Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DXM6

Protein Details
Accession C5DXM6    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-40VEDLRKKTTTAKKNEPAKSYHydrophilic
144-166STANEKSRGRPKPNNNNNKVKVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-171SRGRPKPNNNNNKVKVEKPQPK
253-256KKKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005818  Histone_H1/H5_H15  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000786  C:nucleosome  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
KEGG zro:ZYRO0F06270g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00538  Linker_histone  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51504  H15  
CDD cd00073  H15  
Amino Acid Sequences MAIKRSTKSNPNKESAQNSEVEDLRKKTTTAKKNEPAKSYKELVVEALISLDDRRGSSRPAVKKYIKEKYPSVGSVAAFDSYFNNAIKKGVELKEFELPKGPSGTLKLVKKIDSSDENGKVEIRRSSRQAKSEEAKKLSTNSNSTANEKSRGRPKPNNNNNKVKVEKPQPKTKSKVVPSPTYKEMIISGILQLNDGKGSSRSALKKFVKDQYKNEIKASSNFDHLFNSALRKGIESGDLHQPKGPSGIVKVLKKKKASTAIKTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.7
3 0.62
4 0.54
5 0.48
6 0.46
7 0.42
8 0.39
9 0.38
10 0.33
11 0.34
12 0.33
13 0.32
14 0.37
15 0.44
16 0.5
17 0.54
18 0.62
19 0.67
20 0.75
21 0.82
22 0.79
23 0.75
24 0.71
25 0.68
26 0.61
27 0.55
28 0.48
29 0.41
30 0.35
31 0.3
32 0.24
33 0.18
34 0.14
35 0.1
36 0.08
37 0.07
38 0.08
39 0.07
40 0.08
41 0.11
42 0.12
43 0.15
44 0.22
45 0.3
46 0.37
47 0.42
48 0.51
49 0.53
50 0.6
51 0.67
52 0.7
53 0.66
54 0.63
55 0.6
56 0.58
57 0.57
58 0.49
59 0.43
60 0.36
61 0.31
62 0.27
63 0.25
64 0.2
65 0.14
66 0.14
67 0.12
68 0.1
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.17
77 0.18
78 0.2
79 0.21
80 0.23
81 0.29
82 0.29
83 0.28
84 0.27
85 0.24
86 0.23
87 0.23
88 0.21
89 0.15
90 0.17
91 0.22
92 0.23
93 0.24
94 0.27
95 0.28
96 0.29
97 0.29
98 0.27
99 0.26
100 0.23
101 0.26
102 0.27
103 0.29
104 0.28
105 0.27
106 0.27
107 0.24
108 0.23
109 0.23
110 0.21
111 0.2
112 0.25
113 0.33
114 0.36
115 0.41
116 0.41
117 0.42
118 0.44
119 0.48
120 0.5
121 0.44
122 0.41
123 0.37
124 0.37
125 0.36
126 0.33
127 0.28
128 0.24
129 0.28
130 0.28
131 0.3
132 0.32
133 0.29
134 0.31
135 0.3
136 0.33
137 0.36
138 0.42
139 0.48
140 0.53
141 0.62
142 0.67
143 0.77
144 0.83
145 0.81
146 0.84
147 0.8
148 0.78
149 0.71
150 0.62
151 0.6
152 0.59
153 0.61
154 0.57
155 0.62
156 0.62
157 0.67
158 0.7
159 0.69
160 0.69
161 0.64
162 0.66
163 0.62
164 0.64
165 0.62
166 0.62
167 0.57
168 0.49
169 0.44
170 0.36
171 0.31
172 0.23
173 0.18
174 0.12
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.07
185 0.09
186 0.1
187 0.17
188 0.22
189 0.25
190 0.35
191 0.39
192 0.45
193 0.5
194 0.57
195 0.61
196 0.62
197 0.65
198 0.66
199 0.7
200 0.66
201 0.62
202 0.58
203 0.5
204 0.49
205 0.51
206 0.42
207 0.39
208 0.38
209 0.36
210 0.33
211 0.31
212 0.28
213 0.21
214 0.24
215 0.19
216 0.21
217 0.2
218 0.2
219 0.21
220 0.2
221 0.23
222 0.2
223 0.22
224 0.3
225 0.32
226 0.32
227 0.33
228 0.32
229 0.28
230 0.3
231 0.27
232 0.19
233 0.19
234 0.27
235 0.32
236 0.4
237 0.49
238 0.56
239 0.62
240 0.65
241 0.67
242 0.68
243 0.71
244 0.73