272 0.31
273 0.25
274 0.2
275 0.14
276 0.13
277 0.14
278 0.16
279 0.18
280 0.19
281 0.18
282 0.2
283 0.2
284 0.2
285 0.18
286 0.17
287 0.14
288 0.14
289 0.13
290 0.09
291 0.09
292 0.13
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.17
298 0.26
299 0.35
300 0.4
301 0.49
302 0.58
303 0.67
304 0.77
305 0.81
306 0.82
307 0.84
308 0.82
309 0.81
310 0.81
311 0.73
312 0.65
313 0.62
314 0.6
315 0.54
316 0.5
317 0.5
318 0.52
319 0.59
320 0.69
321 0.75
322 0.78
323 0.83
324 0.91
325 0.91
326 0.89
327 0.89
328 0.9
329 0.9
330 0.9
331 0.9