Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DU46

Protein Details
Accession C5DU46    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-179EDMDDERPDKRQKNNKGRITAPHydrophilic
781-802EVYQYKKSSRRHSRFYRNISGGHydrophilic
1294-1314TLSVEKRKQTAQKAGRRAHFDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.833, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004871  Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG zro:ZYRO0C13816g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03178  CPSF_A  
Amino Acid Sequences MNIYDDILDATVVSLSATGHFTTGKYEELLAVRTDILSVYRVSLKGRLILTHEFKFEGRITDLAVVPQKDSPLDCLLLCTSIAKISVVRYDEASNSIETLSLHYYEDSFKDRSILELAKESTMRVDPGKRCALLFNNDVIALLPLQTTSLNDGEEEDEDMDDERPDKRQKNNKGRITAPSAIFNAKELHQDMNNVIDVTFLRNFTRPTLAVIFENKPVWAGTSQVLPLPVTYMAFTLEVTSNEQSTDIKSTVIATVKELSWDFHTMIPIANGCIIVGSNEMAYIDNTGSLQSIIFLNSYANKNMKKARIVDRSKSKILLHKPTTYNWSVSDQKSETGETLLIMDHQAAFYYIQLEYEGRLLTKFDIINLPIVNDTLKNNSNATCISRLNSTLSGNYVDLFVGFRSGDASVLRLNNLKAAIESRDEHKEITSPPENDIEKFEDEDDLYSEEASDADKEKENKEVVVETVLPFDIEVLSSLRNIAPITSLTPGKICSVDKFVEGLSNPNRNEVSLVATSGNGTGSHLTEIQMSVRPEVQLALKFISITQMWNLKIKNKDKYLITTDSNKNKSDIYLIDKNFALYKEGRFRRDATTVSISMFGSDKRIVQVTTNHLYLYDTNFKRLTTMKFEFEVVHVSVMDPYILITVSRGDIKVYELDAKHKKKLFRVELPDVLREMVITSGVILRSNMCNEFLTGLENSSEEQLLFTFVSADNQIIFFPREHNDRIFQLNGVDQLNEMLYISTYSLPDEVVPDPSIKQVMINKLGNNNKEEYLTILTFGGEVYQYKKSSRRHSRFYRNISGGDLAITGAPDNAYAKGVSSIERIMHYIPEYNGCSVILITGSVPYIIVKEDDSVPRIFKFANIPLVSLTRWGRHSVMCVDDIKNARVYTLDRNNVYYGNKLPLKKLEISDVMEDYMTLTRVTFHERSQMFIVCYAKEIEYSALGEDGEKLVGYQENTPHAKSFKSGILLINPKTWNVIDKREFDDNSLINDARTMLIQLDSRTRRRKEYVIVGVAHVETEDLPPSGSLSVFDITEVVPEPGKPDTNFKLGEVFKENIRGTVSSVCDISGRFLINQSQKVIVRDVQEDNSVVPVAFLDVPVFVTDVKSFGNFLIIGDSMQGFQFIGFDAEPYRMIPLGRSVSKLETVALEFLVNGGDIFFAVTDTSNILHIFKYAPDEPNSLSGQRLVHCTSFNLHSTNTCMVLLPKNEEFSVGEKSLSPVQVVGGQTDGSLFKLVPLREDTYRRLYVLQQQLTEKEVQLGGLNPRMERLSNEYYHLTHAVRPMLEFNVIRRFNTLSVEKRKQTAQKAGRRAHFDIWRDLVNIEFSLRSLCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.07
4 0.09
5 0.09
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.15
10 0.17
11 0.17
12 0.16
13 0.16
14 0.19
15 0.2
16 0.22
17 0.18
18 0.18
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.12
27 0.16
28 0.17
29 0.19
30 0.24
31 0.24
32 0.28
33 0.29
34 0.29
35 0.3
36 0.37
37 0.42
38 0.41
39 0.4
40 0.37
41 0.35
42 0.37
43 0.34
44 0.29
45 0.26
46 0.23
47 0.23
48 0.25
49 0.25
50 0.25
51 0.29
52 0.26
53 0.25
54 0.26
55 0.25
56 0.23
57 0.23
58 0.23
59 0.21
60 0.22
61 0.21
62 0.22
63 0.21
64 0.2
65 0.2
66 0.16
67 0.13
68 0.13
69 0.14
70 0.12
71 0.12
72 0.14
73 0.19
74 0.2
75 0.21
76 0.21
77 0.23
78 0.23
79 0.25
80 0.24
81 0.19
82 0.17
83 0.16
84 0.15
85 0.13
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.16
93 0.19
94 0.21
95 0.2
96 0.19
97 0.21
98 0.21
99 0.22
100 0.25
101 0.25
102 0.22
103 0.27
104 0.28
105 0.29
106 0.29
107 0.27
108 0.25
109 0.24
110 0.24
111 0.23
112 0.3
113 0.31
114 0.38
115 0.44
116 0.41
117 0.4
118 0.43
119 0.44
120 0.42
121 0.41
122 0.36
123 0.31
124 0.3
125 0.29
126 0.24
127 0.19
128 0.13
129 0.1
130 0.08
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.12
144 0.1
145 0.11
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.17
152 0.26
153 0.32
154 0.41
155 0.51
156 0.61
157 0.71
158 0.8
159 0.82
160 0.81
161 0.79
162 0.76
163 0.74
164 0.69
165 0.6
166 0.54
167 0.47
168 0.42
169 0.38
170 0.32
171 0.27
172 0.21
173 0.24
174 0.21
175 0.22
176 0.22
177 0.24
178 0.23
179 0.23
180 0.23
181 0.19
182 0.17
183 0.14
184 0.14
185 0.16
186 0.17
187 0.15
188 0.16
189 0.18
190 0.2
191 0.21
192 0.26
193 0.22
194 0.25
195 0.27
196 0.27
197 0.27
198 0.31
199 0.3
200 0.28
201 0.29
202 0.24
203 0.21
204 0.2
205 0.19
206 0.14
207 0.14
208 0.12
209 0.14
210 0.15
211 0.15
212 0.16
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.14
227 0.15
228 0.14
229 0.14
230 0.15
231 0.13
232 0.14
233 0.17
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.17
239 0.19
240 0.17
241 0.16
242 0.18
243 0.18
244 0.2
245 0.19
246 0.17
247 0.17
248 0.19
249 0.18
250 0.17
251 0.18
252 0.16
253 0.17
254 0.16
255 0.14
256 0.12
257 0.11
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.12
285 0.14
286 0.17
287 0.22
288 0.23
289 0.29
290 0.35
291 0.4
292 0.41
293 0.46
294 0.52
295 0.57
296 0.63
297 0.67
298 0.7
299 0.72
300 0.69
301 0.66
302 0.59
303 0.57
304 0.58
305 0.6
306 0.54
307 0.56
308 0.55
309 0.54
310 0.58
311 0.52
312 0.45
313 0.37
314 0.37
315 0.35
316 0.34
317 0.37
318 0.31
319 0.31
320 0.31
321 0.29
322 0.24
323 0.19
324 0.18
325 0.12
326 0.11
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.13
350 0.12
351 0.12
352 0.14
353 0.15
354 0.18
355 0.17
356 0.17
357 0.13
358 0.13
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.13
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.18
367 0.19
368 0.19
369 0.21
370 0.2
371 0.19
372 0.19
373 0.19
374 0.2
375 0.21
376 0.22
377 0.2
378 0.17
379 0.17
380 0.18
381 0.16
382 0.15
383 0.12
384 0.1
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.1
397 0.11
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.14
402 0.15
403 0.13
404 0.11
405 0.13
406 0.13
407 0.14
408 0.15
409 0.17
410 0.21
411 0.22
412 0.21
413 0.2
414 0.21
415 0.2
416 0.26
417 0.29
418 0.25
419 0.26
420 0.32
421 0.32
422 0.3
423 0.32
424 0.28
425 0.22
426 0.22
427 0.21
428 0.16
429 0.15
430 0.15
431 0.13
432 0.1
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.09
442 0.13
443 0.15
444 0.16
445 0.21
446 0.21
447 0.2
448 0.2
449 0.19
450 0.15
451 0.15
452 0.15
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.09
457 0.08
458 0.08
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.06
465 0.07
466 0.06
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.09
473 0.1
474 0.11
475 0.1
476 0.11
477 0.12
478 0.12
479 0.14
480 0.13
481 0.12
482 0.16
483 0.17
484 0.17
485 0.16
486 0.15
487 0.15
488 0.15
489 0.19
490 0.2
491 0.25
492 0.25
493 0.27
494 0.27
495 0.24
496 0.25
497 0.2
498 0.19
499 0.12
500 0.13
501 0.11
502 0.11
503 0.11
504 0.1
505 0.1
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.09
516 0.12
517 0.12
518 0.12
519 0.12
520 0.12
521 0.11
522 0.12
523 0.13
524 0.11
525 0.12
526 0.12
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.12
531 0.1
532 0.09
533 0.1
534 0.13
535 0.14
536 0.18
537 0.19
538 0.22
539 0.3
540 0.35
541 0.41
542 0.39
543 0.43
544 0.41
545 0.45
546 0.45
547 0.41
548 0.38
549 0.39
550 0.43
551 0.47
552 0.48
553 0.44
554 0.39
555 0.35
556 0.33
557 0.28
558 0.23
559 0.21
560 0.25
561 0.25
562 0.26
563 0.26
564 0.26
565 0.25
566 0.23
567 0.18
568 0.13
569 0.16
570 0.24
571 0.28
572 0.3
573 0.31
574 0.33
575 0.34
576 0.36
577 0.33
578 0.28
579 0.29
580 0.27
581 0.25
582 0.24
583 0.2
584 0.17
585 0.16
586 0.12
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.09
591 0.11
592 0.1
593 0.12
594 0.16
595 0.19
596 0.21
597 0.21
598 0.2
599 0.19
600 0.19
601 0.18
602 0.19
603 0.22
604 0.19
605 0.22
606 0.23
607 0.22
608 0.23
609 0.26
610 0.25
611 0.23
612 0.26
613 0.25
614 0.25
615 0.26
616 0.25
617 0.22
618 0.22
619 0.14
620 0.12
621 0.1
622 0.09
623 0.08
624 0.08
625 0.07
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.04
630 0.03
631 0.03
632 0.04
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.06
638 0.07
639 0.08
640 0.08
641 0.11
642 0.11
643 0.18
644 0.26
645 0.29
646 0.34
647 0.36
648 0.39
649 0.4
650 0.5
651 0.5
652 0.49
653 0.54
654 0.53
655 0.55
656 0.54
657 0.49
658 0.4
659 0.33
660 0.25
661 0.17
662 0.13
663 0.06
664 0.05
665 0.04
666 0.04
667 0.05
668 0.05
669 0.05
670 0.05
671 0.06
672 0.07
673 0.08
674 0.09
675 0.09
676 0.09
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.09
681 0.08
682 0.08
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.07
687 0.07
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.06
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.05
700 0.06
701 0.06
702 0.06
703 0.07
704 0.07
705 0.09
706 0.11
707 0.14
708 0.16
709 0.18
710 0.19
711 0.2
712 0.22
713 0.2
714 0.18
715 0.16
716 0.14
717 0.15
718 0.13
719 0.11
720 0.08
721 0.08
722 0.08
723 0.07
724 0.06
725 0.04
726 0.03
727 0.04
728 0.04
729 0.05
730 0.05
731 0.05
732 0.06
733 0.06
734 0.06
735 0.08
736 0.08
737 0.08
738 0.09
739 0.09
740 0.1
741 0.1
742 0.11
743 0.09
744 0.1
745 0.12
746 0.16
747 0.21
748 0.22
749 0.23
750 0.3
751 0.34
752 0.34
753 0.32
754 0.3
755 0.25
756 0.23
757 0.22
758 0.17
759 0.16
760 0.14
761 0.13
762 0.11
763 0.1
764 0.09
765 0.09
766 0.07
767 0.04
768 0.05
769 0.07
770 0.11
771 0.12
772 0.15
773 0.22
774 0.28
775 0.39
776 0.49
777 0.54
778 0.6
779 0.69
780 0.78
781 0.81
782 0.82
783 0.8
784 0.71
785 0.65
786 0.57
787 0.47
788 0.36
789 0.27
790 0.19
791 0.1
792 0.08
793 0.07
794 0.05
795 0.04
796 0.04
797 0.04
798 0.05
799 0.05
800 0.06
801 0.05
802 0.06
803 0.07
804 0.08
805 0.09
806 0.09
807 0.1
808 0.1
809 0.11
810 0.12
811 0.1
812 0.11
813 0.11
814 0.12
815 0.11
816 0.14
817 0.15
818 0.14
819 0.14
820 0.13
821 0.12
822 0.1
823 0.09
824 0.06
825 0.05
826 0.04
827 0.04
828 0.04
829 0.04
830 0.04
831 0.04
832 0.04
833 0.05
834 0.05
835 0.05
836 0.07
837 0.1
838 0.11
839 0.14
840 0.14
841 0.15
842 0.15
843 0.16
844 0.14
845 0.13
846 0.16
847 0.17
848 0.24
849 0.23
850 0.23
851 0.23
852 0.24
853 0.22
854 0.22
855 0.21
856 0.16
857 0.17
858 0.19
859 0.19
860 0.19
861 0.22
862 0.2
863 0.21
864 0.2
865 0.21
866 0.2
867 0.24
868 0.25
869 0.23
870 0.23
871 0.21
872 0.19
873 0.18
874 0.19
875 0.23
876 0.29
877 0.32
878 0.3
879 0.32
880 0.33
881 0.34
882 0.33
883 0.27
884 0.22
885 0.23
886 0.27
887 0.26
888 0.28
889 0.3
890 0.33
891 0.34
892 0.33
893 0.31
894 0.29
895 0.3
896 0.3
897 0.26
898 0.22
899 0.18
900 0.17
901 0.13
902 0.11
903 0.09
904 0.07
905 0.06
906 0.07
907 0.09
908 0.15
909 0.16
910 0.16
911 0.23
912 0.23
913 0.26
914 0.28
915 0.29
916 0.23
917 0.25
918 0.26
919 0.18
920 0.19
921 0.18
922 0.15
923 0.13
924 0.13
925 0.1
926 0.1
927 0.1
928 0.09
929 0.08
930 0.08
931 0.07
932 0.07
933 0.07
934 0.06
935 0.05
936 0.05
937 0.06
938 0.08
939 0.09
940 0.11
941 0.13
942 0.19
943 0.21
944 0.22
945 0.24
946 0.23
947 0.23
948 0.22
949 0.22
950 0.19
951 0.2
952 0.21
953 0.2
954 0.26
955 0.31
956 0.31
957 0.34
958 0.31
959 0.28
960 0.28
961 0.27
962 0.26
963 0.24
964 0.32
965 0.31
966 0.34
967 0.39
968 0.43
969 0.43
970 0.39
971 0.41
972 0.33
973 0.31
974 0.31
975 0.26
976 0.2
977 0.2
978 0.18
979 0.13
980 0.12
981 0.09
982 0.07
983 0.09
984 0.1
985 0.11
986 0.2
987 0.25
988 0.33
989 0.42
990 0.45
991 0.49
992 0.53
993 0.57
994 0.55
995 0.59
996 0.6
997 0.56
998 0.54
999 0.48
1000 0.44
1001 0.38
1002 0.3
1003 0.2
1004 0.12
1005 0.07
1006 0.07
1007 0.08
1008 0.07
1009 0.07
1010 0.07
1011 0.08
1012 0.08
1013 0.08
1014 0.07
1015 0.08
1016 0.09
1017 0.09
1018 0.09
1019 0.08
1020 0.08
1021 0.09
1022 0.09
1023 0.08
1024 0.08
1025 0.08
1026 0.1
1027 0.11
1028 0.15
1029 0.15
1030 0.21
1031 0.24
1032 0.29
1033 0.3
1034 0.28
1035 0.33
1036 0.31
1037 0.34
1038 0.32
1039 0.29
1040 0.26
1041 0.32
1042 0.32
1043 0.26
1044 0.27
1045 0.24
1046 0.21
1047 0.25
1048 0.25
1049 0.19
1050 0.19
1051 0.17
1052 0.17
1053 0.16
1054 0.16
1055 0.14
1056 0.13
1057 0.12
1058 0.14
1059 0.21
1060 0.26
1061 0.28
1062 0.28
1063 0.31
1064 0.32
1065 0.33
1066 0.35
1067 0.31
1068 0.28
1069 0.3
1070 0.31
1071 0.28
1072 0.27
1073 0.26
1074 0.23
1075 0.21
1076 0.18
1077 0.13
1078 0.1
1079 0.08
1080 0.08
1081 0.08
1082 0.08
1083 0.07
1084 0.06
1085 0.07
1086 0.08
1087 0.08
1088 0.06
1089 0.07
1090 0.08
1091 0.08
1092 0.09
1093 0.09
1094 0.09
1095 0.09
1096 0.11
1097 0.1
1098 0.1
1099 0.11
1100 0.1
1101 0.1
1102 0.1
1103 0.1
1104 0.08
1105 0.08
1106 0.08
1107 0.06
1108 0.06
1109 0.06
1110 0.06
1111 0.07
1112 0.06
1113 0.07
1114 0.08
1115 0.09
1116 0.1
1117 0.1
1118 0.11
1119 0.11
1120 0.11
1121 0.11
1122 0.16
1123 0.22
1124 0.23
1125 0.25
1126 0.26
1127 0.27
1128 0.3
1129 0.29
1130 0.24
1131 0.19
1132 0.19
1133 0.17
1134 0.15
1135 0.12
1136 0.1
1137 0.1
1138 0.09
1139 0.07
1140 0.05
1141 0.04
1142 0.04
1143 0.04
1144 0.04
1145 0.04
1146 0.04
1147 0.04
1148 0.05
1149 0.05
1150 0.06
1151 0.07
1152 0.08
1153 0.09
1154 0.1
1155 0.1
1156 0.1
1157 0.11
1158 0.11
1159 0.17
1160 0.2
1161 0.23
1162 0.26
1163 0.29
1164 0.29
1165 0.33
1166 0.34
1167 0.29
1168 0.26
1169 0.24
1170 0.24
1171 0.23
1172 0.26
1173 0.25
1174 0.24
1175 0.25
1176 0.25
1177 0.26
1178 0.28
1179 0.28
1180 0.26
1181 0.23
1182 0.23
1183 0.27
1184 0.27
1185 0.25
1186 0.21
1187 0.19
1188 0.2
1189 0.25
1190 0.27
1191 0.28
1192 0.28
1193 0.28
1194 0.28
1195 0.29
1196 0.27
1197 0.24
1198 0.28
1199 0.23
1200 0.21
1201 0.19
1202 0.22
1203 0.25
1204 0.25
1205 0.22
1206 0.15
1207 0.16
1208 0.2
1209 0.2
1210 0.18
1211 0.14
1212 0.13
1213 0.12
1214 0.14
1215 0.13
1216 0.09
1217 0.1
1218 0.09
1219 0.12
1220 0.17
1221 0.18
1222 0.2
1223 0.24
1224 0.28
1225 0.33
1226 0.38
1227 0.4
1228 0.43
1229 0.45
1230 0.43
1231 0.4
1232 0.4
1233 0.44
1234 0.48
1235 0.48
1236 0.44
1237 0.44
1238 0.45
1239 0.46
1240 0.44
1241 0.34
1242 0.28
1243 0.23
1244 0.2
1245 0.18
1246 0.21
1247 0.22
1248 0.25
1249 0.26
1250 0.23
1251 0.25
1252 0.27
1253 0.26
1254 0.25
1255 0.29
1256 0.3
1257 0.31
1258 0.35
1259 0.35
1260 0.35
1261 0.37
1262 0.38
1263 0.31
1264 0.27
1265 0.3
1266 0.3
1267 0.28
1268 0.28
1269 0.27
1270 0.25
1271 0.29
1272 0.27
1273 0.27
1274 0.33
1275 0.33
1276 0.33
1277 0.32
1278 0.33
1279 0.3
1280 0.36
1281 0.39
1282 0.38
1283 0.47
1284 0.56
1285 0.57
1286 0.58
1287 0.64
1288 0.66
1289 0.68
1290 0.69
1291 0.69
1292 0.7
1293 0.76
1294 0.81
1295 0.81
1296 0.8
1297 0.75
1298 0.73
1299 0.7
1300 0.65
1301 0.62
1302 0.57
1303 0.52
1304 0.46
1305 0.42
1306 0.35
1307 0.29
1308 0.25
1309 0.19
1310 0.16
1311 0.14