FuNGI

G4UA57

Protein Details

Accession

G4UA57

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1202-1221	AMGIKLKYKVDKKDEIRRGQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 10.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007120 DNA-dir_RNAP_su2_dom IPR037033 DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf IPR007121 RNA_pol_bsu_CS IPR007644 RNA_pol_bsu_protrusion IPR007642 RNA_pol_Rpb2_2 IPR037034 RNA_pol_Rpb2_2_sf IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3 IPR007641 RNA_pol_Rpb2_7 IPR014724 RNA_pol_RPB2_OB-fold IPR009674 Rpa2_dom_4
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06883 RNA_pol_Rpa2_4 PF04563 RNA_pol_Rpb2_1 PF04561 RNA_pol_Rpb2_2 PF04565 RNA_pol_Rpb2_3 PF00562 RNA_pol_Rpb2_6 PF04560 RNA_pol_Rpb2_7
PROSITE	View protein in PROSITE PS01166 RNA_POL_BETA
CDD	cd00653 RNA_pol_B_RPB2

Amino Acid Sequences

MAPQQQQPTSQDWDVKFNQVRREKLFRDPPTDRTAYPALQAAVDPHIESFNALFRDDGKPSLLDHALAEIGTKTFLDGDERADPQGKNKLTIRYKSIELQKSQVPPTNRWAKNREIFPAECRERHVSYRGKLSATFEYRINDGEPHEFVRELGQMPIMVKSNKCHLQNNSPAQLVARKEESEELGGYFIVNGIEKLIRMLLLNRRNFPLAIVRPSFQNRGASYTPYGIIMRSVRPDETSQTNVLHYLSDGNVTFRFSWRKNEYLIPVMMIMKALVETNDREIFEGLVGPPQSKGVANTFLTDRVELLLRTYKKYGLYSKTQTRAYLGQKFRVVLGVPDTMSDYEVGTEFLRKIVLVHLGCQDVTEQQDADKFNMLLFMCRKLYALVAGDCAVDNPDAVQNQEILLGGFLYGQIIKERLEELLTVSFRASLRDYLRRNPTVSFQSDTFLKDFPIAIFRRANENIGQSLEYFLSTGNLVSPSGLDLQQVSGFTVVAEKLNFLRFISHFRMVHRGSFFAQLKTTTVRKLLPESWGFLCPVHTPDGSPCGLLNHLAHKCKIMTESVDASTIPRLAFELGVVNISSAATSESVVVMLDGRIVGWCTPEECKSIAETLRYWKVNGENGVPLQLEIGYVPPSNGGSYPGLYMSSQPARMVRPVKYLPLQKEDFVGPQEQPYMSIACTEQEVIPGDSTHVEFDPTNILSILANMTPFSDFNQSPRNMYQCQMGKQTMGTPATALAHRTDNKMYRLQTGQTPVVRAPLHNTYGFDNFPNGMNAVVAVISYTGYDMDDAMILNKSAHERGFGHGSIYKTKKVSLKDDSRTRSAKSIVKMFGFAPNSTIRESTRDMLDNDGLPRVGRLLREGDVICAWHTVSADYNGQLVNRDGVTHYERYKDSEDAFVEEVRVIGADNGTEPLQTVSIKLRIPRSPVIGDKFSSRHGQKGVLSQKWPATDMPFSETGIQPDVIINPHAFPSRMTIGMFVESLAGKAGALHGLAQDSTPFKFDEQNTAGDYFGHQLMKAGYNYHGNEPLYSGITGEEFQADIYIGVVYYQRLRHMVNDKYQVRTTGPVVPTTGQPIKGRKKGGGIRVGEMERDALLAHGTSFLLQDRLLNCSDYSKSWMCRQCGSFLSTQPTVSPFIGKRKAVSTVRCRNCAVRLDDMEDVDLMQIDGEIWEDGSGTQWIGGENTTIVAVPGALKYLDVELAAMGIKLKYKVDKKDEIRRGQLVGKKAGDLMLTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.5
3	0.52
4	0.5
5	0.56
6	0.57
7	0.63
8	0.63
9	0.7
10	0.64
11	0.67
12	0.73
13	0.7
14	0.72
15	0.69
16	0.67
17	0.66
18	0.66
19	0.55
20	0.51
21	0.49
22	0.4
23	0.38
24	0.36
25	0.28
26	0.25
27	0.25
28	0.21
29	0.19
30	0.18
31	0.17
32	0.13
33	0.13
34	0.13
35	0.13
36	0.12
37	0.15
38	0.16
39	0.16
40	0.15
41	0.17
42	0.22
43	0.23
44	0.24
45	0.2
46	0.2
47	0.21
48	0.26
49	0.24
50	0.2
51	0.19
52	0.19
53	0.17
54	0.16
55	0.15
56	0.1
57	0.1
58	0.09
59	0.09
60	0.08
61	0.08
62	0.09
63	0.12
64	0.12
65	0.17
66	0.21
67	0.22
68	0.24
69	0.29
70	0.28
71	0.3
72	0.39
73	0.36
74	0.37
75	0.41
76	0.48
77	0.52
78	0.58
79	0.58
80	0.54
81	0.56
82	0.58
83	0.62
84	0.6
85	0.55
86	0.53
87	0.53
88	0.54
89	0.56
90	0.54
91	0.49
92	0.45
93	0.52
94	0.59
95	0.58
96	0.59
97	0.59
98	0.62
99	0.66
100	0.67
101	0.64
102	0.6
103	0.57
104	0.54
105	0.6
106	0.56
107	0.49
108	0.5
109	0.49
110	0.46
111	0.49
112	0.52
113	0.5
114	0.49
115	0.57
116	0.54
117	0.5
118	0.49
119	0.49
120	0.5
121	0.46
122	0.43
123	0.36
124	0.35
125	0.34
126	0.33
127	0.3
128	0.23
129	0.21
130	0.22
131	0.22
132	0.22
133	0.23
134	0.21
135	0.2
136	0.2
137	0.2
138	0.18
139	0.17
140	0.15
141	0.15
142	0.15
143	0.18
144	0.19
145	0.19
146	0.2
147	0.22
148	0.3
149	0.35
150	0.39
151	0.44
152	0.46
153	0.53
154	0.62
155	0.67
156	0.63
157	0.57
158	0.53
159	0.47
160	0.46
161	0.38
162	0.33
163	0.28
164	0.23
165	0.24
166	0.27
167	0.27
168	0.24
169	0.22
170	0.18
171	0.15
172	0.15
173	0.13
174	0.1
175	0.09
176	0.07
177	0.06
178	0.06
179	0.07
180	0.08
181	0.08
182	0.09
183	0.08
184	0.08
185	0.09
186	0.14
187	0.22
188	0.29
189	0.35
190	0.37
191	0.39
192	0.41
193	0.4
194	0.37
195	0.37
196	0.34
197	0.36
198	0.36
199	0.34
200	0.38
201	0.42
202	0.44
203	0.37
204	0.38
205	0.32
206	0.36
207	0.37
208	0.35
209	0.33
210	0.32
211	0.29
212	0.24
213	0.24
214	0.17
215	0.19
216	0.18
217	0.18
218	0.2
219	0.22
220	0.21
221	0.23
222	0.25
223	0.26
224	0.29
225	0.29
226	0.28
227	0.27
228	0.27
229	0.25
230	0.23
231	0.19
232	0.14
233	0.13
234	0.1
235	0.12
236	0.11
237	0.13
238	0.13
239	0.15
240	0.16
241	0.18
242	0.25
243	0.24
244	0.34
245	0.37
246	0.39
247	0.4
248	0.45
249	0.45
250	0.43
251	0.41
252	0.32
253	0.28
254	0.26
255	0.23
256	0.17
257	0.13
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.08
263	0.09
264	0.13
265	0.16
266	0.16
267	0.17
268	0.17
269	0.17
270	0.15
271	0.15
272	0.11
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.11
277	0.12
278	0.13
279	0.12
280	0.13
281	0.13
282	0.18
283	0.18
284	0.2
285	0.2
286	0.22
287	0.22
288	0.2
289	0.17
290	0.13
291	0.14
292	0.11
293	0.13
294	0.19
295	0.2
296	0.23
297	0.24
298	0.26
299	0.27
300	0.32
301	0.36
302	0.34
303	0.41
304	0.46
305	0.52
306	0.56
307	0.55
308	0.51
309	0.48
310	0.49
311	0.48
312	0.49
313	0.45
314	0.44
315	0.44
316	0.44
317	0.41
318	0.36
319	0.29
320	0.21
321	0.2
322	0.17
323	0.14
324	0.14
325	0.15
326	0.13
327	0.13
328	0.12
329	0.09
330	0.07
331	0.07
332	0.08
333	0.07
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.16
342	0.15
343	0.17
344	0.19
345	0.19
346	0.19
347	0.19
348	0.17
349	0.12
350	0.13
351	0.12
352	0.1
353	0.1
354	0.14
355	0.14
356	0.15
357	0.16
358	0.14
359	0.13
360	0.17
361	0.16
362	0.17
363	0.17
364	0.2
365	0.18
366	0.18
367	0.19
368	0.15
369	0.16
370	0.14
371	0.15
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.12
376	0.11
377	0.11
378	0.1
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.09
386	0.08
387	0.08
388	0.09
389	0.08
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.05
400	0.06
401	0.07
402	0.07
403	0.08
404	0.08
405	0.09
406	0.08
407	0.09
408	0.13
409	0.13
410	0.12
411	0.12
412	0.14
413	0.13
414	0.15
415	0.15
416	0.15
417	0.19
418	0.27
419	0.3
420	0.35
421	0.43
422	0.44
423	0.44
424	0.41
425	0.41
426	0.39
427	0.39
428	0.34
429	0.26
430	0.25
431	0.25
432	0.26
433	0.22
434	0.17
435	0.14
436	0.12
437	0.12
438	0.11
439	0.17
440	0.16
441	0.18
442	0.2
443	0.2
444	0.26
445	0.26
446	0.28
447	0.23
448	0.24
449	0.21
450	0.2
451	0.2
452	0.13
453	0.14
454	0.12
455	0.1
456	0.08
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.05
462	0.06
463	0.06
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.06
471	0.07
472	0.08
473	0.08
474	0.07
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.08
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.11
488	0.11
489	0.17
490	0.21
491	0.25
492	0.25
493	0.26
494	0.34
495	0.32
496	0.35
497	0.3
498	0.27
499	0.23
500	0.3
501	0.3
502	0.23
503	0.23
504	0.2
505	0.2
506	0.22
507	0.22
508	0.16
509	0.17
510	0.18
511	0.18
512	0.22
513	0.23
514	0.24
515	0.24
516	0.25
517	0.24
518	0.24
519	0.23
520	0.18
521	0.18
522	0.14
523	0.14
524	0.14
525	0.12
526	0.11
527	0.12
528	0.15
529	0.14
530	0.13
531	0.12
532	0.1
533	0.1
534	0.11
535	0.11
536	0.14
537	0.18
538	0.19
539	0.2
540	0.2
541	0.2
542	0.2
543	0.2
544	0.14
545	0.12
546	0.13
547	0.15
548	0.14
549	0.14
550	0.13
551	0.13
552	0.12
553	0.12
554	0.09
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.07
559	0.06
560	0.07
561	0.05
562	0.06
563	0.06
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.04
568	0.03
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.03
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.05
588	0.07
589	0.09
590	0.1
591	0.1
592	0.11
593	0.11
594	0.14
595	0.14
596	0.13
597	0.13
598	0.16
599	0.21
600	0.21
601	0.2
602	0.2
603	0.21
604	0.22
605	0.23
606	0.2
607	0.16
608	0.16
609	0.17
610	0.15
611	0.12
612	0.09
613	0.07
614	0.06
615	0.04
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.06
622	0.06
623	0.06
624	0.07
625	0.07
626	0.07
627	0.08
628	0.08
629	0.08
630	0.08
631	0.08
632	0.1
633	0.11
634	0.11
635	0.11
636	0.12
637	0.13
638	0.18
639	0.2
640	0.19
641	0.23
642	0.24
643	0.26
644	0.3
645	0.34
646	0.33
647	0.36
648	0.35
649	0.3
650	0.3
651	0.28
652	0.24
653	0.2
654	0.19
655	0.12
656	0.12
657	0.13
658	0.11
659	0.11
660	0.11
661	0.1
662	0.08
663	0.09
664	0.08
665	0.07
666	0.08
667	0.08
668	0.07
669	0.07
670	0.09
671	0.09
672	0.09
673	0.09
674	0.09
675	0.09
676	0.09
677	0.08
678	0.07
679	0.07
680	0.07
681	0.08
682	0.1
683	0.09
684	0.09
685	0.08
686	0.09
687	0.07
688	0.08
689	0.08
690	0.06
691	0.06
692	0.05
693	0.06
694	0.06
695	0.06
696	0.07
697	0.11
698	0.11
699	0.14
700	0.21
701	0.21
702	0.23
703	0.25
704	0.28
705	0.25
706	0.25
707	0.3
708	0.26
709	0.28
710	0.3
711	0.29
712	0.25
713	0.24
714	0.26
715	0.23
716	0.2
717	0.17
718	0.13
719	0.13
720	0.14
721	0.14
722	0.12
723	0.09
724	0.14
725	0.15
726	0.17
727	0.21
728	0.23
729	0.26
730	0.3
731	0.3
732	0.29
733	0.3
734	0.29
735	0.28
736	0.29
737	0.3
738	0.26
739	0.26
740	0.23
741	0.25
742	0.24
743	0.21
744	0.2
745	0.2
746	0.22
747	0.21
748	0.22
749	0.2
750	0.22
751	0.22
752	0.19
753	0.16
754	0.14
755	0.13
756	0.13
757	0.11
758	0.08
759	0.07
760	0.07
761	0.06
762	0.05
763	0.04
764	0.03
765	0.03
766	0.03
767	0.03
768	0.03
769	0.03
770	0.03
771	0.04
772	0.04
773	0.04
774	0.04
775	0.04
776	0.05
777	0.05
778	0.05
779	0.05
780	0.06
781	0.08
782	0.09
783	0.09
784	0.11
785	0.12
786	0.14
787	0.18
788	0.17
789	0.18
790	0.2
791	0.21
792	0.26
793	0.28
794	0.29
795	0.26
796	0.3
797	0.33
798	0.34
799	0.4
800	0.41
801	0.48
802	0.53
803	0.61
804	0.61
805	0.62
806	0.61
807	0.55
808	0.5
809	0.47
810	0.43
811	0.38
812	0.41
813	0.38
814	0.36
815	0.35
816	0.32
817	0.32
818	0.29
819	0.25
820	0.21
821	0.21
822	0.22
823	0.21
824	0.22
825	0.17
826	0.18
827	0.21
828	0.21
829	0.21
830	0.22
831	0.22
832	0.23
833	0.24
834	0.22
835	0.2
836	0.19
837	0.16
838	0.13
839	0.12
840	0.11
841	0.11
842	0.1
843	0.11
844	0.13
845	0.14
846	0.18
847	0.18
848	0.17
849	0.16
850	0.16
851	0.14
852	0.12
853	0.11
854	0.08
855	0.08
856	0.08
857	0.09
858	0.11
859	0.11
860	0.11
861	0.12
862	0.12
863	0.12
864	0.12
865	0.12
866	0.11
867	0.1
868	0.1
869	0.09
870	0.13
871	0.16
872	0.19
873	0.2
874	0.23
875	0.23
876	0.27
877	0.3
878	0.28
879	0.26
880	0.27
881	0.26
882	0.25
883	0.25
884	0.21
885	0.19
886	0.16
887	0.14
888	0.09
889	0.08
890	0.06
891	0.05
892	0.05
893	0.04
894	0.05
895	0.06
896	0.06
897	0.06
898	0.07
899	0.07
900	0.08
901	0.08
902	0.09
903	0.11
904	0.15
905	0.17
906	0.21
907	0.26
908	0.28
909	0.34
910	0.36
911	0.37
912	0.37
913	0.41
914	0.43
915	0.4
916	0.38
917	0.36
918	0.35
919	0.33
920	0.36
921	0.32
922	0.31
923	0.31
924	0.34
925	0.32
926	0.4
927	0.45
928	0.42
929	0.43
930	0.41
931	0.42
932	0.39
933	0.39
934	0.31
935	0.26
936	0.23
937	0.23
938	0.24
939	0.22
940	0.21
941	0.22
942	0.22
943	0.2
944	0.19
945	0.18
946	0.14
947	0.14
948	0.14
949	0.12
950	0.13
951	0.12
952	0.1
953	0.12
954	0.14
955	0.13
956	0.12
957	0.16
958	0.18
959	0.19
960	0.18
961	0.17
962	0.17
963	0.18
964	0.17
965	0.12
966	0.11
967	0.09
968	0.09
969	0.08
970	0.07
971	0.05
972	0.06
973	0.06
974	0.05
975	0.06
976	0.06
977	0.06
978	0.07
979	0.07
980	0.07
981	0.09
982	0.1
983	0.1
984	0.11
985	0.12
986	0.12
987	0.18
988	0.2
989	0.27
990	0.27
991	0.29
992	0.3
993	0.3
994	0.29
995	0.23
996	0.23
997	0.16
998	0.16
999	0.14
1000	0.12
1001	0.12
1002	0.14
1003	0.18
1004	0.18
1005	0.17
1006	0.17
1007	0.23
1008	0.25
1009	0.27
1010	0.3
1011	0.27
1012	0.26
1013	0.26
1014	0.25
1015	0.21
1016	0.18
1017	0.15
1018	0.11
1019	0.11
1020	0.11
1021	0.1
1022	0.09
1023	0.07
1024	0.07
1025	0.07
1026	0.07
1027	0.06
1028	0.06
1029	0.05
1030	0.05
1031	0.05
1032	0.06
1033	0.07
1034	0.11
1035	0.12
1036	0.14
1037	0.17
1038	0.18
1039	0.25
1040	0.32
1041	0.38
1042	0.42
1043	0.51
1044	0.52
1045	0.54
1046	0.55
1047	0.5
1048	0.44
1049	0.41
1050	0.36
1051	0.34
1052	0.32
1053	0.29
1054	0.29
1055	0.28
1056	0.27
1057	0.31
1058	0.32
1059	0.28
1060	0.32
1061	0.4
1062	0.47
1063	0.53
1064	0.55
1065	0.51
1066	0.57
1067	0.6
1068	0.63
1069	0.62
1070	0.55
1071	0.52
1072	0.54
1073	0.52
1074	0.43
1075	0.36
1076	0.28
1077	0.2
1078	0.17
1079	0.14
1080	0.08
1081	0.07
1082	0.07
1083	0.07
1084	0.07
1085	0.07
1086	0.07
1087	0.08
1088	0.09
1089	0.09
1090	0.09
1091	0.13
1092	0.13
1093	0.17
1094	0.17
1095	0.18
1096	0.17
1097	0.2
1098	0.22
1099	0.2
1100	0.26
1101	0.28
1102	0.31
1103	0.38
1104	0.45
1105	0.44
1106	0.5
1107	0.5
1108	0.49
1109	0.48
1110	0.48
1111	0.44
1112	0.41
1113	0.44
1114	0.38
1115	0.36
1116	0.32
1117	0.31
1118	0.3
1119	0.26
1120	0.28
1121	0.25
1122	0.34
1123	0.41
1124	0.41
1125	0.42
1126	0.41
1127	0.5
1128	0.5
1129	0.56
1130	0.57
1131	0.6
1132	0.66
1133	0.68
1134	0.67
1135	0.63
1136	0.62
1137	0.61
1138	0.55
1139	0.52
1140	0.48
1141	0.48
1142	0.47
1143	0.43
1144	0.37
1145	0.29
1146	0.25
1147	0.16
1148	0.13
1149	0.09
1150	0.06
1151	0.05
1152	0.05
1153	0.05
1154	0.05
1155	0.05
1156	0.05
1157	0.05
1158	0.06
1159	0.06
1160	0.07
1161	0.08
1162	0.07
1163	0.08
1164	0.08
1165	0.09
1166	0.09
1167	0.1
1168	0.09
1169	0.09
1170	0.09
1171	0.08
1172	0.08
1173	0.07
1174	0.07
1175	0.07
1176	0.07
1177	0.07
1178	0.08
1179	0.08
1180	0.08
1181	0.09
1182	0.1
1183	0.1
1184	0.09
1185	0.09
1186	0.07
1187	0.08
1188	0.08
1189	0.07
1190	0.07
1191	0.08
1192	0.1
1193	0.12
1194	0.16
1195	0.24
1196	0.32
1197	0.41
1198	0.49
1199	0.58
1200	0.64
1201	0.73
1202	0.8
1203	0.8
1204	0.8
1205	0.74
1206	0.7
1207	0.67
1208	0.64
1209	0.6
1210	0.58
1211	0.51
1212	0.44
1213	0.41
1214	0.39

G4UA57

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer