Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DV46

Protein Details
Accession C5DV46    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-82LFSVDPKRKIPRRKDGKEGVLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-76KRKIPRRKD
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.333, cyto 9.5, mito_nucl 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013966  Spc34  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0042729  C:DASH complex  
GO:0005876  C:spindle microtubule  
GO:0008608  P:attachment of spindle microtubules to kinetochore  
GO:0051301  P:cell division  
KEGG zro:ZYRO0D03806g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08657  DASH_Spc34  
Amino Acid Sequences MSETLDVCLEEITKSIDSINTLYFKPPGIFHNAVVHDGRGQSYSSIITKLIRDCNPREELSLFSVDPKRKIPRRKDGKEGVLDYLAERDINLKRNRRIGLPEEKPVIHVPKEFYLKQHNQVLAAKRQKTGALFFDLDTNSVAAAGSDPGIFELLDAKLDDPQITKLLYALRNGSVTFEGTPEGTQRSTMFVEDFSADLLLKVLEEVSNQWPLSEYKETYLKYLTNYQDLETEIQLIKKELKLQEDQLQAQLQFQPSSSHVVGKLIEKEQSEVELLEQEIARMEQELE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.13
4 0.14
5 0.16
6 0.19
7 0.18
8 0.19
9 0.21
10 0.21
11 0.21
12 0.21
13 0.21
14 0.2
15 0.26
16 0.27
17 0.27
18 0.34
19 0.33
20 0.35
21 0.34
22 0.31
23 0.25
24 0.23
25 0.22
26 0.15
27 0.15
28 0.12
29 0.13
30 0.14
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.15
35 0.18
36 0.22
37 0.28
38 0.31
39 0.36
40 0.39
41 0.45
42 0.47
43 0.45
44 0.43
45 0.37
46 0.34
47 0.31
48 0.3
49 0.23
50 0.24
51 0.3
52 0.29
53 0.31
54 0.35
55 0.41
56 0.47
57 0.57
58 0.61
59 0.66
60 0.74
61 0.78
62 0.82
63 0.8
64 0.8
65 0.77
66 0.69
67 0.6
68 0.5
69 0.44
70 0.34
71 0.27
72 0.19
73 0.11
74 0.09
75 0.11
76 0.13
77 0.21
78 0.28
79 0.35
80 0.39
81 0.46
82 0.47
83 0.46
84 0.49
85 0.47
86 0.51
87 0.47
88 0.47
89 0.44
90 0.42
91 0.41
92 0.38
93 0.35
94 0.26
95 0.24
96 0.22
97 0.24
98 0.29
99 0.27
100 0.27
101 0.33
102 0.35
103 0.38
104 0.41
105 0.36
106 0.34
107 0.38
108 0.39
109 0.38
110 0.42
111 0.39
112 0.34
113 0.35
114 0.34
115 0.3
116 0.29
117 0.23
118 0.19
119 0.18
120 0.17
121 0.19
122 0.17
123 0.17
124 0.14
125 0.12
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.03
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.07
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.12
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.07
193 0.1
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.16
199 0.21
200 0.22
201 0.2
202 0.2
203 0.26
204 0.26
205 0.27
206 0.29
207 0.25
208 0.24
209 0.31
210 0.3
211 0.29
212 0.29
213 0.28
214 0.27
215 0.28
216 0.27
217 0.19
218 0.2
219 0.15
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.17
224 0.18
225 0.24
226 0.25
227 0.28
228 0.31
229 0.35
230 0.42
231 0.44
232 0.43
233 0.4
234 0.4
235 0.35
236 0.33
237 0.32
238 0.26
239 0.21
240 0.21
241 0.2
242 0.18
243 0.25
244 0.24
245 0.23
246 0.21
247 0.23
248 0.25
249 0.26
250 0.3
251 0.26
252 0.29
253 0.27
254 0.28
255 0.26
256 0.27
257 0.23
258 0.18
259 0.17
260 0.15
261 0.15
262 0.16
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.12