Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DQL9

Protein Details
Accession C5DQL9    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-154AESVRAPRKRRKTHGSVSGKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-146APRKRRKT
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG zro:ZYRO0B01386g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd21542  SPOC_Bye1p-like  
Amino Acid Sequences MSVRTSGRSNKGHNKYIQRILEEEKGSGNSGGNESDDSVRCPVCRTFDYNYDANEDTHGDMVQCDGCNTWQHIECMSDGKGMDSLLDSDGKYHCERCKPENYQNAKWLTKEQEQNPESNDYDNDNYLSESDSEAESVRAPRKRRKTHGSVSGKSGTEPKGSAGSTTGGSSGDARLRENAQKMLHQLFDKYIIPATVEAKLYALPDDQDDEKDIALEKSQELERELYNVYPDHRNYTERIRTIFSNLKDAKNLSLKAHVIKGQITTSQLVRMSATELANPDLQEFREKIDEQALTQLVVEQPGRPRWVKTHKGEELIENPEENNNGGDLEPDIFTREIVHREETAVKEPSPTPEKSVSPGPPPVRINVKYPELAIELSGTIDYIGSSSELVKNPYREALGDGKLLVEGRLSKAKVLKYLSEMQSTRTFLLYRIRPDENCNSEFKQVYEFLWENEKISGIQIKRSYQKNIYLIPSFGYDHHVIKDIAMAAGEFDREADNPILFLLTVIKPELVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.77
3 0.79
4 0.76
5 0.68
6 0.63
7 0.6
8 0.6
9 0.51
10 0.43
11 0.37
12 0.33
13 0.31
14 0.29
15 0.24
16 0.18
17 0.18
18 0.18
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.2
23 0.2
24 0.2
25 0.22
26 0.23
27 0.22
28 0.25
29 0.26
30 0.27
31 0.3
32 0.33
33 0.35
34 0.41
35 0.46
36 0.45
37 0.43
38 0.42
39 0.4
40 0.34
41 0.3
42 0.25
43 0.2
44 0.18
45 0.17
46 0.12
47 0.11
48 0.12
49 0.13
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.13
54 0.17
55 0.19
56 0.22
57 0.23
58 0.24
59 0.25
60 0.25
61 0.24
62 0.24
63 0.22
64 0.2
65 0.17
66 0.17
67 0.16
68 0.14
69 0.14
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.12
74 0.1
75 0.12
76 0.13
77 0.17
78 0.18
79 0.22
80 0.27
81 0.33
82 0.39
83 0.43
84 0.53
85 0.57
86 0.64
87 0.69
88 0.72
89 0.7
90 0.72
91 0.72
92 0.63
93 0.57
94 0.53
95 0.49
96 0.49
97 0.51
98 0.49
99 0.52
100 0.52
101 0.53
102 0.5
103 0.48
104 0.4
105 0.34
106 0.3
107 0.24
108 0.24
109 0.23
110 0.2
111 0.16
112 0.16
113 0.14
114 0.14
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.14
124 0.2
125 0.25
126 0.31
127 0.4
128 0.5
129 0.6
130 0.67
131 0.73
132 0.75
133 0.79
134 0.84
135 0.84
136 0.76
137 0.72
138 0.68
139 0.59
140 0.5
141 0.45
142 0.37
143 0.29
144 0.27
145 0.22
146 0.2
147 0.19
148 0.19
149 0.15
150 0.14
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.14
162 0.17
163 0.21
164 0.23
165 0.25
166 0.24
167 0.25
168 0.28
169 0.28
170 0.28
171 0.24
172 0.23
173 0.19
174 0.21
175 0.19
176 0.16
177 0.15
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.07
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.11
213 0.12
214 0.11
215 0.12
216 0.15
217 0.16
218 0.18
219 0.19
220 0.21
221 0.22
222 0.29
223 0.32
224 0.3
225 0.31
226 0.29
227 0.28
228 0.31
229 0.35
230 0.27
231 0.31
232 0.32
233 0.31
234 0.3
235 0.3
236 0.29
237 0.28
238 0.28
239 0.2
240 0.21
241 0.21
242 0.21
243 0.23
244 0.22
245 0.18
246 0.17
247 0.18
248 0.15
249 0.15
250 0.15
251 0.14
252 0.11
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.13
265 0.12
266 0.12
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.18
276 0.18
277 0.15
278 0.19
279 0.17
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.12
288 0.14
289 0.18
290 0.18
291 0.19
292 0.26
293 0.35
294 0.42
295 0.45
296 0.52
297 0.52
298 0.55
299 0.55
300 0.5
301 0.45
302 0.4
303 0.34
304 0.24
305 0.21
306 0.18
307 0.17
308 0.14
309 0.11
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.1
322 0.11
323 0.13
324 0.15
325 0.17
326 0.16
327 0.18
328 0.22
329 0.22
330 0.25
331 0.24
332 0.22
333 0.23
334 0.23
335 0.27
336 0.28
337 0.27
338 0.26
339 0.28
340 0.29
341 0.29
342 0.35
343 0.33
344 0.32
345 0.39
346 0.36
347 0.39
348 0.39
349 0.4
350 0.41
351 0.4
352 0.4
353 0.38
354 0.4
355 0.34
356 0.33
357 0.31
358 0.24
359 0.23
360 0.18
361 0.13
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.06
374 0.1
375 0.12
376 0.16
377 0.2
378 0.22
379 0.23
380 0.25
381 0.24
382 0.2
383 0.23
384 0.25
385 0.23
386 0.22
387 0.21
388 0.18
389 0.18
390 0.18
391 0.14
392 0.1
393 0.09
394 0.12
395 0.18
396 0.18
397 0.21
398 0.26
399 0.28
400 0.32
401 0.34
402 0.33
403 0.32
404 0.41
405 0.41
406 0.43
407 0.41
408 0.4
409 0.42
410 0.42
411 0.37
412 0.31
413 0.28
414 0.23
415 0.32
416 0.33
417 0.34
418 0.37
419 0.41
420 0.41
421 0.47
422 0.54
423 0.51
424 0.48
425 0.47
426 0.44
427 0.45
428 0.44
429 0.39
430 0.34
431 0.29
432 0.27
433 0.29
434 0.27
435 0.24
436 0.3
437 0.29
438 0.26
439 0.25
440 0.25
441 0.18
442 0.19
443 0.25
444 0.19
445 0.26
446 0.3
447 0.35
448 0.42
449 0.47
450 0.52
451 0.51
452 0.59
453 0.57
454 0.58
455 0.58
456 0.53
457 0.48
458 0.42
459 0.39
460 0.32
461 0.27
462 0.27
463 0.24
464 0.23
465 0.24
466 0.26
467 0.23
468 0.22
469 0.25
470 0.2
471 0.17
472 0.15
473 0.13
474 0.11
475 0.12
476 0.12
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.09
481 0.13
482 0.14
483 0.13
484 0.13
485 0.14
486 0.13
487 0.12
488 0.12
489 0.12
490 0.11
491 0.13
492 0.14