Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DWH5

Protein Details
Accession C5DWH5    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-56YYRNKGKKQSRFFNRVSKKYHydrophilic
65-90VSPPLNCSKRSEKRRNSKLSRLHAKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-79KRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR017340  U1_snRNP-C  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
KEGG zro:ZYRO0D14894g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MARYYCEYCHSYLTHDTLSVRKSHLIGKNHLRITADYYRNKGKKQSRFFNRVSKKYGKRTEETKVSPPLNCSKRSEKRRNSKLSRLHAKELDQPIQTLDKLYEGSPGYSKVFIDSNRLDIGDLIRVSKLPQRANANAPNSSGSSASTVRARHETFTESLKHASSAPLEPPRVLSSWSNLPRTTFHDPSLPRIVINESRRRTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.28
4 0.28
5 0.29
6 0.27
7 0.25
8 0.24
9 0.25
10 0.31
11 0.37
12 0.39
13 0.45
14 0.52
15 0.59
16 0.57
17 0.58
18 0.51
19 0.45
20 0.46
21 0.47
22 0.45
23 0.4
24 0.43
25 0.52
26 0.54
27 0.56
28 0.58
29 0.58
30 0.6
31 0.66
32 0.72
33 0.72
34 0.76
35 0.78
36 0.8
37 0.8
38 0.76
39 0.74
40 0.73
41 0.72
42 0.74
43 0.78
44 0.73
45 0.68
46 0.67
47 0.67
48 0.66
49 0.62
50 0.57
51 0.56
52 0.52
53 0.48
54 0.46
55 0.48
56 0.44
57 0.42
58 0.42
59 0.45
60 0.52
61 0.62
62 0.69
63 0.7
64 0.76
65 0.83
66 0.88
67 0.85
68 0.85
69 0.83
70 0.82
71 0.82
72 0.75
73 0.7
74 0.62
75 0.57
76 0.55
77 0.5
78 0.44
79 0.34
80 0.3
81 0.26
82 0.25
83 0.22
84 0.15
85 0.11
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.09
98 0.11
99 0.11
100 0.16
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.17
105 0.15
106 0.13
107 0.14
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.14
115 0.19
116 0.18
117 0.23
118 0.28
119 0.32
120 0.38
121 0.43
122 0.43
123 0.38
124 0.37
125 0.33
126 0.28
127 0.26
128 0.2
129 0.14
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.16
134 0.16
135 0.18
136 0.24
137 0.24
138 0.23
139 0.24
140 0.26
141 0.24
142 0.27
143 0.28
144 0.24
145 0.25
146 0.23
147 0.22
148 0.19
149 0.19
150 0.18
151 0.18
152 0.22
153 0.26
154 0.27
155 0.27
156 0.29
157 0.29
158 0.27
159 0.28
160 0.23
161 0.22
162 0.31
163 0.37
164 0.38
165 0.36
166 0.37
167 0.37
168 0.43
169 0.46
170 0.39
171 0.35
172 0.39
173 0.4
174 0.45
175 0.5
176 0.44
177 0.35
178 0.34
179 0.38
180 0.39
181 0.46
182 0.49