Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DPX5

Protein Details
Accession C5DPX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-43IADLKDQKNKERHKMRAQRAKEEREDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-41NKERHKMRAQRAKEER
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG zro:ZYRO0A06930g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAAEELKIKNKMLRQQIIADLKDQKNKERHKMRAQRAKEEREDPTAKEKRLAENVPKTIEGMRVYDETIGQKDEADEEDLMQLFNNNGEPPKILLTTSINAKRNAYEFANVLIEIFPNVTFVKRKFGLTMKDIVEASSKRNFTDIIIINEDKKKVTGLTFMHLPEGPSFYFKVSSYVDVKKIVGHGRPTSHIPELILNNFSTRLGKTVGTLFQSIFPKNPDFEGRQVITLHNQRDYIFFRRHRYVFENEKKVGLQELGPQFTLKLRRLQRGIKEETEWEYRPEMDKEKKKFYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.52
3 0.59
4 0.61
5 0.55
6 0.52
7 0.52
8 0.5
9 0.54
10 0.52
11 0.52
12 0.54
13 0.62
14 0.68
15 0.69
16 0.73
17 0.77
18 0.85
19 0.87
20 0.88
21 0.85
22 0.86
23 0.85
24 0.84
25 0.8
26 0.75
27 0.68
28 0.66
29 0.63
30 0.55
31 0.56
32 0.55
33 0.49
34 0.49
35 0.48
36 0.47
37 0.52
38 0.55
39 0.54
40 0.55
41 0.58
42 0.55
43 0.52
44 0.46
45 0.39
46 0.37
47 0.29
48 0.21
49 0.2
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.18
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.1
69 0.09
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.12
82 0.14
83 0.16
84 0.22
85 0.28
86 0.3
87 0.3
88 0.31
89 0.31
90 0.29
91 0.31
92 0.24
93 0.19
94 0.16
95 0.16
96 0.16
97 0.15
98 0.13
99 0.1
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.05
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.1
108 0.11
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.2
113 0.25
114 0.28
115 0.27
116 0.32
117 0.27
118 0.27
119 0.27
120 0.24
121 0.23
122 0.19
123 0.2
124 0.19
125 0.19
126 0.17
127 0.18
128 0.17
129 0.14
130 0.21
131 0.21
132 0.18
133 0.21
134 0.21
135 0.23
136 0.24
137 0.24
138 0.17
139 0.14
140 0.12
141 0.1
142 0.1
143 0.14
144 0.13
145 0.15
146 0.18
147 0.17
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.13
152 0.14
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.13
160 0.12
161 0.15
162 0.18
163 0.21
164 0.22
165 0.22
166 0.22
167 0.19
168 0.22
169 0.22
170 0.21
171 0.23
172 0.24
173 0.25
174 0.27
175 0.29
176 0.3
177 0.27
178 0.24
179 0.21
180 0.22
181 0.22
182 0.21
183 0.2
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.15
188 0.13
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.12
194 0.15
195 0.17
196 0.18
197 0.18
198 0.17
199 0.2
200 0.24
201 0.23
202 0.22
203 0.22
204 0.22
205 0.22
206 0.25
207 0.24
208 0.24
209 0.27
210 0.32
211 0.29
212 0.29
213 0.3
214 0.28
215 0.31
216 0.34
217 0.33
218 0.29
219 0.29
220 0.27
221 0.31
222 0.34
223 0.33
224 0.36
225 0.39
226 0.44
227 0.51
228 0.52
229 0.52
230 0.53
231 0.55
232 0.57
233 0.62
234 0.63
235 0.56
236 0.57
237 0.52
238 0.47
239 0.41
240 0.31
241 0.23
242 0.23
243 0.27
244 0.27
245 0.27
246 0.27
247 0.25
248 0.28
249 0.34
250 0.29
251 0.32
252 0.37
253 0.45
254 0.52
255 0.6
256 0.64
257 0.66
258 0.7
259 0.65
260 0.62
261 0.56
262 0.55
263 0.54
264 0.46
265 0.4
266 0.35
267 0.34
268 0.35
269 0.36
270 0.4
271 0.44
272 0.52
273 0.56