Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R0Y4

Protein Details
Accession C4R0Y4    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MTEEDSGKKRKRKNEERPQCQFFLVHydrophilic
62-91NSHFVWKHKLAKHIKKCKVQKKEVNLDPWFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-13KKRKRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007871  Methyltransferase_TRM13  
IPR039044  Trm13  
IPR022776  TRM13/UPF0224_CHHC_Znf_dom  
IPR021721  Znf_CCCH-type_TRM13  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0106050  F:tRNA 2'-O-methyltransferase activity  
GO:0002128  P:tRNA nucleoside ribose methylation  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0523  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05206  TRM13  
PF11722  zf-TRM13_CCCH  
PF05253  zf-U11-48K  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51800  ZF_CHHC_U11_48K  
Amino Acid Sequences MTEEDSGKKRKRKNEERPQCQFFLVNKKRNCAMTRKIDQKFCAEHMSLEDANNQRIPCPLDNSHFVWKHKLAKHIKKCKVQKKEVNLDPWFVHDINGKVESQKERSFDEGELSQFLQEFLSSYDKMQFPELETKEYTDSSIMIQQRLDLLTNKKHIIQQSSLIQHLEKNGLLGPKYRYMEFGCGRAELSRYIGQSVFDKDKSYPSFTLIDRTRPRLKMDSKIQKDFQELTKNEHSNVDCQRIKIDIKDLALCRLDSVNDPFIVVSKHLCGVATDLTLQCLENYEKTVSDSKLAGCLIALCCRHCCHYDNLLSGSKKFLSSNFDISEKQFNFLTKICSWATNGKRPEVSDQDGKDHVSGYSLAERKIIGLKARRTIDEARRASITNYTTYLFHYVSEETSLENTCLLLLKKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.9
3 0.92
4 0.93
5 0.9
6 0.81
7 0.72
8 0.67
9 0.62
10 0.62
11 0.61
12 0.61
13 0.58
14 0.61
15 0.64
16 0.65
17 0.64
18 0.62
19 0.61
20 0.62
21 0.68
22 0.72
23 0.74
24 0.73
25 0.71
26 0.7
27 0.65
28 0.58
29 0.54
30 0.45
31 0.39
32 0.35
33 0.38
34 0.31
35 0.28
36 0.31
37 0.27
38 0.29
39 0.32
40 0.29
41 0.23
42 0.26
43 0.3
44 0.26
45 0.3
46 0.32
47 0.33
48 0.38
49 0.41
50 0.47
51 0.48
52 0.46
53 0.47
54 0.48
55 0.53
56 0.53
57 0.59
58 0.6
59 0.66
60 0.75
61 0.79
62 0.82
63 0.83
64 0.89
65 0.89
66 0.89
67 0.89
68 0.87
69 0.86
70 0.88
71 0.84
72 0.83
73 0.74
74 0.67
75 0.57
76 0.5
77 0.44
78 0.33
79 0.28
80 0.22
81 0.22
82 0.22
83 0.23
84 0.2
85 0.18
86 0.23
87 0.26
88 0.28
89 0.3
90 0.29
91 0.3
92 0.33
93 0.34
94 0.29
95 0.28
96 0.24
97 0.22
98 0.21
99 0.19
100 0.16
101 0.13
102 0.13
103 0.1
104 0.08
105 0.07
106 0.08
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.17
111 0.18
112 0.19
113 0.2
114 0.19
115 0.18
116 0.27
117 0.28
118 0.26
119 0.25
120 0.26
121 0.26
122 0.25
123 0.23
124 0.14
125 0.13
126 0.11
127 0.16
128 0.16
129 0.15
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.18
137 0.22
138 0.26
139 0.26
140 0.27
141 0.3
142 0.32
143 0.32
144 0.29
145 0.29
146 0.31
147 0.32
148 0.31
149 0.28
150 0.25
151 0.22
152 0.21
153 0.18
154 0.12
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.15
160 0.16
161 0.2
162 0.22
163 0.21
164 0.22
165 0.22
166 0.28
167 0.26
168 0.26
169 0.21
170 0.2
171 0.2
172 0.19
173 0.18
174 0.11
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.15
182 0.17
183 0.17
184 0.15
185 0.16
186 0.15
187 0.21
188 0.22
189 0.24
190 0.21
191 0.21
192 0.24
193 0.22
194 0.3
195 0.25
196 0.31
197 0.3
198 0.36
199 0.4
200 0.38
201 0.41
202 0.42
203 0.44
204 0.44
205 0.51
206 0.56
207 0.56
208 0.59
209 0.58
210 0.52
211 0.52
212 0.46
213 0.4
214 0.39
215 0.34
216 0.36
217 0.4
218 0.39
219 0.37
220 0.39
221 0.35
222 0.31
223 0.34
224 0.36
225 0.3
226 0.29
227 0.29
228 0.28
229 0.28
230 0.24
231 0.25
232 0.19
233 0.19
234 0.24
235 0.23
236 0.23
237 0.23
238 0.21
239 0.18
240 0.16
241 0.15
242 0.13
243 0.16
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.11
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.08
266 0.1
267 0.11
268 0.1
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.15
273 0.2
274 0.18
275 0.19
276 0.19
277 0.17
278 0.19
279 0.19
280 0.16
281 0.11
282 0.13
283 0.12
284 0.16
285 0.17
286 0.15
287 0.18
288 0.2
289 0.23
290 0.23
291 0.25
292 0.26
293 0.33
294 0.37
295 0.38
296 0.4
297 0.44
298 0.43
299 0.4
300 0.37
301 0.3
302 0.26
303 0.24
304 0.22
305 0.23
306 0.25
307 0.31
308 0.3
309 0.31
310 0.31
311 0.33
312 0.4
313 0.33
314 0.31
315 0.27
316 0.26
317 0.27
318 0.27
319 0.3
320 0.21
321 0.25
322 0.24
323 0.24
324 0.26
325 0.32
326 0.37
327 0.41
328 0.43
329 0.44
330 0.46
331 0.46
332 0.5
333 0.48
334 0.47
335 0.45
336 0.44
337 0.44
338 0.43
339 0.42
340 0.35
341 0.29
342 0.23
343 0.18
344 0.16
345 0.14
346 0.21
347 0.22
348 0.22
349 0.22
350 0.22
351 0.22
352 0.27
353 0.27
354 0.27
355 0.33
356 0.38
357 0.45
358 0.49
359 0.49
360 0.49
361 0.55
362 0.57
363 0.59
364 0.56
365 0.51
366 0.5
367 0.49
368 0.45
369 0.43
370 0.36
371 0.29
372 0.28
373 0.26
374 0.25
375 0.26
376 0.29
377 0.22
378 0.2
379 0.2
380 0.19
381 0.19
382 0.21
383 0.18
384 0.15
385 0.17
386 0.18
387 0.16
388 0.14
389 0.13
390 0.11
391 0.15