Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5E049

Protein Details
Accession C5E049    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-259INNVTPSSKKPRKPRQPKRTPSGLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-253KKPRKPRQPKR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027705  Flotillin_fam  
IPR020998  Med3  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG zro:ZYRO0G09768g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11593  Med3  
Amino Acid Sequences MSGGEELSEILSINMKLDELESKLSSGDSSKESVMGAINETKGSILPMRLKFNDFLQTMSSIDKMQEVSPDEKFLLIKSKLLELTNSMQQVSEEFTKLQPLFDTVPEYAERYGNKRYLPLETLRSATNGNGNDFSAQQLNQPNQQIPQSQQSVMESQQAQPLQQQQLQQQLQQQQQLQLQQQQLQQFQLQQQQQQQQINGNSAPSVNSVQSRKKSKSNAGTPGSNVNTPSGGVTINNVTPSSKKPRKPRQPKRTPSGLNMGMGIGSVPTPIMSSSNFTPQNVQSPAIGGGNVMSASNGNINGNGGNSVQSVNGVPPTSTMNTPMNNVMSPLGNTPSGFGLSQSHPPQPLPQQLTQQLSQQLTQQRQQQVQQQRHQQAQAQAQAQAQAQAQAQAQQQQQQQQQAQQNPSQPQYGMAPHSGQLPQAQINMNTITPANILSMNMAADNQQNWGSRGGKDFDPLDINNLDFGNLNMDFI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.14
6 0.13
7 0.17
8 0.17
9 0.17
10 0.17
11 0.18
12 0.17
13 0.16
14 0.17
15 0.15
16 0.17
17 0.17
18 0.18
19 0.18
20 0.18
21 0.18
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.16
29 0.14
30 0.15
31 0.15
32 0.16
33 0.24
34 0.29
35 0.36
36 0.38
37 0.41
38 0.4
39 0.41
40 0.44
41 0.36
42 0.33
43 0.28
44 0.27
45 0.24
46 0.24
47 0.22
48 0.14
49 0.14
50 0.15
51 0.14
52 0.14
53 0.17
54 0.2
55 0.22
56 0.23
57 0.25
58 0.23
59 0.23
60 0.22
61 0.19
62 0.24
63 0.21
64 0.23
65 0.22
66 0.26
67 0.28
68 0.28
69 0.28
70 0.23
71 0.26
72 0.29
73 0.28
74 0.24
75 0.21
76 0.2
77 0.2
78 0.2
79 0.18
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.22
84 0.22
85 0.22
86 0.18
87 0.19
88 0.19
89 0.2
90 0.23
91 0.17
92 0.19
93 0.19
94 0.2
95 0.18
96 0.19
97 0.2
98 0.2
99 0.26
100 0.27
101 0.27
102 0.29
103 0.3
104 0.31
105 0.33
106 0.34
107 0.33
108 0.31
109 0.32
110 0.29
111 0.28
112 0.25
113 0.22
114 0.23
115 0.19
116 0.19
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.17
121 0.18
122 0.14
123 0.13
124 0.15
125 0.19
126 0.21
127 0.24
128 0.27
129 0.27
130 0.26
131 0.29
132 0.27
133 0.25
134 0.29
135 0.28
136 0.26
137 0.26
138 0.25
139 0.25
140 0.23
141 0.25
142 0.19
143 0.17
144 0.21
145 0.2
146 0.19
147 0.2
148 0.25
149 0.23
150 0.25
151 0.27
152 0.26
153 0.35
154 0.36
155 0.35
156 0.35
157 0.38
158 0.38
159 0.4
160 0.38
161 0.33
162 0.35
163 0.36
164 0.33
165 0.32
166 0.31
167 0.31
168 0.33
169 0.32
170 0.31
171 0.28
172 0.27
173 0.23
174 0.25
175 0.28
176 0.26
177 0.27
178 0.32
179 0.36
180 0.4
181 0.4
182 0.38
183 0.36
184 0.36
185 0.34
186 0.28
187 0.22
188 0.17
189 0.15
190 0.14
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.12
195 0.16
196 0.21
197 0.28
198 0.34
199 0.36
200 0.41
201 0.46
202 0.51
203 0.57
204 0.58
205 0.61
206 0.57
207 0.55
208 0.5
209 0.49
210 0.42
211 0.33
212 0.26
213 0.18
214 0.14
215 0.13
216 0.12
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.09
227 0.13
228 0.22
229 0.29
230 0.35
231 0.45
232 0.56
233 0.67
234 0.77
235 0.85
236 0.86
237 0.9
238 0.92
239 0.89
240 0.88
241 0.8
242 0.72
243 0.68
244 0.59
245 0.48
246 0.39
247 0.31
248 0.21
249 0.17
250 0.13
251 0.05
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.05
260 0.07
261 0.09
262 0.16
263 0.17
264 0.17
265 0.2
266 0.2
267 0.26
268 0.25
269 0.24
270 0.17
271 0.18
272 0.19
273 0.16
274 0.15
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.16
307 0.17
308 0.18
309 0.2
310 0.21
311 0.19
312 0.17
313 0.18
314 0.15
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.1
325 0.1
326 0.12
327 0.14
328 0.21
329 0.23
330 0.25
331 0.25
332 0.25
333 0.29
334 0.32
335 0.38
336 0.37
337 0.37
338 0.41
339 0.45
340 0.49
341 0.45
342 0.43
343 0.4
344 0.36
345 0.33
346 0.32
347 0.33
348 0.34
349 0.37
350 0.41
351 0.42
352 0.44
353 0.47
354 0.51
355 0.54
356 0.59
357 0.62
358 0.65
359 0.65
360 0.66
361 0.65
362 0.61
363 0.58
364 0.55
365 0.54
366 0.46
367 0.42
368 0.38
369 0.38
370 0.33
371 0.29
372 0.22
373 0.19
374 0.17
375 0.17
376 0.17
377 0.19
378 0.2
379 0.24
380 0.26
381 0.29
382 0.33
383 0.38
384 0.42
385 0.45
386 0.46
387 0.48
388 0.54
389 0.55
390 0.57
391 0.54
392 0.56
393 0.53
394 0.53
395 0.47
396 0.39
397 0.34
398 0.32
399 0.32
400 0.28
401 0.25
402 0.24
403 0.22
404 0.26
405 0.25
406 0.22
407 0.2
408 0.2
409 0.2
410 0.22
411 0.24
412 0.21
413 0.24
414 0.24
415 0.22
416 0.2
417 0.18
418 0.15
419 0.13
420 0.13
421 0.11
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.1
427 0.1
428 0.09
429 0.1
430 0.12
431 0.12
432 0.13
433 0.17
434 0.18
435 0.2
436 0.25
437 0.26
438 0.26
439 0.31
440 0.32
441 0.3
442 0.32
443 0.32
444 0.3
445 0.33
446 0.3
447 0.3
448 0.27
449 0.26
450 0.24
451 0.23
452 0.2
453 0.15
454 0.15
455 0.15