Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DPB2

Protein Details
Accession C5DPB2    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-50QSNVLKTCTKYKVKNNPKHIYAVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001678  MeTrfase_RsmB/NOP2  
IPR023267  RCMT  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008173  F:RNA methyltransferase activity  
GO:0008757  F:S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity  
KEGG zro:ZYRO0A01892g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01189  Methyltr_RsmB-F  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51686  SAM_MT_RSMB_NOP  
Amino Acid Sequences MDFYRDSTWILEYLEAEEKKGKLSGSLQSNVLKTCTKYKVKNNPKHIYAVVASCWKYRMYLERIMHKSGILKTIPQKKGKPAFSRLTIMLLCHDLLISKQKRIQMGKHPIKDYVLKYKTRLHAELVKLKVKLKVKELSELVDQDDGDDATPVRWIRINPLKCDIPVVVEQLNKKFPHRVDHWDQLSPGSIYYDEYVPNLFGIHPSEKITSHDLYKQGKVIIQDRASCLPAHILNPGKEDVVMDACAAPGNKTTHLAAHIISAAGDSNGGQAQIHAFEKEPARAKVLQKMTSQAGCGSLVKIHVGDFTRLAVPDQFEDVTAALVDPSCSGSGIFGRKSLESSNDSQDQKLQDRLSKLSSFQFQVVKHAMSMPNARKIVYSTCSVHAEENERVVIDLLLDSKVKEWGWQLSPRSEVVPTWPRRGIAEEFEEVFRDDKPKCQLLAESCIRALPREDGGIGFFAVCFQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.23
3 0.24
4 0.27
5 0.26
6 0.27
7 0.28
8 0.25
9 0.21
10 0.25
11 0.31
12 0.34
13 0.37
14 0.38
15 0.4
16 0.42
17 0.4
18 0.38
19 0.34
20 0.29
21 0.35
22 0.4
23 0.45
24 0.51
25 0.61
26 0.69
27 0.77
28 0.84
29 0.86
30 0.86
31 0.81
32 0.78
33 0.68
34 0.62
35 0.54
36 0.46
37 0.39
38 0.36
39 0.34
40 0.29
41 0.3
42 0.25
43 0.24
44 0.25
45 0.3
46 0.29
47 0.37
48 0.41
49 0.5
50 0.54
51 0.56
52 0.53
53 0.46
54 0.45
55 0.39
56 0.39
57 0.3
58 0.32
59 0.37
60 0.47
61 0.53
62 0.55
63 0.57
64 0.61
65 0.69
66 0.73
67 0.72
68 0.7
69 0.7
70 0.67
71 0.67
72 0.57
73 0.53
74 0.44
75 0.36
76 0.3
77 0.24
78 0.19
79 0.14
80 0.13
81 0.09
82 0.1
83 0.2
84 0.21
85 0.23
86 0.27
87 0.31
88 0.38
89 0.43
90 0.48
91 0.49
92 0.57
93 0.63
94 0.66
95 0.65
96 0.6
97 0.58
98 0.57
99 0.51
100 0.51
101 0.47
102 0.43
103 0.44
104 0.51
105 0.54
106 0.54
107 0.51
108 0.45
109 0.46
110 0.5
111 0.54
112 0.51
113 0.49
114 0.45
115 0.45
116 0.47
117 0.45
118 0.43
119 0.41
120 0.43
121 0.4
122 0.45
123 0.44
124 0.4
125 0.37
126 0.34
127 0.28
128 0.23
129 0.21
130 0.15
131 0.14
132 0.11
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.05
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.11
141 0.11
142 0.19
143 0.28
144 0.32
145 0.33
146 0.38
147 0.39
148 0.36
149 0.38
150 0.3
151 0.24
152 0.21
153 0.2
154 0.17
155 0.19
156 0.21
157 0.22
158 0.27
159 0.25
160 0.25
161 0.28
162 0.28
163 0.33
164 0.35
165 0.41
166 0.42
167 0.5
168 0.51
169 0.47
170 0.45
171 0.38
172 0.35
173 0.27
174 0.19
175 0.12
176 0.09
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.16
195 0.18
196 0.17
197 0.17
198 0.2
199 0.24
200 0.25
201 0.26
202 0.25
203 0.22
204 0.23
205 0.23
206 0.23
207 0.23
208 0.22
209 0.23
210 0.23
211 0.24
212 0.23
213 0.21
214 0.17
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.14
219 0.15
220 0.15
221 0.17
222 0.17
223 0.15
224 0.14
225 0.14
226 0.11
227 0.08
228 0.08
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.08
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.14
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.11
264 0.12
265 0.17
266 0.2
267 0.19
268 0.22
269 0.27
270 0.28
271 0.33
272 0.38
273 0.38
274 0.35
275 0.37
276 0.37
277 0.33
278 0.32
279 0.24
280 0.19
281 0.15
282 0.15
283 0.12
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.1
290 0.11
291 0.12
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.13
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.07
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.1
318 0.14
319 0.14
320 0.15
321 0.17
322 0.17
323 0.19
324 0.2
325 0.21
326 0.21
327 0.24
328 0.28
329 0.33
330 0.34
331 0.32
332 0.35
333 0.35
334 0.34
335 0.36
336 0.33
337 0.31
338 0.33
339 0.36
340 0.36
341 0.34
342 0.33
343 0.32
344 0.33
345 0.3
346 0.31
347 0.33
348 0.28
349 0.33
350 0.33
351 0.29
352 0.25
353 0.28
354 0.26
355 0.25
356 0.33
357 0.32
358 0.37
359 0.37
360 0.37
361 0.33
362 0.34
363 0.35
364 0.3
365 0.3
366 0.25
367 0.28
368 0.31
369 0.31
370 0.3
371 0.28
372 0.31
373 0.28
374 0.27
375 0.24
376 0.21
377 0.2
378 0.18
379 0.15
380 0.1
381 0.09
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.1
387 0.13
388 0.13
389 0.15
390 0.16
391 0.22
392 0.27
393 0.34
394 0.38
395 0.38
396 0.41
397 0.39
398 0.38
399 0.32
400 0.27
401 0.29
402 0.35
403 0.36
404 0.4
405 0.41
406 0.4
407 0.41
408 0.46
409 0.41
410 0.37
411 0.37
412 0.34
413 0.34
414 0.33
415 0.33
416 0.29
417 0.25
418 0.21
419 0.21
420 0.19
421 0.24
422 0.3
423 0.34
424 0.35
425 0.37
426 0.41
427 0.41
428 0.5
429 0.49
430 0.44
431 0.39
432 0.41
433 0.38
434 0.34
435 0.31
436 0.25
437 0.22
438 0.22
439 0.22
440 0.21
441 0.22
442 0.21
443 0.18
444 0.14
445 0.11