FuNGI

C5DR28

Protein Details

Accession

C5DR28

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-64	IESVKTDQLNKRKRKQIESSSKSQKTK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002125 CMP_dCMP_dom IPR016193 Cytidine_deaminase-like IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR006224 PsdUridine_synth_RluA-like_CS IPR006225 PsdUridine_synth_RluC/D IPR006145 PsdUridine_synth_RsuA/RluA
Gene Ontology	GO:0016814 F:hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis
KEGG	zro:ZYRO0B05082g -
Pfam	View protein in Pfam PF18785 Inv-AAD PF00849 PseudoU_synth_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS51747 CYT_DCMP_DEAMINASES_2 PS01129 PSI_RLU PS50889 S4
CDD	cd02557 PseudoU_synth_ScRIB2

Amino Acid Sequences

MAFRYKNCFRWIRNMSNYVNGSPSPSSHEFEKHLLKEIESVKTDQLNKRKRKQIESSSKSQKTKAQTNELRDENGFKLRVVEVNNKRSRQVDPDYEVVVDGPLRRITPYYFTYQTFCKLRWRDRNLFEVFCDEFRDRDQDYYRKTIAGGSVYLNDEPANLESIIRNGDCIRHKIHRHEPPVTSRPIKVVYEDENLLVIDKPSGIPVHPTGRYRFNTITKILEKKLGRTVHPCNRLDRLTSGLMFMAKTPKGADEMADQLKAREVTKEYVARVVGEFPVGEVVVDNPLKSLEPKLGLNVVCGMDEEGAKHAKTVFRRVSYDGETSIVKCKPLTGRTHQIRVHLQYLGHPIANDPIYSNLKVWGPNLGKNGEADYSQVIEKLNAIGRTESAQSWYHRDSQGELLGNEKCPQCETSLFTDPGPSDLDLWLHAYFYESTELDPTTGDKKWSYCTEFPDWALEPHRKYMKLALEQAAKCGPTTTAFSVGAVLINGTEVISTGYSRELPGNTHAEQCALEKYFSNTGSSELPEDTIIYTTMEPCSFRLSGNDPCVQRIINTNGKIKTVFVGVLEPDTFVKNNSSRSLLQRHGIDYIKIPGYEEKATELATKGHEKTN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.67
3	0.68
4	0.66
5	0.57
6	0.51
7	0.41
8	0.37
9	0.3
10	0.28
11	0.28
12	0.29
13	0.3
14	0.3
15	0.35
16	0.35
17	0.4
18	0.48
19	0.41
20	0.46
21	0.45
22	0.42
23	0.44
24	0.45
25	0.45
26	0.38
27	0.39
28	0.34
29	0.39
30	0.46
31	0.47
32	0.52
33	0.56
34	0.64
35	0.72
36	0.78
37	0.8
38	0.82
39	0.84
40	0.85
41	0.87
42	0.84
43	0.84
44	0.85
45	0.86
46	0.8
47	0.74
48	0.69
49	0.66
50	0.68
51	0.66
52	0.66
53	0.65
54	0.69
55	0.73
56	0.69
57	0.64
58	0.56
59	0.51
60	0.44
61	0.43
62	0.35
63	0.27
64	0.27
65	0.25
66	0.28
67	0.29
68	0.36
69	0.39
70	0.48
71	0.56
72	0.55
73	0.56
74	0.55
75	0.54
76	0.51
77	0.5
78	0.48
79	0.44
80	0.46
81	0.45
82	0.42
83	0.38
84	0.3
85	0.23
86	0.16
87	0.13
88	0.12
89	0.12
90	0.13
91	0.14
92	0.15
93	0.17
94	0.21
95	0.23
96	0.27
97	0.28
98	0.3
99	0.31
100	0.32
101	0.37
102	0.34
103	0.32
104	0.36
105	0.41
106	0.49
107	0.57
108	0.65
109	0.67
110	0.69
111	0.76
112	0.71
113	0.64
114	0.55
115	0.49
116	0.41
117	0.33
118	0.33
119	0.25
120	0.21
121	0.21
122	0.25
123	0.21
124	0.25
125	0.31
126	0.33
127	0.37
128	0.43
129	0.42
130	0.37
131	0.36
132	0.33
133	0.29
134	0.24
135	0.21
136	0.16
137	0.17
138	0.18
139	0.18
140	0.16
141	0.13
142	0.11
143	0.11
144	0.11
145	0.1
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.11
150	0.13
151	0.11
152	0.12
153	0.1
154	0.16
155	0.19
156	0.22
157	0.26
158	0.32
159	0.37
160	0.45
161	0.54
162	0.57
163	0.61
164	0.64
165	0.64
166	0.64
167	0.65
168	0.63
169	0.56
170	0.48
171	0.44
172	0.42
173	0.37
174	0.31
175	0.29
176	0.26
177	0.27
178	0.26
179	0.23
180	0.2
181	0.19
182	0.17
183	0.14
184	0.1
185	0.07
186	0.06
187	0.06
188	0.07
189	0.08
190	0.07
191	0.09
192	0.13
193	0.18
194	0.21
195	0.24
196	0.26
197	0.33
198	0.35
199	0.37
200	0.39
201	0.38
202	0.39
203	0.38
204	0.41
205	0.38
206	0.41
207	0.37
208	0.39
209	0.35
210	0.34
211	0.4
212	0.37
213	0.35
214	0.37
215	0.45
216	0.47
217	0.55
218	0.53
219	0.49
220	0.51
221	0.49
222	0.44
223	0.37
224	0.32
225	0.25
226	0.23
227	0.2
228	0.16
229	0.15
230	0.13
231	0.13
232	0.13
233	0.11
234	0.11
235	0.11
236	0.11
237	0.13
238	0.13
239	0.13
240	0.1
241	0.15
242	0.16
243	0.16
244	0.16
245	0.14
246	0.16
247	0.16
248	0.14
249	0.12
250	0.13
251	0.14
252	0.19
253	0.21
254	0.2
255	0.21
256	0.21
257	0.19
258	0.17
259	0.16
260	0.12
261	0.09
262	0.08
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.05
267	0.04
268	0.04
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.09
277	0.07
278	0.09
279	0.09
280	0.1
281	0.14
282	0.14
283	0.13
284	0.14
285	0.12
286	0.11
287	0.1
288	0.1
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.06
293	0.08
294	0.07
295	0.08
296	0.09
297	0.11
298	0.13
299	0.21
300	0.24
301	0.26
302	0.28
303	0.3
304	0.32
305	0.32
306	0.32
307	0.24
308	0.21
309	0.19
310	0.17
311	0.19
312	0.16
313	0.14
314	0.12
315	0.15
316	0.18
317	0.23
318	0.28
319	0.3
320	0.39
321	0.43
322	0.51
323	0.5
324	0.5
325	0.49
326	0.46
327	0.42
328	0.34
329	0.29
330	0.25
331	0.28
332	0.24
333	0.2
334	0.16
335	0.14
336	0.16
337	0.16
338	0.13
339	0.09
340	0.12
341	0.14
342	0.15
343	0.15
344	0.14
345	0.15
346	0.16
347	0.15
348	0.19
349	0.19
350	0.22
351	0.24
352	0.23
353	0.22
354	0.22
355	0.23
356	0.15
357	0.14
358	0.11
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.09
367	0.12
368	0.11
369	0.12
370	0.11
371	0.12
372	0.14
373	0.15
374	0.13
375	0.13
376	0.15
377	0.16
378	0.21
379	0.23
380	0.26
381	0.26
382	0.26
383	0.25
384	0.25
385	0.28
386	0.25
387	0.23
388	0.21
389	0.21
390	0.21
391	0.23
392	0.2
393	0.16
394	0.16
395	0.17
396	0.16
397	0.17
398	0.2
399	0.22
400	0.27
401	0.28
402	0.26
403	0.28
404	0.25
405	0.25
406	0.23
407	0.17
408	0.12
409	0.11
410	0.12
411	0.1
412	0.12
413	0.11
414	0.09
415	0.08
416	0.09
417	0.09
418	0.1
419	0.12
420	0.1
421	0.1
422	0.12
423	0.12
424	0.1
425	0.1
426	0.11
427	0.12
428	0.13
429	0.15
430	0.15
431	0.16
432	0.21
433	0.26
434	0.31
435	0.31
436	0.36
437	0.4
438	0.4
439	0.4
440	0.39
441	0.34
442	0.3
443	0.32
444	0.32
445	0.28
446	0.33
447	0.38
448	0.34
449	0.35
450	0.39
451	0.42
452	0.42
453	0.46
454	0.44
455	0.48
456	0.47
457	0.48
458	0.43
459	0.35
460	0.29
461	0.25
462	0.2
463	0.13
464	0.18
465	0.17
466	0.19
467	0.19
468	0.19
469	0.19
470	0.18
471	0.16
472	0.12
473	0.1
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.03
480	0.04
481	0.05
482	0.05
483	0.06
484	0.07
485	0.08
486	0.1
487	0.12
488	0.12
489	0.14
490	0.19
491	0.24
492	0.24
493	0.26
494	0.25
495	0.24
496	0.23
497	0.23
498	0.23
499	0.19
500	0.19
501	0.17
502	0.21
503	0.25
504	0.25
505	0.25
506	0.21
507	0.21
508	0.23
509	0.23
510	0.2
511	0.16
512	0.16
513	0.14
514	0.15
515	0.13
516	0.12
517	0.11
518	0.1
519	0.1
520	0.11
521	0.13
522	0.14
523	0.14
524	0.14
525	0.18
526	0.18
527	0.18
528	0.21
529	0.24
530	0.3
531	0.35
532	0.41
533	0.36
534	0.38
535	0.39
536	0.35
537	0.31
538	0.31
539	0.33
540	0.35
541	0.39
542	0.44
543	0.44
544	0.46
545	0.45
546	0.39
547	0.33
548	0.27
549	0.23
550	0.16
551	0.17
552	0.16
553	0.18
554	0.17
555	0.16
556	0.15
557	0.17
558	0.16
559	0.15
560	0.21
561	0.22
562	0.27
563	0.29
564	0.33
565	0.35
566	0.42
567	0.49
568	0.46
569	0.48
570	0.48
571	0.46
572	0.47
573	0.45
574	0.39
575	0.35
576	0.37
577	0.34
578	0.3
579	0.3
580	0.29
581	0.31
582	0.32
583	0.29
584	0.26
585	0.24
586	0.26
587	0.26
588	0.23
589	0.22
590	0.24
591	0.3

C5DR28

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer