Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DVA4

Protein Details
Accession C5DVA4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-256CINVHVLQRPQRNKRTQPTSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13mito 13mito_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021624  Saw1  
Gene Ontology GO:0070336  F:flap-structured DNA binding  
GO:0000736  P:double-strand break repair via single-strand annealing, removal of nonhomologous ends  
KEGG zro:ZYRO0D05126g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11561  Saw1  
Amino Acid Sequences MAPSVALVKVASNTVLPIRIFINRKQLLQNNSKDTVFHAPLLSNNSIVCIKSPSTRIYLSNHDMQNLTNDIETEILLIVHELTSPELMQDVLRKIKIGQSMDWQKDVMPRIFPSETEPLVVSHIQSITRIAKFKYKLHFKHNWELNIFIDNIRALTHIRAYLMFKNDLSIIPPVVGLHSKSKLLLHEQMETEKPPQVLQEDDEPSIPNYDEAAEIQEEQKPELKFKYSPVVSLGECINVHVLQRPQRNKRTQPTSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.16
3 0.15
4 0.15
5 0.17
6 0.23
7 0.27
8 0.29
9 0.38
10 0.38
11 0.41
12 0.47
13 0.52
14 0.54
15 0.59
16 0.63
17 0.58
18 0.59
19 0.56
20 0.48
21 0.45
22 0.44
23 0.37
24 0.31
25 0.25
26 0.23
27 0.25
28 0.31
29 0.28
30 0.21
31 0.18
32 0.19
33 0.19
34 0.18
35 0.17
36 0.14
37 0.15
38 0.18
39 0.22
40 0.22
41 0.25
42 0.27
43 0.28
44 0.29
45 0.35
46 0.35
47 0.39
48 0.38
49 0.35
50 0.33
51 0.31
52 0.3
53 0.24
54 0.21
55 0.13
56 0.13
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.08
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.08
77 0.11
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.15
82 0.18
83 0.23
84 0.22
85 0.2
86 0.26
87 0.34
88 0.35
89 0.35
90 0.32
91 0.27
92 0.3
93 0.32
94 0.24
95 0.18
96 0.17
97 0.21
98 0.21
99 0.2
100 0.2
101 0.21
102 0.19
103 0.18
104 0.18
105 0.14
106 0.15
107 0.15
108 0.11
109 0.08
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.1
114 0.11
115 0.13
116 0.14
117 0.14
118 0.19
119 0.23
120 0.27
121 0.34
122 0.4
123 0.43
124 0.5
125 0.58
126 0.57
127 0.63
128 0.64
129 0.59
130 0.5
131 0.47
132 0.4
133 0.33
134 0.27
135 0.18
136 0.13
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.13
148 0.16
149 0.18
150 0.18
151 0.17
152 0.17
153 0.18
154 0.17
155 0.16
156 0.13
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.17
169 0.18
170 0.22
171 0.26
172 0.24
173 0.27
174 0.27
175 0.29
176 0.29
177 0.29
178 0.26
179 0.23
180 0.22
181 0.18
182 0.19
183 0.18
184 0.18
185 0.18
186 0.23
187 0.22
188 0.23
189 0.23
190 0.23
191 0.21
192 0.21
193 0.19
194 0.13
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.11
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.14
204 0.14
205 0.15
206 0.21
207 0.19
208 0.22
209 0.25
210 0.28
211 0.27
212 0.3
213 0.39
214 0.34
215 0.35
216 0.34
217 0.34
218 0.3
219 0.31
220 0.27
221 0.21
222 0.2
223 0.19
224 0.19
225 0.15
226 0.16
227 0.2
228 0.25
229 0.3
230 0.4
231 0.49
232 0.57
233 0.66
234 0.76
235 0.8
236 0.85